| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 188,322 | T→C | 7.1% | L144P (CTT→CCT) ‡ | PP_0165 → | GGDEF domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 188,322 | 0 | T | C | 7.1% | 197.9 / 4.2 | 70 | L144P (CTT→CCT) ‡ | PP_0165 | GGDEF domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/34); new base C (2/3); total (33/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.24e-01 | |||||||||||
GAGCCAGACCCTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTATTGCCCGCCGCGAATTCCT > NC_002947/188177‑188469 | gAGCCAGACCCTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTg < 8:186970/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCTGGTGGTGTGCCGATTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCACGCCGCGCGCGATGAAGTGATCAGCCACCCCATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGc > 8:220471/1‑148 (MQ=255) aCCCTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAgc < 3:64209/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAAGCTTGGCaatgg < 2:79731/149‑4 (MQ=255) ccTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAgcgc < 1:105598/149‑1 (MQ=255) tggtggTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCt > 8:242391/1‑149 (MQ=255) tggtgTGCCGCTTTTGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTGGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGTCTGGCAGCATGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAATCGCCTTgg < 2:112472/149‑1 (MQ=255) gTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGggttggt > 8:251064/1‑149 (MQ=255) tGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCtg < 7:95735/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCtgttgt < 1:167124/149‑1 (MQ=255) cTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTtgtg < 7:251064/149‑1 (MQ=255) gATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAAGCTTGGCaatg < 4:330679/114‑3 (MQ=255) gATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAAGCTTGGCaatg > 3:330679/1‑112 (MQ=255) aTCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGTCAAAGCGCCTTTGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTgtgcg < 7:220471/148‑1 (MQ=255) tCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTgtgcggt > 1:286287/1‑149 (MQ=255) gCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGTCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTgtgcggtgcg > 4:264498/1‑149 (MQ=255) gCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTgg > 4:245948/1‑126 (MQ=255) gCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTgg < 3:245948/126‑1 (MQ=255) cTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGc > 7:147773/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTgtgcggtgc < 7:24629/145‑1 (MQ=255) tCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTgtgcggtgc > 8:24629/1‑145 (MQ=255) tCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGc > 8:268223/1‑148 (MQ=255) cgccgGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAAGCTTGGCaatgg > 7:94432/1‑97 (MQ=255) cgccgGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAAGCTTGGCaatgg < 8:94432/100‑4 (MQ=255) gccgGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGt > 5:290303/1‑149 (MQ=255) gccgGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCACGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGc > 2:86172/1‑94 (MQ=255) cggcgATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCg < 7:242391/149‑1 (MQ=255) cggcgATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCg < 1:142768/149‑1 (MQ=255) gATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGc > 4:81883/1‑131 (MQ=255) gATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGc < 3:81883/131‑1 (MQ=255) gCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCttt > 3:75197/1‑149 (MQ=255) aaTCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCt < 4:52455/99‑1 (MQ=255) aaTCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCt > 3:52455/1‑99 (MQ=255) aTCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCt > 2:36088/1‑149 (MQ=255) aTCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCt < 6:194166/149‑1 (MQ=255) aTCGTCAGTCGGGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCt < 8:147773/149‑1 (MQ=255) gTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGtt > 8:102037/1‑149 (MQ=255) gTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGtt > 1:192894/1‑149 (MQ=255) aGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGTCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTgc < 3:264498/148‑1 (MQ=255) aGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTgcg > 7:165279/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGcgccgc > 5:266064/1‑149 (MQ=255) tggctggcAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGcgccgc > 2:285730/1‑148 (MQ=255) tggcAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGTGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGtt > 3:39494/1‑149 (MQ=255) gcagcaGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGtt < 2:286287/147‑1 (MQ=255) gcagcaGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGa < 5:311652/149‑1 (MQ=255) gcagGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGc < 1:36088/149‑1 (MQ=255) cagGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGcc > 5:279639/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGTGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTg < 4:39494/149‑1 (MQ=255) ccGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTg < 1:285730/149‑1 (MQ=255) gTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTaga < 4:75197/149‑1 (MQ=255) cAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAAt > 8:34642/1‑149 (MQ=255) cACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGcc > 6:116259/1‑78 (MQ=255) cACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGcc < 5:116259/78‑1 (MQ=255) cACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCa < 6:266064/149‑1 (MQ=255) tcccGATGTTCGCCATTGCCATGCTTTGTCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTa < 6:258027/136‑1 (MQ=255) aCCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGTCAGCCTGGCTTGCTTGCTGTAGTGCGGTGCTGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTa > 5:258027/1‑137 (MQ=255) ccGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGc < 2:192894/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTAtt < 6:290303/149‑1 (MQ=255) tCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCACCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATg > 4:66203/1‑125 (MQ=255) tCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCACCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATg < 3:66203/125‑1 (MQ=255) 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aaGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATgg > 1:111028/1‑115 (MQ=255) aaGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTATTGCCCGCCGCGAAtt > 4:138976/1‑149 (MQ=255) gCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTATTGCCCGCCGCGAATTcc < 6:279639/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTATTGCCCGCCGCGAATTCCt < 8:165279/149‑1 (MQ=255) | GAGCCAGACCCTGGTGGTGTGCCGCTTTGGTTCGTGCGCCTGATCGGCCTCGAGGCCGCCGGCGGCGATGCAATCGTCAGTCGTGGCTGGCAGCAGGCCGCGCGCGTTGAAGTGATCAGCCACCCGATGTTCGCCATTGCCAAGCTTTGGCAAAGCGCCTTGGGCAGCCTGGGTTGGTTGCTGTTGTGCGGTGCGGCCAGTGCCGTGCTCGGTGCTTTGCTGTTGCGCCGCCAGTTGAGGCCGCTGGACTACATGGTAGAGCAATCTCACGCTATTGCCCGCCGCGAATTCCT > NC_002947/188177‑188469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |