Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,394,761 | T→A | 6.5% | D211V (GAT→GTT) | dacB ← | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,394,761 | 0 | T | A | 6.5% | 265.8 / 5.6 | 87 | D211V (GAT→GTT) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/38); new base A (2/4); total (45/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGG > NC_002947/2394615‑2394908 | cgttcCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCa > 3:164447/1‑149 (MQ=255) gttcCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCAc > 3:190269/1‑149 (MQ=255) caacctcaaggccctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCgg < 6:321059‑M1/27‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGt > 3:140167/1‑149 (MQ=255) cAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGt > 3:145460/1‑149 (MQ=255) aGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCCCCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCTCCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTg > 5:110637/1‑149 (MQ=255) gATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTg > 7:199178/1‑148 (MQ=255) ttGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAt < 7:183038/149‑1 (MQ=255) tGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAtt > 7:184028/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAttt > 3:140511/1‑149 (MQ=255) gcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTa < 1:159008/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTaga < 1:108937/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTaga < 3:140913/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTaga < 4:140167/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTaga < 4:145460/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTa > 2:155570/1‑147 (MQ=255) aCGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTa > 3:161024/1‑147 (MQ=255) ggCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGCCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAgg > 8:89353/1‑149 (MQ=255) ccGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTAc < 4:164447/149‑1 (MQ=255) gcggcgTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCgg < 4:190269/149‑1 (MQ=255) gcgTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCtt < 6:328578/149‑1 (MQ=255) tGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTgg < 8:178093/149‑1 (MQ=255) tGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTgg > 1:112911/1‑149 (MQ=255) tGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTgg > 1:162294/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgat > 3:58263/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatg < 4:174875/148‑1 (MQ=255) gAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACAACACCGGGGGATTGGTTAGGGGGAACCGGGTTGCCCTGGTTgggggggc > 8:55532/1‑142 (MQ=255) aCAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGatgcggatgcgg > 5:259698/1‑149 (MQ=255) aCAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGatgcggatgcgg < 7:24720/149‑1 (MQ=255) aCAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCATCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGatgcggatgcgg < 1:125080/149‑1 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTg < 6:75566/130‑1 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTg > 5:75566/1‑130 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgat < 8:47080/135‑1 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgat > 7:47080/1‑135 (MQ=255) taggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAAt < 8:184028/149‑1 (MQ=255) taggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGAAGCGGGCAAt > 1:293739/1‑149 (MQ=255) gtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCgg > 2:267733/1‑149 (MQ=255) tttGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGt > 5:71435/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTc > 3:233644/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTTCACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacgg > 1:37354/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggc > 1:313250/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGCTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggc > 2:295677/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGCACCTAGTTGGCCGCGGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacgg < 4:102616/148‑1 (MQ=255) agacGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACCCTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GGTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGAATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGCTGGCTagacggag > 4:234169/4‑147 (MQ=255) gCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcga < 1:155570/149‑1 (MQ=255) catCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg < 6:71435/147‑1 (MQ=255) cGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg < 1:295677/149‑1 (MQ=255) aCCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTg < 4:161024/148‑1 (MQ=255) aCCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAAACGGTGGCTCGACGGCGACGGTg < 7:55532/148‑1 (MQ=255) ccTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGAc < 2:112911/149‑1 (MQ=255) cTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGAcc > 8:220240/1‑149 (MQ=255) cTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGAcc > 6:110742/1‑149 (MQ=255) cTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGAcc < 4:118649/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc > 5:248561/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc < 2:162294/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGccacca < 3:173645/149‑1 (MQ=255) aCCGTTTCACTGTTTGCGTCGGGCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCTGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGt < 3:73556/131‑1 (MQ=255) aCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCATCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCAtt < 3:278883/149‑1 (MQ=255) aCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACcatca < 8:199178/147‑1 (MQ=255) aCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGCCACCGG‑GTTTTAGCGC‑ACATCACCGGTGAATTTCTTAGAGGATACCGGCTTGACAGGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAAACGGTGCCTCGACGGCGAGGGt > 4:73556/1‑131 (MQ=255) ttACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTgcgc > 6:69660/1‑149 (MQ=255) tgacacTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTgcgc < 4:140511/147‑1 (MQ=255) acTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCACGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCa > 1:310844/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACg < 2:313250/147‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACg > 6:131657/1‑147 (MQ=255) aTGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGCGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGaa < 2:37354/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACTGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAg < 2:293739/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCATAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGTTGACCATGACAACATCAATGCGCGCCAcc > 6:252796/1‑145 (MQ=255) gTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAgcg > 4:118911/1‑147 (MQ=255) gTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCa > 4:48110/1‑149 (MQ=255) ctctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAgcg < 5:321059‑M1/136‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAg < 4:233644/149‑1 (MQ=255) ctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTTGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGccacc > 4:269979‑M1/10‑124 (MQ=255) ctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGccacc < 3:269979‑M1/115‑1 (MQ=255) ctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGACGCGCAgg < 6:43612‑M1/140‑1 (MQ=255) aagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGc < 8:135701‑M1/142‑1 (MQ=255) gggCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCtt < 5:131657/147‑1 (MQ=255) ggCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAg > 5:128228/1‑149 (MQ=255) ggCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAg < 8:52295/149‑1 (MQ=255) CACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGt > 6:248561‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGtt > 1:267733‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCGG‑GGTGTAGCGC‑ACATCACCGTTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGGCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGATGtt > 3:234169‑M1/1‑149 (MQ=255) G‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAGTTCTTAGAGGCTACCCGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGAcc > 8:206143‑M1/1‑149 (MQ=255) tAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACcagcag > 7:319940/1‑149 (MQ=255) aTCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAg < 5:38710/120‑1 (MQ=255) aTCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAg > 6:38710/1‑120 (MQ=255) aTCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGAGGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCgg > 4:110923/1‑149 (MQ=255) | CGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGGCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGG > NC_002947/2394615‑2394908 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |