| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,263,056 | T→A | 6.8% | Q124L (CAG→CTG) | PP_3735 ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,263,056 | 0 | T | A | 6.8% | 231.4 / 4.6 | 77 | Q124L (CAG→CTG) | PP_3735 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/32); new base A (2/3); total (41/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
GGCTTCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTGCGCCAGCGA > NC_002947/4262911‑4263201 | ggCTTCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCTGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTgcg > 1:157028/1‑149 (MQ=255) ttCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTgcgc > 7:173519/1‑147 (MQ=255) ttCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTgcgc > 5:318411/1‑147 (MQ=255) ttCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCACGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTgcgc > 1:264489/1‑147 (MQ=255) tCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAg > 8:124807/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAgg > 2:355416/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCCGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGCGCAGCGCCTggg < 2:296287/149‑2 (MQ=255) aTCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCACCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAgg > 1:47289/1‑148 (MQ=255) tCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGt > 5:365443/1‑148 (MQ=255) cGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGACAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGt > 3:342015/1‑147 (MQ=255) gCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAgccg > 4:328461/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCACACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAgccg < 6:31793/149‑1 (MQ=255) gtcggtTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGACGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATg > 7:45319/1‑149 (MQ=255) ggtTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCgg < 6:353036/149‑1 (MQ=255) ggtTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCgg < 8:173519/149‑1 (MQ=255) gtTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCggg > 2:236914/1‑149 (MQ=255) ttCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGt > 2:318596/1‑149 (MQ=255) cAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATgc > 7:19002/1‑149 (MQ=255) aGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGCGCAGCGcctg < 2:280257/123‑3 (MQ=255) aGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGCGCAGCGcctg > 1:280257/1‑121 (MQ=255) cAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATgccgcc > 8:33102/1‑149 (MQ=255) cAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACCCGCTCCTGCAGGCCGCCACACAGTAGTTCCGGGAAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCCCCCGGTAAGCCGCCCCATCCCCCTCATcccgcc > 5:112965/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGccc > 8:25430/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGc < 7:33102/148‑1 (MQ=255) aGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCACTGCGGGTCATGCCGCCCGGCgaga > 4:294247/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCgaga < 8:19002/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCgaga < 1:318596/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATg > 6:208742/1‑135 (MQ=255) ggCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATg < 5:208742/135‑1 (MQ=255) ccGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACgg > 7:16130/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACgg < 1:236914/149‑1 (MQ=255) gggCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCTGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGc < 2:157028/149‑1 (MQ=255) gggCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGc < 2:152284/149‑1 (MQ=255) ccGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaa < 3:294247/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCGGGGTAACGGCCGTGCAGGTCCGCCTGGCGCAGGGGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCGGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaag < 6:112965/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGCGCAGCGCCTgggcctg < 5:352159/106‑6 (MQ=38) cGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGCGCAGCGCCTgggcctg > 6:352159/1‑101 (MQ=38) ggCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaagg > 6:134912/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaagg < 3:328461/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaagg > 4:133924/1‑148 (MQ=255) aGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGaaggtaag < 3:150355/149‑1 (MQ=255) gcgcACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGTGAGACGGGCCTGGaaggtaagg < 6:365443/149‑1 (MQ=255) gcACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGG‑AAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGtt > 3:332474/1‑148 (MQ=255) cACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTc > 5:277209/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGACGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTc < 8:45319/149‑1 (MQ=255) cGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAg < 2:264489/149‑1 (MQ=255) ggCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAgg < 6:318411/149‑1 (MQ=255) gCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGc < 7:124807/149‑1 (MQ=255) gACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTCACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCTGGGGCTGCGCCAGGTAAGCGGCCCTATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCa < 8:2948/149‑1 (MQ=255) acgaggtgctgctgGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCa < 3:330354/142‑1 (MQ=255) ctgctgctgGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGgctgc < 1:355416/149‑1 (MQ=255) tgGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAg > 2:187028/1‑149 (MQ=255) gccgccAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAg < 5:134912/147‑1 (MQ=255) cgccAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCAAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTCGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTg > 8:71625/1‑149 (MQ=255) ccAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGgctgct < 5:35505/137‑1 (MQ=255) ccAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGgctgct > 6:35505/1‑137 (MQ=255) cAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGgctgc > 7:269765/1‑135 (MQ=255) cAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGgctgc < 8:269765/135‑1 (MQ=255) cAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTAc > 2:332663/1‑149 (MQ=255) aGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTAct < 4:342015/149‑1 (MQ=255) aGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGG‑AAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTActg < 4:332474/149‑1 (MQ=255) aCAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTActgc > 2:139444/1‑149 (MQ=255) ttgttCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGa > 1:145306/1‑148 (MQ=255) cGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAacac > 4:146256/1‑147 (MQ=255) gggTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAg < 1:139444/149‑1 (MQ=255) ggTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGt < 6:83125/132‑1 (MQ=255) ggTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGt > 5:83125/1‑132 (MQ=255) gCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATc > 4:9470/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATc > 5:332972/1‑149 (MQ=255) aGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTc < 8:16130/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGGCCCAGGCGCCGCGCCAGGTAAGCCGCCCCATGCGGGTCACGCCGCCCGGCGAGACGTGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTccc < 4:296144/149‑1 (MQ=255) aGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCg > 3:296144/1‑149 (MQ=255) ggTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGt > 3:260189/1‑149 (MQ=255) aggcccaggcGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTg > 7:155146/1‑149 (MQ=255) ccaggcGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCACGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTgcgc > 1:142579/1‑148 (MQ=255) ggcGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTGCGCCAGc < 2:145306/149‑1 (MQ=255) cgcTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTGCGCCAGCGa < 3:133924/149‑1 (MQ=255) | GGCTTCATCGAGGCTGCCGGTCGGTTCGTCAGCCAATAGCCAGGCCGGGCGCCCGGCAAGCGCACGGCCGATCGCGACGCGCTGCTGCTGGCCGCCAGACAGTTGTTCCGGGTAACGCCCGAGCAGGTCCGCCAGGCCCAGGCGCTGCGCCAGGTAAGCCGCCCAATGCGGGTCATGCCGCCCGGCGAGACGGGCCTGGAAGGTAAGGTTCAGGCCCACGTCCAGGCTGCTGATCAGGTTGTACTGCTGAAACACCAGGCCGATCCCCTCCCGTCGCCACTGCGCCAGCGA > NC_002947/4262911‑4263201 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |