Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,181,223 | T→C | 5.9% | H140H (CAT→CAC) | PP_2791 → | aminoglycoside phosphotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,181,223 | 0 | T | C | 5.9% | 199.7 / 2.0 | 68 | H140H (CAT→CAC) | PP_2791 | aminoglycoside phosphotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/33); new base C (2/2); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 |
CGGCGTTGGGTACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCG > NC_002947/3181077‑3181371 | cGGCGTTGGGTACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATgg > 1:233056/1‑149 (MQ=255) gggTACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGgt < 3:326967/148‑1 (MQ=255) gTACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTTGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGtt < 1:239583/149‑1 (MQ=255) tACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGttc > 7:90216/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTcc > 3:233791/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTcc > 8:191814/1‑149 (MQ=255) cgcAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGttcttc < 2:113373/147‑1 (MQ=255) cgcAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGttcttc < 7:60478/147‑1 (MQ=255) cgcAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCt < 6:55644/149‑1 (MQ=255) aGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGAt < 7:339664/149‑1 (MQ=255) aGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCACGGGCGGGTGTTCTTCCTGAt > 7:133799/1‑149 (MQ=255) aGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCACGGGCGGGTGTTCTTCCTGAt > 7:128921/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAg > 6:123403/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAg > 8:241462/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGc > 1:63122/1‑149 (MQ=255) gcgcTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCggg < 1:141815/149‑1 (MQ=255) gcTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTa < 1:67494/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAgcg > 3:288745/1‑149 (MQ=255) cccGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAgcg < 1:315867/148‑1 (MQ=255) cccGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAgcg < 7:128916/148‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTgcc < 7:191814/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTgcc < 4:253647/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTgcc < 7:241462/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTgccggcc < 5:123403/149‑1 (MQ=255) ttGACAGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGACACGCCAGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGAGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCcgc > 3:250494/1‑149 (MQ=255) gACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCcgc < 2:51732/147‑1 (MQ=255) cGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCt < 6:150015/149‑1 (MQ=255) gTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCt > 6:40056/1‑148 (MQ=255) aaCAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAg > 4:28663/1‑148 (MQ=255) aaCAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAg < 5:40056/148‑1 (MQ=255) aaCAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAg > 7:98780/1‑148 (MQ=255) aaCAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCACGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAg < 8:128921/148‑1 (MQ=255) aaCAGGAGTTCGCCGGGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCACGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAg < 8:133799/148‑1 (MQ=255) cAGGAGTTCGCCGTGATGCAGGTGGTTAACCAGCCCGGCGTGAAAGTGCAACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTCCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATCGAGTATGTGCCGGCTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCAc > 3:250282/1‑149 (MQ=255) aGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTAt > 1:108654/1‑113 (MQ=255) aGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTAt < 2:108654/113‑1 (MQ=255) aGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCAGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCAcc > 1:237201/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGACCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCgg > 3:67267/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGt > 4:31931/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTc < 7:95634/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAggg < 4:233791/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAg < 5:13631/147‑1 (MQ=255) tggtTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCgg < 3:28663/149‑1 (MQ=255) gtTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTc > 8:164991/1‑136 (MQ=255) gtTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTc < 7:164991/136‑1 (MQ=255) gtTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGgc < 2:233056/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTgccgg > 6:150950/1‑106 (MQ=255) ccAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCaa < 2:237201/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCATGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACt > 5:37528/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCg > 8:261697/1‑149 (MQ=255) gTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACg > 1:239295/1‑147 (MQ=255) ccACGCCCTCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTACTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCGGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGAAGCTTgtc < 4:250494/147‑3 (MQ=255) ccACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGGGCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCGGCTTGgcgg > 4:261976/1‑148 (MQ=255) gCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACTGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTc < 8:90216/149‑1 (MQ=255) gCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGgcgc > 3:238748/1‑93 (MQ=255) gCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGgcgc < 4:238748/93‑1 (MQ=255) gCTGTGCCGCGATGGGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGt < 3:261976/148‑1 (MQ=255) tgtgCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTc > 7:185955/1‑99 (MQ=255) tgtgCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTc < 8:185955/99‑1 (MQ=255) ccGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCAt > 6:100167/1‑148 (MQ=255) gcgATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAg < 8:98780/149‑1 (MQ=255) gATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTAGCGCGTCTGCATCAGGt > 3:298883/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACt < 6:149312/105‑1 (MQ=255) tgtgCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACt > 5:149312/1‑105 (MQ=255) tgtgCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCCACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTcc > 5:245084/1‑149 (MQ=255) gtgCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCgg > 6:221228/1‑96 (MQ=255) gtgCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCgg < 5:221228/96‑1 (MQ=255) gCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGt > 8:213189/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTgcg < 3:31931/149‑1 (MQ=255) | CGGCGTTGGGTACTGCGCAGCGATGCGCTTTCAGCGCTACCCGCCAGCCTTGACCGTGAACAGGAGTTCGCCGTGCTGCAGGTGGTTTACCAGGCCGGCGTGAAAGTGCCACGCCCGCTCTGGCTGTGCCGCGATGTGCGCGTGCATGGGCGGGTGTTCTTCCTGATGGAGTATGTGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCAACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCG > NC_002947/3181077‑3181371 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |