Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,036,267 | C→T | A48A (GCG→GCA) | PP_2648 ← | universal stress protein family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,036,267 | 0 | C | T | 100.0% | 51.4 / NA | 17 | A48A (GCG→GCA) | PP_2648 | universal stress protein family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/9); total (8/9) |
AGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGCGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAAC > NC_002947/3036124‑3036401 | agcagcGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCAt > 3:85507/1‑148 (MQ=255) tGGGTTTTCTCGCCTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCcgcgc > 2:98324/1‑148 (MQ=255) tttCTCGCCTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCa < 6:56586/148‑1 (MQ=255) cTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCTTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGtt < 4:61814/148‑1 (MQ=255) gcggtgcAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTGTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGTGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGaa < 1:105728/142‑1 (MQ=255) aaCAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCgg > 5:47239/1‑148 (MQ=255) atcaGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGt < 6:74591/148‑1 (MQ=255) cAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGc > 7:6757/1‑148 (MQ=255) aCTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCgg > 3:113024/1‑148 (MQ=255) aCTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCgg > 3:110280/1‑148 (MQ=255) aCTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCgg < 2:94651/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTgg < 1:126774/148‑1 (MQ=255) gcTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTgggg > 5:144630/1‑148 (MQ=255) ggTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGGAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGACAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGgc < 2:170611/148‑1 (MQ=255) cGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGc < 4:102815/148‑1 (MQ=255) agCAGGTCCAGCGAGGCCTGGTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGACAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATc < 1:115162/147‑1 (MQ=255) gCGAGGCCTGTTGTGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAAc > 4:129201/1‑148 (MQ=255) | AGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTATCCAGTACGCGTTTCAACAGATCGTCATCAGGCGTCACCAACTGTTTGAGGCGCTCGAAGGGTGCCGGGTTGGCAACGTAGAGCAGGTCCAGCGAGGCCTGTTGCGCATCGCTCAGGTAGGCCGCGCGCTCAGCGGCGTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAAC > NC_002947/3036124‑3036401 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |