| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,275,566 | C→G | 6.1% | intergenic (+48/‑91) | PP_2873 → / → PP_5540 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,275,566 | 0 | C | G | 6.1% | 208.6 / 3.1 | 65 | intergenic (+48/‑91) | PP_2873/PP_5540 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/30); new base G (2/2); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
CGATGCGGTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGATCAACAGC > NC_002947/3275419‑3275707 | cGATGCGGTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGc > 7:305679/1‑148 (MQ=255)cGATGCGGTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGc > 5:120567/1‑148 (MQ=255) tGCGGTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAAt < 7:273510/149‑1 (MQ=255) tgggTAGTGGGGGTGGTTTTTGAGCTCAGGATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCTCCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGTTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAAt < 5:84468/146‑1 (MQ=255) ggTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGAc < 6:120567/149‑1 (MQ=255) gTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGAc > 1:126305/1‑148 (MQ=255) tAGTGGGGGTGGATTTTGAGTTCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGAc > 1:175896/1‑147 (MQ=255) ttGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGc < 1:331249/148‑1 (MQ=255) gggggTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGGCCGCAAATGACCAGc > 2:331249/1‑147 (MQ=255) gTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGtct > 7:155228/1‑149 (MQ=255) gTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGtct > 6:21874/1‑149 (MQ=255) ggATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCGGAAGTAAAGCCCTTTGCCAGTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGtctcc > 2:197712/1‑148 (MQ=255) ttGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACttt < 5:21874/148‑1 (MQ=255) gCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCa > 8:53447/1‑125 (MQ=255) gCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCa < 7:53447/125‑1 (MQ=255) cATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAAt > 6:92066/1‑119 (MQ=255) cATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAAt < 5:92066/119‑1 (MQ=255) cATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCcgcg > 7:197065/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGGAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGt > 2:23014/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGGAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGt > 2:74256/1‑149 (MQ=255) gTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCt < 3:257414/149‑1 (MQ=255) tCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTg < 2:126305/149‑1 (MQ=255) gcGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTg < 8:305679/148‑1 (MQ=255) gttACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTggg < 2:219972/147‑1 (MQ=255) gTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCGTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCTGCTAGTCTCCCTTTCACCGGCCGCGTTTCCTggg > 8:211225/1‑148 (MQ=255) gTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGt > 6:120263/1‑120 (MQ=255) gTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGt < 5:120263/120‑1 (MQ=255) gggCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCATGGGCAACtt < 4:268969/149‑1 (MQ=255) ggcATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCt < 6:307555/149‑1 (MQ=255) gcATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTg > 1:262489/1‑149 (MQ=255) cATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTgg < 4:245442/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGtt < 1:361109/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGc < 8:155228/149‑1 (MQ=255) tttGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGAc > 3:53648/1‑149 (MQ=255) aCCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGAcgc < 7:298306/140‑1 (MQ=255) aCCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGAcgc > 8:298306/1‑140 (MQ=255) cGGTACGGCAGTGCGCCTGCAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGGCGGCTAGAAGGTGCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGGCTCACTTTCACAGGCCGCGCTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTg < 2:304269/149‑1 (MQ=255) cGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTg < 2:175896/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGAGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTAGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTAGGTCCGCAAATGACCAGATAGTCTCACTTTCACAGGACGCGTTTCATGGGCAACTTGTCTTGTTGCAGACGCGACCTCCACTggagg > 5:301916/1‑147 (MQ=255) gAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCAt > 8:4794/1‑147 (MQ=255) gTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTggaggga < 5:61403/134‑1 (MQ=255) gTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTggaggga > 6:61403/1‑134 (MQ=255) tAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCg > 1:222888/1‑148 (MQ=255) aGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATc < 4:53648/149‑1 (MQ=255) tttGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCtttt > 8:55945/1‑149 (MQ=255) cATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGaa < 7:4794/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTc > 2:31940/1‑85 (MQ=255) gTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTc < 1:31940/85‑1 (MQ=255) tCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCt > 4:166878/1‑148 (MQ=255) ggCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGGAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGaa < 1:23014/149‑1 (MQ=255) ggCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGGAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGaa < 1:74256/149‑1 (MQ=255) gCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAAc > 8:43406/1‑149 (MQ=255) aaGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGaa > 4:207096/1‑143 (MQ=255) aaGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGaa < 3:207096/143‑1 (MQ=255) ggTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTGCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTGGTTCGAAGACCTGACCGCTGCgg > 8:328814/1‑148 (MQ=255) ggTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGt > 8:228513/1‑149 (MQ=255) tCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTcc > 6:191012/1‑149 (MQ=255) tGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCttt < 4:311961/121‑1 (MQ=255) tGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCttt > 3:311961/1‑121 (MQ=255) gTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCg < 5:259298/124‑1 (MQ=255) gTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCg > 6:259298/1‑124 (MQ=255) tCCGGTCGTTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGAt < 7:43406/148‑1 (MQ=255) tCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGAt > 6:48008/1‑148 (MQ=255) ggtcggtcCGCAAATGACCAGCTATTCTCACTTTCACATTCCGCGTTTCCTGGGCAACTTTTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCAATTGAGGGAGACTGTGCATGAGCGAATCCTTTATCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGATCAAc < 6:301916/149‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGAt < 1:177902/133‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGAt > 2:177902/1‑133 (MQ=255) gtcCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGATCAACAGc > 4:221153/1‑147 (MQ=255) | CGATGCGGTAGTGGGGGTGGATTTTGAGATCAGCATGCCGTCGGTACAGGGCGGCATGGTCGTGGTATTTGCCACCGGTACGGCAGTGCGCCTGAAGTAAAGCCCTTTGCCATTGGTCGGCTACAAGGTTCTTGTCCGGTCGGTCCGCAAATGACCAGCTAGTCTCACTTTCACAGGCCGCGTTTCCTGGGCAACTTGTCTGGTTGCCGACGCGACCGCCACTGGAGGGAGACTGGGCATGAGCGAATCCTTTTTCGAAGACCTGAACGATGCGTTCCCGATCAACAGC > NC_002947/3275419‑3275707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |