Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,445,045 | T→A | 6.0% | E156V (GAA→GTA) ‡ | lexA‑I ← | transcriptional repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,445,045 | 0 | T | A | 6.0% | 207.5 / 3.1 | 67 | E156V (GAA→GTA) ‡ | lexA‑I | transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/35); new base A (2/2); total (30/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 |
TGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGG > NC_002947/2444899‑2445185 | tGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCATCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCg > 8:318688/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCAcc > 5:66865/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACGAAGTCAcc > 6:221614/1‑149 (MQ=255) aGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCg < 3:51625/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCg < 6:66865/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACATTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCAcc < 8:35865/148‑1 (MQ=255) gcggcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGa > 2:249868/1‑149 (MQ=255) gcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACGAAGTCACCgtcaa < 5:221614/149‑5 (MQ=255) gcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACGAAGTCACCgtcaa < 7:126702/149‑5 (MQ=255) gcccacgACGCCGCCGCTCACCCCCGCCACCCCCCGCACCTGTTCTTTCCCGCCGCCTTCGCAGGGGGCGAATTCGGGGGTTGCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATgc < 8:168943/143‑1 (MQ=255) aCGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCca > 1:128479/1‑148 (MQ=255) gCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACaa < 3:250006/149‑1 (MQ=255) ccGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAAc < 6:91790/149‑1 (MQ=255) ccGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAAc > 1:333615/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTg < 7:163931/149‑1 (MQ=255) tCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTgg > 7:151673/1‑149 (MQ=255) aaGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGcc < 3:189555/149‑1 (MQ=255) cTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGc > 8:208061/1‑149 (MQ=255) aCCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCtt < 1:249868/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa > 8:566/1‑149 (MQ=255) cAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGT‑‑CCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa < 3:162346/146‑1 (MQ=255) cAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGT‑‑CCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa > 4:162346/1‑146 (MQ=255) cTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCa < 7:208061/147‑1 (MQ=255) cTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAgg > 1:149945/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAg < 1:78910/148‑1 (MQ=255) gTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgtg > 8:172317/1‑149 (MQ=255) ttCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgt < 8:83035/147‑1 (MQ=255) ttCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgt < 1:222200/147‑1 (MQ=255) tttCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCa > 4:121552/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCa < 7:318688/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCGCCTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTATGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCCCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGc < 6:121157/146‑1 (MQ=255) tCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGc < 7:172317/146‑1 (MQ=255) tCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCAcc > 4:25517/1‑149 (MQ=255) gACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCcagca < 2:333615/149‑1 (MQ=255) cTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAgg < 2:128479/149‑1 (MQ=255) aTGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGcc < 4:338900/149‑1 (MQ=255) ggggCGAATGCGGGGTTTTCGGCTAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTGCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGt < 7:187047/148‑1 (MQ=255) gggCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTc > 4:14801/1‑148 (MQ=255) ggCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCg > 5:340715/1‑148 (MQ=255) gCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCg > 8:28351/1‑147 (MQ=255) gCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCg < 7:28351/147‑1 (MQ=255) aTTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATg < 8:31603/149‑1 (MQ=255) ggggTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGa > 1:126126/1‑149 (MQ=255) gTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGt > 5:284598/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTcc < 8:151673/148‑1 (MQ=255) aaGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatgc < 3:14801/149‑1 (MQ=255) aaGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatgc < 3:25517/149‑1 (MQ=255) cagcCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatgctcn < 2:149945/149‑2 (MQ=255) gcCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatgctcatg > 4:223194/1‑149 (MQ=255) aCTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCgtg > 2:178611/1‑149 (MQ=255) gctgcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTAcgc > 5:337094/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCgt < 6:94414/140‑1 (MQ=255) gcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCgt > 5:94414/1‑140 (MQ=255) ccTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCgca < 6:135862/148‑1 (MQ=255) cTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCgcag > 8:135260/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCgcagc > 8:45122/1‑148 (MQ=255) gcgcTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCaaa < 1:178611/148‑1 (MQ=255) cgcTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATa < 7:135260/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGt > 8:116149/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCCCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTc > 6:217616/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTc < 3:223194/147‑1 (MQ=255) aaGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGc > 4:5360/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCt < 3:5360/149‑1 (MQ=255) cTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTggg < 2:126126/149‑1 (MQ=255) gACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTgggg < 3:121552/147‑1 (MQ=255) atcGGTGACGAAGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGt > 6:120484/3‑149 (MQ=255) ggTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTgg > 2:106715/1‑148 (MQ=255) | TGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGG > NC_002947/2444899‑2445185 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |