| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,038,399 | C→G | 5.4% | A66A (GCC→GCG) | PP_3559 → | glycine betaine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,038,399 | 0 | C | G | 5.4% | 241.1 / 4.1 | 74 | A66A (GCC→GCG) | PP_3559 | glycine betaine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/35); new base G (2/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
TGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTAC > NC_002947/4038260‑4038544 | tGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGc > 3:336650/1‑148 (MQ=255) ggTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGc > 4:353384/1‑147 (MQ=255) gTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGGCTGCTGGCCTGGCACGCCAg < 5:14137/149‑1 (MQ=255) tCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCGTgccaggccag > 3:56017/1‑148 (MQ=255) tCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCGTGCCAGGCCAGc < 4:56017/149‑1 (MQ=255) tggttggtATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAg > 5:224949/1‑149 (MQ=255) gttggtATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGcc > 8:191581/1‑149 (MQ=255) gttggtATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGcc > 7:314035/1‑149 (MQ=255) ttggtATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCct > 5:179191/1‑149 (MQ=255) ttGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCtgctgc < 5:267293/148‑1 (MQ=255) gAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTgcg > 4:250613/1‑147 (MQ=255) gAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTgcg > 6:212352/1‑147 (MQ=255) gCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTg > 4:82618/1‑149 (MQ=255) accaccTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTg > 3:227462/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCGTGCCAGGCCAGca < 8:337982/119‑2 (MQ=255) ccTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCGTGCCAGGCCAGca > 7:337982/1‑118 (MQ=255) cTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTcgc > 3:66121/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTcgcg > 4:290591/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTcgcg > 8:165611/1‑149 (MQ=255) cgcAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTcgcg < 6:224949/147‑1 (MQ=255) cAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCgctgc < 1:252315/149‑1 (MQ=255) tttGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTgg > 2:164877/1‑149 (MQ=255) ttGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTgg < 3:250613/148‑1 (MQ=255) gTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGctggcctgg < 7:288375/97‑1 (MQ=255) gTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGctggcctgg > 8:288375/1‑97 (MQ=255) gTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCGGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCgctg > 7:311281/1‑142 (MQ=255) gTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCGGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCgctg < 8:311281/142‑1 (MQ=255) gTCTCACCACTTGATGAAACTTCTGGTCGGCCTTGAGAACCTGTTGCGCCTTTTTCCTTGGTGGCTTTTGTTGTTGCTGGTTGTTCTGCTGGCCTTTCACGCCAGCCGCAGCCTTCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGcc < 2:322474/148‑1 (MQ=255) tCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGccc < 3:82618/148‑1 (MQ=255) tGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGa > 5:9302/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATc > 6:255577/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCgg < 3:290591/149‑1 (MQ=255) aGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt < 3:353384/149‑1 (MQ=255) aGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt < 4:336650/149‑1 (MQ=255) gatgctgcAACTGCTGGTCGGCCTGCAGCACCTGTGGCGCCTGTCGCCTTGGTGGCTGTCGTTGCTGCGGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTa < 8:314035/147‑1 (MQ=255) tgcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTc > 3:340279/1‑149 (MQ=255) gcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTgg < 4:160054/131‑1 (MQ=255) gcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTgg > 3:160054/1‑131 (MQ=255) gcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCg > 5:69811/1‑149 (MQ=255) cAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTc < 7:165611/147‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTgg < 1:172907/147‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTgg < 6:69811/147‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGa > 1:174433/1‑148 (MQ=255) ggCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGcc < 6:67900/120‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGcc > 5:67900/1‑120 (MQ=255) ggCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTGGCTGGTGTGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGTTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACaa < 3:325239/149‑1 (MQ=255) ccTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGt < 4:340279/149‑1 (MQ=255) gagaACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt < 8:199796/123‑1 (MQ=255) gagaACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt > 7:199796/1‑123 (MQ=255) gaACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgctgc < 5:255577/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgctg > 5:299337/1‑147 (MQ=255) ccTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCAGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCaca > 3:199436/1‑147 (MQ=255) tGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAcc > 7:253456/1‑149 (MQ=255) ggcTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGGCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGc < 3:245247/112‑1 (MQ=255) gcCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggcc > 5:247543/1‑149 (MQ=255) gcCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggcc < 2:174433/149‑1 (MQ=255) gcCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCCAGCTGCTGGCCCTGATCGGTAAGc > 4:245247/1‑114 (MQ=255) gTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggccctgg > 3:279059/1‑149 (MQ=255) ttGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggccctg < 1:164877/147‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCTGGGGTGGTTGCTGGTGGGGCGGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGGCGCGCGGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTg < 4:66121/149‑1 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCt < 3:337917/72‑1 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCt > 4:337917/1‑72 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTg > 8:310775/1‑145 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTg < 7:310775/145‑1 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCa < 4:279059/149‑1 (MQ=255) gtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGACa < 7:191581/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCTCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTa < 6:299337/149‑1 (MQ=255) gttgttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTACTGACCAGCAccagg < 5:212352/148‑4 (MQ=255) ttgttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGtt < 8:253456/148‑1 (MQ=255) gttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTtgt > 7:308061/1‑149 (MQ=255) gttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTtgt > 5:276747/1‑149 (MQ=255) ttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGGATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTGAGTACCGGTTtgtg > 4:244361/1‑149 (MQ=255) gtggGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTa < 6:179191/147‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCGCTGTGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACtggtgg < 4:227462/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCAGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgct < 2:356557/98‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCAGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgct > 1:356557/1‑98 (MQ=255) gcctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTAc > 4:275567/1‑148 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCgg < 2:43101/123‑1 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCgg > 1:43101/1‑123 (MQ=255) | TGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTAC > NC_002947/4038260‑4038544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |