Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,002,446 | T→A | 5.9% | V796D (GTC→GAC) | PP_1786 → | glycosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,002,446 | 0 | T | A | 5.9% | 204.5 / 2.7 | 68 | V796D (GTC→GAC) | PP_1786 | glycosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/29); new base A (2/2); total (37/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 |
AACGTATTTTTCCCACCGCAGGCGATTGGTGGTGCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCATTGCG > NC_002947/2002298‑2002592 | aaCGTATTTTTCCCACCGCAGGCGATTGGTGGTGCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGt > 4:244571/1‑149 (MQ=255) aaCGTATTTTTCCCACCGCAGGCGATTGGTGGTGCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGt > 8:211491/1‑149 (MQ=255) cccACCTCAGGCGATTGGTGGTGCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTAt < 3:208368/148‑1 (MQ=255) gtgCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAg < 4:272046/131‑1 (MQ=255) gtgCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAg > 3:272046/1‑131 (MQ=255) tgCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGggtctacaggt < 2:73943/149‑1 (MQ=255) aaCGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGggtctacaggtcta < 4:13606/149‑1 (MQ=255) aCGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTg < 7:161233/131‑1 (MQ=255) aCGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTg > 8:161233/1‑131 (MQ=255) gcgTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGGGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACaa < 7:147670/149‑1 (MQ=255) gtgtCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAAcc > 1:229012/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGAGGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCtgt < 4:198194/148‑1 (MQ=255) cTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGt < 2:93887/149‑1 (MQ=255) tGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCtgctgctga > 5:169499/1‑142 (MQ=255) tGATAACTTATCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGATGATGTTGAGTGCAGAGAAGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGATGCCCGGTCTACAGGTCTACAACACTGTGGCGt > 5:16972/1‑148 (MQ=255) aTAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGa < 7:211491/148‑1 (MQ=255) tAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCAGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAg > 1:13311/1‑148 (MQ=255) aCTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGca < 1:360663/148‑1 (MQ=255) gagTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCGTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCGATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGAGGCGTGAGCACATGGAGTg > 8:127765/1‑149 (MQ=255) agTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTgg > 4:82783/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGACTACAcc > 8:186361/1‑85 (MQ=255) aaGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGACTACAcc < 7:186361/85‑1 (MQ=255) aaGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGACTACAcc > 8:191601/1‑85 (MQ=255) aaGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGACTACAcc < 7:191601/85‑1 (MQ=255) ttACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGAcc > 3:5634/1‑149 (MQ=255) aCGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCt < 2:280101/112‑1 (MQ=255) aCGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCt > 1:280101/1‑112 (MQ=255) aCGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAg > 7:74715/1‑122 (MQ=255) aCGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAg < 8:74715/122‑1 (MQ=255) ccGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCa > 2:45474/1‑146 (MQ=255) ctaGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATTTTGAGTTCAGAGCCGCTCATCAGATTACTGTCTACAACTATGAGGGCTGCCGGGTCTACATGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAgaga < 1:298371/147‑1 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATcc < 7:61942/128‑1 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATcc > 8:61942/1‑128 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGCCCCAGAGATGTCTCg > 8:178035/1‑149 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCg > 2:80098/1‑149 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCg > 7:185493/1‑149 (MQ=255) cTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCg > 6:108978/1‑149 (MQ=255) cGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGcc > 5:7969/1‑149 (MQ=255) tCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGtt < 1:45474/148‑1 (MQ=255) cTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACGTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATc > 4:67778/1‑119 (MQ=255) cTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATc < 3:67778/119‑1 (MQ=255) tgtgTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTcc > 1:210437/1‑148 (MQ=255) tgtgTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTcc > 1:351564/1‑148 (MQ=255) gtgtCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTcc > 8:254284/1‑147 (MQ=255) tgtCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCaa < 8:185493/148‑1 (MQ=255) cTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGt > 8:153079/1‑149 (MQ=255) aCTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCAGATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATAGCCTGTTCCAAGAGTTCCt < 6:16972/149‑1 (MQ=255) ctgctgATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTg < 6:7969/149‑1 (MQ=255) ctgctgATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTg < 2:13311/149‑1 (MQ=255) ctgATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATAAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATACTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCAAAGAGTTCCTGGAg > 5:358464/1‑149 (MQ=255) tgATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCAT‑CTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCt > 2:110335/1‑149 (MQ=255) aGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGaaaaa > 3:69633/1‑149 (MQ=255) aGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGaaaaa > 3:74415/1‑149 (MQ=255) tGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAAACCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAAc > 1:309601/1‑148 (MQ=255) gCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGAttt < 7:178035/149‑1 (MQ=255) cGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGa < 3:244571/149‑1 (MQ=255) gCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTgg > 4:155437/1‑127 (MQ=255) gCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTgg < 3:155437/127‑1 (MQ=255) cTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATc < 4:69633/149‑1 (MQ=255) cTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATc < 4:74415/149‑1 (MQ=255) tcatcaGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGa < 7:316934/146‑1 (MQ=255) tcatcaGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGa > 8:316934/1‑146 (MQ=255) atcaGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTTCAACGCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTACTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCAc > 1:274675/1‑149 (MQ=255) atcaGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAGAACCCGATTTGATCCAc > 4:217828/1‑149 (MQ=255) atcaGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATcc < 5:108978/147‑1 (MQ=255) tGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCa < 2:229012/148‑1 (MQ=255) gACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCaa < 8:60393/106‑1 (MQ=255) gACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCaa > 7:60393/1‑106 (MQ=255) gACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCAtt > 6:86942/1‑149 (MQ=255) cTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCATTGc > 1:342700/1‑149 (MQ=255) tCTACACCTATGAGGGCTGCCGTGTCTACAGGTCTACAACGCTGTGTCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGAAACAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGATTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCATTTCg < 6:358464/147‑1 (MQ=255) | AACGTATTTTTCCCACCGCAGGCGATTGGTGGTGCAACGCGTGTCGTGGCTGATAACTTCTCAGAGTTCAGAAGCGCTTACGCCGAGGACCTCGATGTCTGTGTCTTCACTGCTGATGTTGAGTGCAGAGCCGCTCATCAGATGACTGTCTACACCTATGAGGGCTGCCGGGTCTACAGGTCTACAACCCTGTGGCGTGAGCACATGGATTGGCATCCTAAAGACCCAGAGATGTATCGCCTGTTCCAAGAGTTCCTGGAGCTGGAAAAACCCGATTTGATCCACTTCCATTGCG > NC_002947/2002298‑2002592 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |