Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,467,909 | A→G | 5.4% | S267G (AGC→GGC) | queF → | NADPH‑dependent 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,467,909 | 0 | A | G | 5.4% | 277.0 / 4.1 | 93 | S267G (AGC→GGC) | queF | NADPH‑dependent 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/45); new base G (2/3); total (45/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 |
GCATGCCGACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATT > NC_002947/2467764‑2468057 | gCATCCCGACTTCCATGAGCAGGGCGTGGAGCGCATTTACCTGGACTTGAACAATCTGCTGCACCCGGAGCACCTGACGCTCTATCCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTAGCGCAGCACCGGGCCGATCAGcc < 6:95191/149‑1 (MQ=255) aTGCCGACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCg < 3:49100/149‑1 (MQ=255) aTGCCGACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCg < 8:129130/149‑1 (MQ=255) tGCCGACTTCCATGAGCAGTGGGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACTGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCgg < 3:177536/149‑1 (MQ=255) ccGACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGa < 1:247992/148‑1 (MQ=255) gACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCTGATCGGCCCggtgct < 7:334285/149‑5 (MQ=255) aCTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAAc < 4:262909/149‑1 (MQ=255) aCTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCCGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAAc < 1:291287/149‑1 (MQ=255) cATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAAc < 6:7151/148‑1 (MQ=255) tGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGc < 7:222520/149‑1 (MQ=255) tgtgGAGCGGATGTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCgg < 8:24447/148‑1 (MQ=255) ggtgCGTATTTACCTGGACTTGATGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGAGGCGCGTTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCTGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAg < 7:248286/145‑1 (MQ=255) ggAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGAt > 8:41970/1‑127 (MQ=255) ggAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGAt < 7:41970/127‑1 (MQ=255) ggAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAg > 1:273493/1‑148 (MQ=255) gAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGt > 5:306804/1‑148 (MQ=255) gCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAAt < 7:258123/149‑1 (MQ=255) gATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATa > 7:76429/1‑147 (MQ=255) aCCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATAc > 1:3256/1‑143 (MQ=255) aCCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATAc < 2:3256/143‑1 (MQ=255) ccTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGAt > 2:307885/1‑115 (MQ=255) cTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAAc < 7:179661/117‑1 (MQ=255) cTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAAc > 8:179661/1‑117 (MQ=255) ggACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGc > 1:248025/1‑131 (MQ=255) ggACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGc < 2:248025/131‑1 (MQ=255) ggACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGc > 3:37732/1‑149 (MQ=255) gACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCACCCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCa > 5:157231/1‑131 (MQ=255) gACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCACCCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCa < 6:157231/131‑1 (MQ=255) cTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGCCGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCgg < 5:369294/127‑1 (MQ=255) cTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCgg > 6:369294/1‑127 (MQ=255) ttGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAACCGGCTGGTCCGGCAGTAATACCGGGGGCCGCTTTg > 5:188747/1‑149 (MQ=255) ttGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTg > 6:323213/1‑149 (MQ=255) gaagaaTCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGTGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCg > 3:339735/1‑149 (MQ=255) gaagaaTCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCACCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCg > 1:89830/1‑149 (MQ=255) aagaaTCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGTGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCg < 4:339735/148‑1 (MQ=255) gaaTCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGcc > 1:113916/1‑149 (MQ=255) tCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGccccc > 7:115000/1‑149 (MQ=255) ctgcAGCCGTCGCCCCTGCCGGTCAATGCGCGCTATGTGCGCGGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCACCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAAAAAACGGCTGGTCCGGCATTAATACAGGGGCCCGCTTTGCGGCCCCCGCTa < 6:202711/149‑1 (MQ=255) gCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCa < 2:113916/149‑1 (MQ=255) ccGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAg < 5:323213/149‑1 (MQ=255) ccGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAg < 7:75887/149‑1 (MQ=255) gAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATc > 3:45104/1‑149 (MQ=255) aCCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCa < 4:45104/149‑1 (MQ=255) ccTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCAt > 6:6768/1‑149 (MQ=255) gACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCt > 1:10891/1‑149 (MQ=255) gACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCt > 8:263028/1‑149 (MQ=255) aCGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTa < 2:211435/101‑1 (MQ=255) aCGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTa > 1:211435/1‑101 (MQ=255) aCGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCAt < 5:135839/145‑1 (MQ=255) aCGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCAt > 6:135839/1‑145 (MQ=255) gTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCGCCGCTATTTCAGATCCCCATGCtgtg > 3:212106/1‑148 (MQ=255) gTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCtgtg > 2:17469/1‑148 (MQ=255) tCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCt > 1:134075/1‑144 (MQ=255) tCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCt < 2:134075/144‑1 (MQ=255) tCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCa > 2:244870/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGa < 8:76429/148‑1 (MQ=255) gcgcgcTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAg > 8:164803/1‑149 (MQ=255) gcgcTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGtt > 8:316748/1‑149 (MQ=255) gcttttggcggcgCGGTGGGCTGGTAATGAAACCGTATTGGATGACCGGTGCGTAGAGGCCGGTTTAAAAAAGGCTTGTCCGGGATTAATACCCGGGGCCGGTTTGGGGGCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTgg < 4:43286/142‑1 (MQ=255) 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cgGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGc > 6:63678/1‑137 (MQ=255) cgGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGc < 5:63678/137‑1 (MQ=255) ggTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAgg < 1:17469/149‑1 (MQ=255) gggCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTg < 8:115000/149‑1 (MQ=255) ggACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAACCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGt < 6:160592/149‑1 (MQ=255) gACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTg < 4:329171/149‑1 (MQ=255) aCATCACCCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGt > 2:223588/1‑147 (MQ=255) cAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTc > 4:128937/1‑149 (MQ=255) aCCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgg < 3:128937/149‑1 (MQ=255) aCCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgg > 6:304872/1‑149 (MQ=255) cccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCggg < 7:316748/149‑1 (MQ=255) ccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAg < 2:210356/109‑1 (MQ=255) ccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg < 7:83263/149‑1 (MQ=255) ccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg > 8:83263/1‑149 (MQ=255) ccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCCGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAg > 1:210356/1‑109 (MQ=255) cGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGggt > 7:334617/1‑149 (MQ=255) tCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTc > 8:120002/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCgg > 4:108518/1‑149 (MQ=255) gcaCCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCt < 6:322548/149‑1 (MQ=255) cGGGCTGATCGGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCg < 6:53642/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGATCGGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCg < 6:48276/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGATCGGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCg > 5:53642/1‑147 (MQ=255) cGGGCTGATCGGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCg > 5:48276/1‑147 (MQ=255) ggCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGCGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGAACCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAgc > 4:352192/1‑149 (MQ=255) gCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAgcg > 2:85695/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTc < 6:318368/135‑1 (MQ=255) cGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTc > 5:318368/1‑135 (MQ=255) cGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCt < 7:164803/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGa > 4:293811/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGATAACAACCGGCTGGTCCGGCAGTAATACCGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGGCGGCCTCGAAGCGCTCGAtt < 6:188747/149‑1 (MQ=255) | GCATGCCGACTTCCATGAGCAGTGTGTGGAGCGGATTTACCTGGACTTGAAGAATCTGCTGCAGCCGGAGCACCTGACGGTCTATGCGCGCTATGTGCGCCGCGGTGGGCTGGACATCAACCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATT > NC_002947/2467764‑2468057 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |