| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,158,307 | C→G | 6.1% | P109R (CCT→CGT) | opuA → | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,158,307 | 0 | C | G | 6.1% | 210.7 / 3.6 | 65 | P109R (CCT→CGT) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/30); new base G (2/2); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
GCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACTACG > NC_002947/3158170‑3158454 | gcgTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTgcg‑c > 8:325935/1‑148 (MQ=255) gTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGAGAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAg < 6:94861/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCt > 6:168912/1‑149 (MQ=255) gCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCt < 7:325935/148‑1 (MQ=255) gAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGGCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCg < 6:26252/149‑1 (MQ=255) gggctttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGC‑TGGCGCAGCGTAGGCTGCGTC‑‑AAGCTGctcag < 4:262470/147‑5 (MQ=38) tgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAgc < 6:49189/148‑1 (MQ=255) cttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAgcgc < 5:112374/148‑1 (MQ=255) cttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGC‑TGGCGCAGCGTAGGCTGCGTC‑‑AAGCTGctca < 5:275212/140‑4 (MQ=38) cttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGC‑TGGCGCAGCGTAGGCTGCGTC‑‑AAGCTGctca > 6:275212/1‑137 (MQ=38) gATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCg > 3:171479/1‑149 (MQ=255) gTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATg < 6:39379/149‑1 (MQ=255) gTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATg < 4:171479/149‑1 (MQ=255) gTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATg > 2:173852/1‑149 (MQ=255) tACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATgg > 4:307337/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGCGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCGTACGCTGCG‑A‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGgtgt > 5:310091/1‑149 (MQ=255) ggCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCAttt > 2:283778/1‑149 (MQ=255) cAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCg < 5:168912/149‑1 (MQ=255) aGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCAttt > 7:14751/1‑145 (MQ=255) aGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCAttt < 8:14751/145‑1 (MQ=255) tCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTAc < 5:315586/95‑1 (MQ=255) tCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGttt > 4:85483/1‑149 (MQ=255) gACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGttt > 2:65102/1‑147 (MQ=255) gACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGttt < 1:65102/147‑1 (MQ=255) tgcGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCAt > 5:370050/1‑149 (MQ=255) gcgcCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATc > 7:293724/1‑149 (MQ=255) gcCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCg > 2:124966/1‑148 (MQ=255) ccACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCAATTCGGTTTGCTGCCGCATCg > 1:131382/1‑147 (MQ=255) cACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCGTGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAg > 8:329244/1‑149 (MQ=255) aCGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑CCACAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGaa < 1:283778/149‑1 (MQ=255) gTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGt > 8:20464/1‑149 (MQ=255) tCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTg > 2:305284/1‑149 (MQ=255) cAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGc > 8:23613/1‑149 (MQ=255) cAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTCTGCTGCCGCATCGAAGCGTGc > 8:253546/1‑149 (MQ=255) gTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGgt > 4:49294/1‑105 (MQ=255) gTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGgt < 3:49294/105‑1 (MQ=255) ttGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGTGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACac > 8:250459/1‑148 (MQ=255) ttGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACaa < 3:85483/149‑1 (MQ=255) aTAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGt > 5:4536/1‑149 (MQ=255) gagCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGc < 2:208927/149‑1 (MQ=255) agCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGcc > 3:199041/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCt > 4:59629/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCtt < 7:107303/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCCGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGc < 5:258552/149‑1 (MQ=255) gcgAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGaa < 7:20464/149‑1 (MQ=255) cgAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAAt > 5:10797/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAAtt < 4:199041/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCACCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTgc < 6:167937/149‑1 (MQ=255) tGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTgcgc < 1:173852/149‑1 (MQ=255) cTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCgg < 3:59629/149‑1 (MQ=255) tCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGt > 5:94050/1‑149 (MQ=255) aTCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGt > 8:62710/1‑147 (MQ=255) ggTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGt < 6:275861/141‑1 (MQ=255) ggTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGt > 5:275861/1‑141 (MQ=255) tGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTCTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGaaa < 7:253546/149‑1 (MQ=255) gAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCtt < 3:135346/119‑1 (MQ=255) gAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCtt > 4:135346/1‑119 (MQ=255) ggTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTa < 6:4536/149‑1 (MQ=255) cTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTc < 6:370050/148‑1 (MQ=255) tGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAg < 3:333253/138‑1 (MQ=255) tGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAg > 4:333253/1‑138 (MQ=255) cTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTgg > 4:26678/1‑101 (MQ=255) cGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCa < 1:124966/149‑1 (MQ=255) gCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGATGCGTGCTCGACAACGTGGCCTAGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGAGGCACAAc > 7:4231/1‑149 (MQ=255) gCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACTAc < 6:94050/149‑1 (MQ=255) ccTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACTACg > 1:83678/1‑149 (MQ=255) | GCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCG‑C‑‑CAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACTACG > NC_002947/3158170‑3158454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |