Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,657,805 | G→T | 7.8% | intergenic (‑194/+15) | pabB ← / ← PP_2330 | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,657,805 | 0 | G | T | 7.8% | 225.9 / 5.6 | 72 | intergenic (‑194/+15) | pabB/PP_2330 | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/30); new base T (3/3); total (39/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGGAAAAGCGCCTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCTGAGTCAGGC > NC_002947/2657661‑2657947 | aGGAAAAGCGCCTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAg > 8:250546/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCGCCTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGcc > 3:176312/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCCTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAACACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGcccc > 1:275252/1‑149 (MQ=255) cTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTAttt > 8:197291/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCa < 4:180358/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGAAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑g > 2:322938/1‑149 (MQ=255) cTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCgg > 6:280259/1‑149 (MQ=255) tACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTggg > 3:106344/1‑149 (MQ=255) cGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGca < 4:176312/149‑1 (MQ=255) cGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGc < 8:294828/148‑1 (MQ=255) aaCATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGccc > 7:236148/1‑148 (MQ=255) aCATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTggg < 1:292766/138‑1 (MQ=255) aCATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTggg > 2:292766/1‑138 (MQ=255) tgtgTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGaa > 4:243244/1‑146 (MQ=255) tttGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCt < 4:217053/113‑1 (MQ=255) tttGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCt > 3:217053/1‑113 (MQ=255) tttGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGAccc < 3:243244/149‑1 (MQ=255) ggCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTgg < 8:12027/126‑1 (MQ=255) ggCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGAAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGGATTTAA‑GCGGTTgg > 7:12027/1‑126 (MQ=255) gCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCtgtg < 7:250546/149‑1 (MQ=255) ccATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGc > 4:150299/1‑148 (MQ=255) aTACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCtac < 7:265597/149‑1 (MQ=255) gcagcaCAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCtacccg > 7:129282/1‑148 (MQ=255) agcaCAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACa < 1:105184/130‑1 (MQ=255) agcaCAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACa > 2:105184/1‑130 (MQ=255) cacaAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCtacccgtaccc > 6:205192/1‑149 (MQ=255) aaGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCgct > 1:323122/1‑149 (MQ=255) ccTGCATGTCGAGCGTATCGCTTGAATCAACTGCAGTGCATTCAAGATCAAACTTGTGCTGCGTAATGGCTGCAATGCATCCCCTGTATTTCATCCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGc < 1:274200/148‑1 (MQ=255) cTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTc > 2:308313/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTc > 2:126328/1‑149 (MQ=255) aGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCg < 2:323122/149‑1 (MQ=255) aGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCg < 2:275252/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTTTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCgg < 4:106344/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGt > 4:161793/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGt > 7:86074/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGt < 8:129282/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCt < 3:207212/77‑1 (MQ=255) tCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCt > 4:207212/1‑77 (MQ=255) gAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTcac < 5:280259/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACAccc < 1:126328/149‑1 (MQ=255) gcTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCtt < 3:161793/149‑1 (MQ=255) gAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGc > 2:146076/1‑148 (MQ=255) aTCAAATGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAg > 1:301227/1‑149 (MQ=255) tCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCtac > 5:340921/1‑103 (MQ=255) tCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCtac < 6:340921/103‑1 (MQ=255) cAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGCCCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACCCCCTCCTTGGCCAGTg > 6:219106/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTc < 6:323691/147‑1 (MQ=255) cAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCg < 8:86074/148‑1 (MQ=255) tGCTTGTAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCtg > 7:15845/1‑87 (MQ=255) tGCTTGTAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCtg < 8:15845/87‑1 (MQ=255) cTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCTAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgc < 1:322938/149‑1 (MQ=255) cTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGAtgtg < 7:197291/148‑1 (MQ=255) cTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgc < 1:141763/149‑1 (MQ=255) cTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgc < 1:146076/149‑1 (MQ=255) cTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgc < 8:236148/149‑1 (MQ=255) ttGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgcg > 3:70667/1‑149 (MQ=255) ttGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTgcg > 5:359739/1‑149 (MQ=255) gagCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACCCACTCCTTGGCCAGTGCTGCGATGTGCGCCTCGa > 7:89476/1‑149 (MQ=255) cAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGAt < 1:308313/147‑1 (MQ=255) ccTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCTGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTCTCCAGTGCTTCGATGTTCGCCTCGATGGCAt > 8:275033/1‑149 (MQ=255) ccTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCAt > 8:74301/1‑149 (MQ=255) tgcGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTTCCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTgcgc > 6:72609/1‑149 (MQ=255) cGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCt < 2:301227/148‑1 (MQ=255) caggggCTGCCTTGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCTGAg > 3:140055/4‑149 (MQ=255) caggggCTGCCTTGCAGCCCATGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCAt < 6:30242/134‑1 (MQ=255) caggggCTGCCTTGCAGCCCATGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCAt > 5:30242/4‑137 (MQ=255) aggggCTGCCTTGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGAt < 2:200290/129‑1 (MQ=255) aggggCTGCCTTGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGAt > 1:200290/3‑131 (MQ=255) tGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCTGAGt > 3:191245/1‑148 (MQ=255) cTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCTGAGTCAGGc > 8:153470/1‑149 (MQ=255) cAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCAt > 5:253221/1‑128 (MQ=255) cAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCAt < 6:253221/128‑1 (MQ=255) | AGGAAAAGCGCCTAGCGCTGGGTACGACATTCAACATTGTGTTTGGCCCATACGCAGCACAAGGCAGTTCCTGCAGGTCGAGCGAAGCGCTTGAATCAACTGCAGTGCTTGCAAGAGCAACCTTGTGCTGCGAATGGGCTGCAAGGCAGCCCCTGTATTTCA‑GCGGTTGGGCACATGCCCGAACAGACCCTGTGCTACCCGTACCCGCTGCTCGGCGTCTTCGGTCACACCCTCCTTGGCCAGTGCTTCGATGTGCGCCTCGATGGCATGGGTGCGCTGAGTCAGGC > NC_002947/2657661‑2657947 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |