| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,398,163 | G→C | 7.6% | I498M (ATC→ATG) ‡ | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,398,163 | 0 | G | C | 7.6% | 279.2 / 8.1 | 89 | I498M (ATC→ATG) ‡ | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/40); new base C (4/3); total (46/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACAAAAGCACGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCGCATCGACAG > NC_002947/2398015‑2398308 | acaaAAGCACGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAACGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAgg > 8:192731/1‑149 (MQ=255) aaaGCACGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATc > 1:315246/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGac > 2:86868/1‑148 (MQ=255) ggCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGacaaca < 7:329520/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCg < 2:315246/149‑1 (MQ=255) gCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCgg < 1:140354/149‑1 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGATCCTCGacaaag > 1:187539/1‑138 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGATCCTCGacaaag < 2:187539/140‑3 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGa > 8:138102/1‑135 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGa < 7:138102/135‑1 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGt > 6:138926/1‑148 (MQ=255) cAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTATTCCGGTGAGATGCTCAGCATAGCTTTGTCGAGGATCGAGAACAGAGCCGGTg > 8:153844/1‑149 (MQ=255) caccacCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGATCCTCGacaaagcttt > 7:210361/1‑135 (MQ=255) caccacCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGATCCTCGacaaagcttt < 8:210361/141‑7 (MQ=255) acctccTGCATGGCCAGGAGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAACTCCACGCCATCGGTTGTTTATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGAGTCTCAGCAAAGCTTTGTCTAGGATCGACAACAGCGCCGGTGActg < 8:115723/149‑3 (MQ=255) accaccTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACgg < 4:41770/149‑1 (MQ=255) ccaccTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCGGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACggg < 3:108787/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATc > 5:113571/1‑117 (MQ=255) gCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATc < 6:113571/117‑1 (MQ=255) cAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCa > 5:228386/1‑149 (MQ=255) gcggcTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATgg > 4:82129/1‑149 (MQ=255) tGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAg > 6:20346/1‑149 (MQ=255) tGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAg > 4:128657/1‑149 (MQ=255) tAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGtt > 5:79210/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTgg > 7:135143/1‑149 (MQ=255) ccTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGc < 3:192810/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGc < 7:192731/149‑1 (MQ=255) cTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCg > 8:144165/1‑149 (MQ=255) tttGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGGTGCCATGGCGAAGTTGGCgg > 4:64272/1‑149 (MQ=255) ggAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGtt > 7:14946/1‑149 (MQ=255) gAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTc < 7:253643/149‑1 (MQ=255) ttGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCt < 2:194372/149‑1 (MQ=255) tCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACACCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGAGGCCATGGAGAAGTTGGCGGGTTCGCtcc > 3:46734/1‑146 (MQ=255) cATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGcc > 4:114162/1‑148 (MQ=255) tCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATg < 5:238041/120‑1 (MQ=255) tCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATg > 6:238041/1‑120 (MQ=255) tCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCgg > 8:107829/1‑133 (MQ=255) tCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCgg < 7:107829/133‑1 (MQ=255) tCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGccgacc > 8:42286/1‑147 (MQ=255) cATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAg < 7:144165/149‑1 (MQ=255) aTGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAg < 6:182291/148‑1 (MQ=255) ctgccAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCg > 4:298274/1‑149 (MQ=255) tgccAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCg > 3:236957/1‑148 (MQ=255) gccAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGa > 4:199301/1‑149 (MQ=255) ccAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGAt < 8:135143/149‑1 (MQ=255) ccAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGAt < 3:82129/149‑1 (MQ=255) aaaGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTg > 6:154230/1‑89 (MQ=255) aaGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGAc < 1:86868/149‑1 (MQ=255) gCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCa < 3:114162/149‑1 (MQ=255) aGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTggg > 8:29725/1‑149 (MQ=255) aGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGGTGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTggg < 3:64272/149‑1 (MQ=255) gCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGt < 4:36130/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGGGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTg < 5:249993/149‑1 (MQ=255) ttgttgATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCt < 6:228386/149‑1 (MQ=255) ttgttgATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCt < 3:128657/149‑1 (MQ=255) gttgATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGTGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGAACGAGGTGCGGATGACTTGATATGGGtttattg > 1:304429/1‑144 (MQ=255) aCCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAggg < 3:199301/148‑1 (MQ=255) cccccAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACAGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCgg < 5:186478/96‑1 (MQ=255) cccccAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACAGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCgg > 6:186478/1‑96 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGa > 4:86615/1‑133 (MQ=255) aaaGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGa < 3:86615/133‑1 (MQ=255) aaaGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGgtggtg > 2:134257/1‑144 (MQ=255) aaaGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGgtggtg < 1:134257/144‑1 (MQ=255) aaaGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTCATTGGCGTCGATCAGGGAGGTGAGCAc > 4:236734/1‑149 (MQ=255) gctgttGTCGATCCTCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAgg > 2:167447/5‑115 (MQ=255) gctgttGTCGATCCTCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAgg < 1:167447/111‑1 (MQ=255) ctgttGTCGATCCTCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCg > 8:154913/4‑148 (MQ=255) tGTCGAGGAGCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCGCAt < 5:20346/147‑1 (MQ=255) gAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGgtggtg < 3:87230/133‑1 (MQ=255) gAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGgtggtg > 4:87230/1‑133 (MQ=255) gAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCGCATCGACAg > 5:35511/1‑149 (MQ=255) gAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCGCATCGACAg > 5:77707/1‑149 (MQ=255) | ACAAAAGCACGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCAGGGCCAGGCGGCTGTAGCCTTTGGAGTTGTCATCCTCATGCCTGCCAAAGCCACGCCAGCGGTTGTTGATTACCCCCAGCTCTTCCGGTGAGATGCTCAGCAAAGCTTTGTCGAGGATCGACAACAGCGCCGGTGACGGGGCAATGGTGGCCATGGCGAAGTTGGCGGGTTCGCTGCCGACCGAGGTGCGGATGACCAGTTCTGGGTTGCTGGCCAGGGCGTGATTGGCGTCGATCAGGGTGGTGATCACCGCATCGACAG > NC_002947/2398015‑2398308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |