| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,080,200 | G→A | 6.3% | H193Y (CAC→TAC) | amaC ← | D‑lysine aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,080,200 | 0 | G | A | 6.3% | 186.2 / 2.1 | 63 | H193Y (CAC→TAC) | amaC | D‑lysine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/31); new base A (2/2); total (30/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
ACCAGGCACGGCACGCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGGTGTGCACCT > NC_002947/4080055‑4080346 | aCCAGGCACGGCACGCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgctg > 2:321835/1‑149 (MQ=255) cAGGCACGGCACGCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGAGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgccg > 3:321448/1‑145 (MQ=255) ggcacggcacGCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgctgctg > 3:38891/1‑148 (MQ=255) gcacggcacgCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgctgctg > 2:4514/1‑147 (MQ=255) ggcactCCGGCACGGGCAATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGTAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATc < 3:68629/149‑1 (MQ=255) cgCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCa < 4:38891/149‑1 (MQ=255) cGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCg < 1:321835/149‑1 (MQ=255) cGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAAAGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCg > 6:161683/1‑149 (MQ=255) gcgGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGgcagc < 7:11615/149‑1 (MQ=255) gcgGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGgcag > 2:176560/1‑148 (MQ=255) ggATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCAc > 3:136839/1‑149 (MQ=255) gCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGcagcag > 4:290433/1‑149 (MQ=255) ttCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTACTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTgca < 7:131817/140‑1 (MQ=255) ttCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTACTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTgca > 8:131817/1‑140 (MQ=255) caccaGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGgca > 2:19870/1‑126 (MQ=255) caccaGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGgca < 1:19870/126‑1 (MQ=255) ccaGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTACTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTg > 2:183643/1‑149 (MQ=255) aGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGtt < 1:176560/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTgg > 3:169301/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTACTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGc < 1:183643/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGcc > 2:121089/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGcc > 3:346941/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCg > 1:78876/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgctgc < 7:12389/83‑1 (MQ=255) cGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGtgctgc > 8:12389/1‑83 (MQ=255) gAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGc > 1:160201/1‑149 (MQ=255) gAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGCCCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGc > 7:195615/1‑149 (MQ=255) gAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGc > 8:44724/1‑149 (MQ=255) gAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGATGCCACTGCTGCTGATGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTCTGGCAGCACGGGTGAAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGGTATGCAAGGTGGCCAGCATGc > 6:124252/1‑149 (MQ=255) ggAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGTCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCg < 3:290433/149‑1 (MQ=255) aaCGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTc < 1:5903/149‑1 (MQ=255) aaCGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTc < 7:44724/149‑1 (MQ=255) gggATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGaa < 4:346941/149‑1 (MQ=255) gATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGt > 8:55727/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTccacgcca > 2:200054/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTccacgcca > 4:227452/1‑149 (MQ=255) gTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACgg < 4:268073/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACgg > 3:268073/1‑149 (MQ=255) ccTTGACCTCTTGGACCACTTCTTGCCACTGGTGGTGCTGCAGATCGGCTCCGGTAGTGTTGTGGCAGCACGTGTGGAGGAGTTCCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCGAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGt < 5:124252/148‑1 (MQ=255) cTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTgg > 3:259494/1‑149 (MQ=255) aCCACTTCGCCCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTg < 8:195615/149‑1 (MQ=255) aCCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGGAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTTGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCt < 5:161683/148‑1 (MQ=255) ccACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTgg < 1:4514/149‑1 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAg > 8:208010/1‑50 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAg < 7:208010/50‑1 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGTAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGt > 8:236583/1‑149 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGt > 6:111646/1‑149 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACCcgtggcgtgga < 3:227452/149‑2 (MQ=255) cACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAACTCCACGCCACCcgtggcgtgga < 7:55727/149‑2 (MQ=255) ttCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTg > 2:171442/1‑106 (MQ=255) ttCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTg < 1:171442/106‑1 (MQ=255) cGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGTAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCaaa < 7:236583/148‑1 (MQ=255) gACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCaaa < 4:136839/147‑1 (MQ=255) gACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAg < 2:345514/148‑1 (MQ=255) gACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAg > 5:223153/1‑148 (MQ=255) gACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAg < 6:18620/148‑1 (MQ=255) aCCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTa > 5:315125/1‑149 (MQ=255) ccACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTGCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTAc < 1:200054/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGa < 4:259494/149‑1 (MQ=255) ttgCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAg < 2:160201/148‑1 (MQ=255) ttgCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAg < 6:315125/148‑1 (MQ=255) gCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGgt < 1:121089/148‑1 (MQ=255) ccACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGgtgt > 5:356016/1‑149 (MQ=255) ccACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGgtg < 4:169301/148‑1 (MQ=255) cACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGTAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAg > 8:171408/1‑108 (MQ=255) cACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAg < 7:171408/108‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCaaa > 8:250826/1‑133 (MQ=255) aCTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCaaa < 7:250826/133‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGGTGTGCACCt > 8:227402/1‑149 (MQ=255) | ACCAGGCACGGCACGCCGGCACGGGCCATTTCGCGGATGGCGTAGGCATCTTCCACCAGGCCTTCGGCGAAGCCTTGATAAGCGATGTCGAGGAACGGGATCAGCTGGCGTGCCTTGACCACTTCGACCACTTGTTGCCACTGGTGCTGCTGCAGATCGGCACCGGTAGGGTTGTGGCAGCACGGGTGCAGCAGTACCACGCTGTTGGCCGGCAGGCTCTGCAAGGTGGCCAGCATGCCGTCGAAGTCCACGCCACGGGTGGCCTGGTCAAAGTACGGATAGGTGTGCACCT > NC_002947/4080055‑4080346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |