| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,641,804 | C→A | 6.7% | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 → | lytic transglycosylase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,641,804 | 0 | C | A | 6.7% | 248.6 / 5.8 | 85 | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 | lytic transglycosylase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/40); new base A (2/4); total (41/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.09e-01 | |||||||||||
GTTGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGTATTA > NC_002947/2641656‑2641952 | gTTGCCGTTGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTTGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgc < 5:314247/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgc < 6:322467/148‑1 (MQ=255) gCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCt > 1:149397/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTc > 3:208998/1‑149 (MQ=255) tCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCtgg < 2:154751/149‑1 (MQ=255) ttttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGgcgc > 3:276344/1‑149 (MQ=255) ttttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGc > 7:197043/1‑149 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGcg < 6:331336/148‑2 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTATTCTGATGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCg > 7:245905/1‑149 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCgcag > 2:256806/1‑149 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCgcag > 1:252373/1‑149 (MQ=255) tttATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCaaaa > 1:68201/1‑148 (MQ=255) aTCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATa > 4:241394/1‑149 (MQ=255) aTCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGCGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCATGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAACCAt > 4:236802/1‑148 (MQ=255) gCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAAc > 2:349896/1‑133 (MQ=255) gCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAAc < 1:349896/133‑1 (MQ=255) aCCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGcg > 6:47928/1‑119 (MQ=255) aCCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGcg < 5:47928/120‑2 (MQ=255) cATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGt > 6:206129/1‑148 (MQ=255) cATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGt > 5:97141/1‑148 (MQ=255) gATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCt > 5:365243/1‑149 (MQ=255) gATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCt > 7:247597/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCggg > 6:175899/1‑109 (MQ=255) aTGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCggg < 5:175899/109‑1 (MQ=255) ccGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgc < 7:83152/148‑1 (MQ=255) cGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgcgc < 3:341130/149‑1 (MQ=255) gCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgcg > 3:336081/1‑147 (MQ=255) gCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgcg > 7:268165/1‑147 (MQ=255) gACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAg > 8:328710/1‑125 (MQ=255) gACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAg < 7:328710/125‑1 (MQ=255) gACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCg > 6:297041/1‑148 (MQ=255) cACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCAc > 8:15015/1‑148 (MQ=255) aCGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCa < 1:13124/149‑1 (MQ=255) ggACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAg > 1:212225/1‑148 (MQ=255) ggACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAg > 4:293193/1‑148 (MQ=255) acacGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGcc < 5:366616/86‑1 (MQ=255) acacGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGcc > 6:366616/1‑86 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGATCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTa > 2:163685/1‑149 (MQ=255) tCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTg < 1:256806/148‑1 (MQ=255) tCGCATGCAGCGATGATGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGAAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACATGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc > 6:321295/1‑149 (MQ=255) cGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc < 2:149397/148‑1 (MQ=255) cGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc < 4:208998/148‑1 (MQ=255) cGCATGCAGAGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTTGCCTTTGCCGGTACCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGTCTCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc < 5:321295/148‑1 (MQ=255) gCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGa < 3:293193/149‑1 (MQ=255) gCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGa < 6:150723/149‑1 (MQ=255) gCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGa < 1:178532/149‑1 (MQ=255) cATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAg > 5:346123/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAg < 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cTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc < 6:97141/148‑1 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCa > 8:339262/1‑147 (MQ=255) cTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCagag < 8:268165/149‑1 (MQ=255) cATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc > 2:330430/1‑142 (MQ=255) cATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc < 1:325105/142‑1 (MQ=255) cATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc > 2:325105/1‑142 (MQ=255) cATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc < 1:330430/142‑1 (MQ=255) gctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGtt > 6:75499/1‑149 (MQ=255) ctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTg > 1:184094/1‑123 (MQ=255) ctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTg < 2:184094/123‑1 (MQ=255) ctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTc < 6:346123/149‑1 (MQ=255) tgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCt > 6:201806/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCt < 5:75499/147‑1 (MQ=255) aCGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTg < 7:15015/148‑1 (MQ=255) gCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTggtg < 5:165437/149‑1 (MQ=255) ttgggTTGGCCTTTTCCGGTCCCGCCCAGGCGCGGTCGCCGGGGCCGCATCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTTCGTGACCTGGCGCAGTTTCCCAACAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACTAGAGCCGCAACAGTTCTggtgag < 7:227424/147‑1 (MQ=255) 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ccAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATc > 2:162487/1‑148 (MQ=255) cAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGa < 5:201806/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATc < 8:135438/144‑1 (MQ=255) gcgcgcTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATc > 7:135438/1‑144 (MQ=255) cgcTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGtatta > 5:127766/1‑149 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |