| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,136,934 | G→C | 5.8% | intergenic (‑184/‑207) | fadE ← / → gstB | medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase/glutathione S‑transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,136,934 | 0 | G | C | 5.8% | 216.2 / 3.9 | 69 | intergenic (‑184/‑207) | fadE/gstB | medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase/glutathione S‑transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base C (2/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
CAGACAGCTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCC > NC_002947/2136788‑2137080 | cAGACAGCTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATtgat < 2:201773/149‑1 (MQ=255)cAGACAGCTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATtgat < 3:151951/149‑1 (MQ=255)cAGACAGCTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTGTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCGCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATtga < 3:219005/148‑1 (MQ=255) cTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCg > 3:176073/1‑149 (MQ=255) cTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCg > 3:170668/1‑149 (MQ=255) aGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTGAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCAGTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑TTTGATGAATGCGGTg > 6:362167/1‑149 (MQ=255) cAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGACG‑CCACCGCATTCATCAAT‑CGGTggcatc < 3:209716/149‑4 (MQ=255) cGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGaa < 3:166098/149‑1 (MQ=255) ggCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAAt < 4:351896/149‑1 (MQ=255) cATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGa > 7:132358/1‑149 (MQ=255) tGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGaa > 3:236863/1‑120 (MQ=255) tGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGaa < 4:236863/120‑1 (MQ=255) aaCAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGt > 8:180624/1‑149 (MQ=255) aGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTtgg > 6:177902/1‑149 (MQ=255) gTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTg < 2:99546/116‑1 (MQ=255) gTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTg > 1:99546/1‑116 (MQ=255) gTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTtggc < 7:152676/149‑1 (MQ=255) gACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAAt < 8:114747/132‑1 (MQ=255) gACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAAt > 7:114747/1‑132 (MQ=255) gACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAAAGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTtggctg > 4:241046/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATGCCCTCCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTtggctggc < 1:279300/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAgg > 6:306605/1‑149 (MQ=255) gTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCGCATTCATCAAT‑CGGTggcatc < 6:317792/111‑4 (MQ=38) gTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCGCATTCATCAAT‑CGGTggcatc > 5:317792/1‑108 (MQ=38) cGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGcc < 2:174225/149‑1 (MQ=255) ggTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCt < 4:170668/149‑1 (MQ=255) ggTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCt < 4:176073/149‑1 (MQ=255) tttCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTgg < 5:74373/149‑1 (MQ=255) tCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGAcc > 2:284614/1‑108 (MQ=255) tCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGAcc < 1:284614/108‑1 (MQ=255) tCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAAc > 6:307952/1‑149 (MQ=255) aTTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAAGCCCTCCTAAAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCTGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGTGGGGTTGGCGGGCAGGCTCGGCCTATGTATTGTTaaaa < 6:143220/146‑1 (MQ=255) aTTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCggggg < 7:136554/111‑1 (MQ=255) aTTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCggggg > 8:136554/1‑111 (MQ=255) gCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTAtgtgt > 7:181107/1‑130 (MQ=255) gCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTAtgtgt < 8:181107/130‑1 (MQ=255) ccTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGaa > 7:261401/1‑149 (MQ=255) tACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGt > 6:231792/1‑100 (MQ=255) cGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGt > 8:320586/1‑149 (MQ=255) cGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGt < 8:261401/149‑1 (MQ=255) cGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGt < 5:307952/149‑1 (MQ=255) gCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATTAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGa > 7:129823/1‑149 (MQ=255) gCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTg > 8:319015/1‑148 (MQ=255) ccTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGAc > 7:327168/1‑149 (MQ=255) tATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCT‑GCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGt > 4:102702/1‑148 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGTCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTg > 3:202546/1‑147 (MQ=255) tAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATTAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACggtg < 8:129823/149‑1 (MQ=255) aCCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACggtggt > 3:306351/1‑148 (MQ=255) aCCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCT‑GCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGa < 3:102702/149‑1 (MQ=255) ccccTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGa < 7:319015/149‑1 (MQ=255) tACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCtgtg > 8:103564/1‑149 (MQ=255) tACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCATATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCtgtg < 7:180624/149‑1 (MQ=255) aCAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTgg > 2:62978/1‑149 (MQ=255) cAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCGTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACggtg < 3:308764/136‑1 (MQ=255) cAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGCCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGAAGTGAAGACggag > 4:308764/1‑134 (MQ=255) ggAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGt < 6:298052/94‑1 (MQ=255) ggAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGt > 5:298052/1‑94 (MQ=255) aaCGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGTCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCggg < 4:202546/149‑1 (MQ=255) aaCGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCa < 2:160109/104‑1 (MQ=255) aaCGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCa > 1:160109/1‑104 (MQ=255) aaCGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCggg < 5:306605/149‑1 (MQ=255) aCGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGc < 3:241046/149‑1 (MQ=255) ccg‑CCACCGCATTCATCAAT‑CGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCcgc > 2:307541/3‑149 (MQ=255) g‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCtg > 5:270136/1‑128 (MQ=255) g‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCtg < 6:270136/128‑1 (MQ=255) cACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGTTCAATCACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTAGGGGTGCGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAag < 5:362167/149‑1 (MQ=255) aCCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGaa > 6:19409/1‑147 (MQ=255) aCCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGaa > 5:92662/1‑147 (MQ=255) ccG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAagag < 5:177902/149‑1 (MQ=255) cG‑ATTGATGAATGCGGGGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCCGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCcgctcccaca < 3:310031/149‑8 (MQ=255) aTTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGTGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGcc > 2:152543/1‑149 (MQ=255) ttGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGccc < 7:103564/149‑1 (MQ=255) | CAGACAGCTTAGACGCAATGCTGTGAACGGCATGTTCAGAACAGTGACAGGGCGTGGCGGTGGGAGTTTCAGCTCATTTGTTCGCCTGTACCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCCTCCTACAACGGAACGTGGCGATG‑CCACCG‑ATTGATGAATGCGGTGGCGGCCGCGACGGTGAATGACCGGGGGGTTGGCTGGCAGGCTCGGCCTATGTGTGGGTAAAACCCACGCAGGAATACCGGTGACGTGAAGACGGTGGTGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCC > NC_002947/2136788‑2137080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |