| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,337,328 | A→G | 6.1% | L245P (CTG→CCG) | ybhD ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,337,328 | 0 | A | G | 6.1% | 240.6 / 4.5 | 82 | L245P (CTG→CCG) | ybhD | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/45); new base G (2/3); total (34/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
CATTTCTGCAGCAGGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCC > NC_002947/2337181‑2337473 | cATTTCTGCAGCAGGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAg < 1:92863/149‑1 (MQ=255) aTTTCTGCAGCAGGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAgg > 6:226805/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCAGGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCGGGCTgg > 8:172611/1‑149 (MQ=255) cagcagGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTTGGCATGGCCAGGCTgg < 8:325477/146‑1 (MQ=255) gcagGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATg < 4:269594/149‑1 (MQ=255) cagGATCGAAACGAATTTCTCCTCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATgg < 5:287259/149‑1 (MQ=255) cagGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATgg < 8:337641/149‑1 (MQ=255) cagGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGACGGCATTGGGCATGGCCAGGCGGGGCATgg < 1:215334/149‑1 (MQ=255) aTCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGa < 1:13605/149‑1 (MQ=255) aTCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGa > 8:164577/1‑149 (MQ=255) gAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGacac > 2:190335/1‑149 (MQ=255) aaCGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGc > 6:133471/1‑149 (MQ=255) aCGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGcc > 6:105927/1‑149 (MQ=255) gAATTTCTCCGCAGCCGGCGGCAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGATCGGCATGGCCGACACGcc > 7:229753/1‑147 (MQ=255) tttCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCg < 5:152653/137‑1 (MQ=255) tttCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCg > 6:152653/1‑137 (MQ=255) ctcCGCTGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCGGGCTGGGCGTGTCGGCCATGCCCAGcctg < 3:16190/148‑3 (MQ=255) ctcCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCg < 1:266975/148‑1 (MQ=255) tcCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGc > 1:146527/1‑149 (MQ=255) cGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCGGGCTGGGCGTGTCGGCCATGCCCAGCCTgg < 7:172611/146‑1 (MQ=39) cGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCt > 2:229209/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGCGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCAAGCCCGGCCTc < 1:103898/149‑1 (MQ=255) ccGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGAc > 1:51547/1‑148 (MQ=255) gCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATg < 7:164577/149‑1 (MQ=255) cGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGcc > 6:44908/1‑123 (MQ=255) cGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGcc < 5:44908/123‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGAc < 5:223214/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGAc < 3:149015/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGGGACTTGCGGCGCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGGGGGCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGAc < 1:166761/149‑1 (MQ=255) gccgcgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTgg < 4:143779/149‑1 (MQ=255) gccgcgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTg > 5:43922/1‑148 (MQ=255) ccgcgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGCCCATGCCCAGCGACGTGGa > 5:33438/1‑149 (MQ=255) ccgcgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGa > 6:289441/1‑149 (MQ=255) ccgcgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGa > 1:263841/1‑149 (MQ=255) cgccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAg < 1:218545/149‑1 (MQ=255) ccgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGgt < 5:105927/149‑1 (MQ=255) cgGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGgtg < 3:11637/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACt > 5:213882/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGCCCCTGCCCAGCGACGTGGACAg > 4:101017/1‑138 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAg < 3:95930/138‑1 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAg > 4:95930/1‑138 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACtt > 8:198015/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACtt > 5:284116/1‑149 (MQ=255) aGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTc < 4:314779/149‑1 (MQ=255) gCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATGAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCg < 6:284116/149‑1 (MQ=255) ccTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa < 5:226805/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCCGCGACGTGGCCAGGTGTTGCACTTCGTAGaa > 8:90797/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAAcc < 1:190335/149‑1 (MQ=255) gggTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTg < 2:345794/149‑1 (MQ=255) ggTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGAcc > 1:357178/1‑103 (MQ=255) ggTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGAcc < 2:357178/103‑1 (MQ=255) ttGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCg > 1:337475/1‑147 (MQ=255) gCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCACCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAgg > 3:350315/1‑149 (MQ=255) ggCTCGAGCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGGGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGGGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGtt < 4:94103/149‑1 (MQ=255) cTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGtt > 6:334934/1‑147 (MQ=255) gATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGcc < 5:289441/149‑1 (MQ=255) gATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGc < 6:213882/148‑1 (MQ=255) aTCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGccc > 8:48879/1‑149 (MQ=255) aCGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGAc < 6:43922/149‑1 (MQ=255) aCGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCAT‑GCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGAc > 3:214994/1‑148 (MQ=255) ggCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCGGGCTGGGCGTGTCGGCCATGCCCAGCCTGGcc < 8:341727/75‑1 (MQ=18) ggCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTAGGCATTGGGCATGGCCGGGCTGGGCGTGTCGGCCATGCCCAGCCTGGcc > 7:341727/1‑75 (MQ=17) gCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATTGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCGAGCGACGTGTACAGGTGTTGCACTTCGTAGAAGCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAAc < 8:229753/149‑1 (MQ=255) gCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAAc > 2:76531/1‑149 (MQ=255) gCACGCTCACCAGCGTGGGGAGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCAGGGCAAGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCAAGCCAAGCGACGTGGACAGGTGATGCACTTAGAAGAACCACTAGGGCCGCAGGTAGGGCCCGGACCAc > 8:227186/1‑149 (MQ=255) gCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCAt > 4:133444/1‑149 (MQ=255) gCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCAt < 7:169040/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTTGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTcc < 1:230820/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa < 6:71560/105‑1 (MQ=255) cAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCca < 1:76531/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCca < 8:325258/149‑1 (MQ=255) gCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGa < 1:320824/133‑1 (MQ=255) gCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGa > 2:320824/1‑133 (MQ=255) gCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACCATGCGTTGTccggg < 5:334934/149‑4 (MQ=255) gtCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGt < 7:253358/149‑1 (MQ=255) 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ggCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCCGCCTCGACCATGCCCACCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGCACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCACCAGAATCCGGTTGCCACTCAggcggc > 6:313954/1‑149 (MQ=255) gtgaGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGTACAGGTGTTGGACTTCGTAGAACGACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCCTGCGGTTGCCACTCAGGCGGcc < 7:227186/146‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGGCCAGCCCGGCCTCGACGATGCCCTGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGGAGGTTGAGCCCGGACAACGCTTGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGcc < 5:313954/149‑1 (MQ=255) | CATTTCTGCAGCAGGATCGAAACGAATTTCTCCGCAGCCGGCGACAGCGATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCC > NC_002947/2337181‑2337473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |