Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,233,690 | T→C | 5.9% | V293A (GTG→GCG) | GbpR → | galactose‑binding protein regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,233,690 | 0 | T | C | 5.9% | 198.5 / 2.5 | 68 | V293A (GTG→GCG) | GbpR | galactose‑binding protein regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/33); new base C (2/2); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
CGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCAACTGGATCCGCTACAA > NC_002947/3233544‑3233837 | cGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc < 1:306503/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc > 6:345854/1‑149 (MQ=255) cGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAACGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGAcc > 3:217379/1‑149 (MQ=255) gATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGAcc < 6:179761/148‑1 (MQ=255) cACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTcgcg < 3:88640/147‑1 (MQ=255) cACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTcgcg > 4:88640/1‑147 (MQ=255) cATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACt > 3:148785/1‑149 (MQ=255) cATGCTCGAAGCGTCCGAAACGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACt < 4:217379/149‑1 (MQ=255) tCGTAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGGCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGtt < 4:350447/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGtt > 2:213077/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCGGCCGAAATGATTGCGGTGGGGCGCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGGCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTgc < 5:72248/129‑1 (MQ=255) gAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGtt < 1:213077/147‑1 (MQ=255) cGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCtt < 1:334836/149‑1 (MQ=255) ccGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGa > 1:327573/1‑148 (MQ=255) aaaTGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATAcc > 6:261985/1‑149 (MQ=255) aTTGCGGTGGTGCCCAATAACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTtgct < 6:238747/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCgg < 6:27569/116‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCgg > 5:27569/1‑116 (MQ=255) ccAATGACGTGGCCCAGCATTATGACCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTCGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTCCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCTTAAACTGCgg > 4:290952/1‑149 (MQ=255) cAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCggg > 5:80534/1‑149 (MQ=255) tGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGcactctta > 6:87654/1‑144 (MQ=255) cccAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACtt > 6:297981/1‑149 (MQ=255) aTTATGCCCGCTATGGCATGGCCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc > 5:369151/1‑72 (MQ=255) aTTATGCCCGCTATGGCATGGCCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc < 6:369151/72‑1 (MQ=255) ttATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGTCACAATAACTTTCACCTg < 5:345854/149‑1 (MQ=255) tGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCa < 3:290952/148‑1 (MQ=255) tGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCAt > 2:50029/1‑149 (MQ=255) cctgCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGTAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGa < 8:163309/146‑1 (MQ=255) cccGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGa < 5:297981/149‑1 (MQ=255) ccGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAg > 2:345666/1‑149 (MQ=255) gCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGc > 4:230021/1‑149 (MQ=255) tGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGACCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTg > 6:3450/1‑149 (MQ=255) gCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGccc < 5:39557/77‑1 (MQ=255) gCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGccc > 6:39557/1‑77 (MQ=255) cATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGt > 3:109373/1‑149 (MQ=255) cATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGt < 1:345666/149‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGACTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATa < 1:27389/95‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATa > 2:27389/1‑94 (MQ=255) tGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCt < 3:230021/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTa < 6:80534/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTAt < 2:327573/149‑1 (MQ=255) cGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgc > 5:72160/1‑149 (MQ=255) cGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGCGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgc > 7:41372/1‑149 (MQ=255) cGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGCGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgc > 7:35790/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCGACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgcc > 7:225760/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgcc > 2:89953/1‑149 (MQ=255) gCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATgc < 4:109373/148‑1 (MQ=255) gTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGa > 7:36054/1‑129 (MQ=255) gTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGa < 8:36054/129‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGa > 2:16266/1‑149 (MQ=255) ccGGTCGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACAt > 4:165933/1‑149 (MQ=255) tGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGAcc < 1:89953/149‑1 (MQ=255) ttGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCt > 2:172769/1‑108 (MQ=255) ttGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCt < 1:172769/108‑1 (MQ=255) ccACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGccgccg > 8:132983/1‑132 (MQ=255) ccACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGccgccg < 7:132983/132‑1 (MQ=255) aCTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGAc > 4:344929/1‑133 (MQ=255) aCTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGAc < 3:344929/133‑1 (MQ=255) aCTGGAGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGAACCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTAGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGAATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACGCATTCCAGCt > 5:269384/1‑149 (MQ=255) gCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCttt < 4:148785/147‑1 (MQ=255) gCGATGGCCAACCTCGGCGCGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCttt < 8:35790/147‑1 (MQ=255) gCGATGGCCAACCTCGGCGCGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCttt < 8:41372/147‑1 (MQ=255) cGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGc < 7:268327/149‑1 (MQ=255) gATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGc > 1:20179/1‑148 (MQ=255) aTGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCaa < 1:50029/149‑1 (MQ=255) tGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCAAc < 2:20179/149‑1 (MQ=255) gCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCAACt < 3:165933/148‑1 (MQ=255) gTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCAACTGGATCCGCTACaa < 5:261985/149‑1 (MQ=255) | CGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCG‑CTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGATACCTTGCTGCGTTACCTGCGGGCACAATAACTTTCACCTGCATGAGGCCCTGCGTCTATGCCGCCGGACATGACCCATTCCAGCTTTTGCAACTGGATCCGCTACAA > NC_002947/3233544‑3233837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |