Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 100.0% | 139.8 / NA | 42 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (25/17); total (25/17) |
GAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013739‑6014027 | gAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCCCCCCCCCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGCACGCAGTGGC‑GGAACAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGc > 6:266394/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTACCACAGGTGCAGCACAGGGATCGAAAGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAATGCCGCAACCCATTTa > 3:184165/1‑148 (MQ=37) gCTGGAAGGTGGTGTGGGCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGGCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc < 7:88116/148‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGtt < 5:92779/149‑1 (MQ=255) gggtttggtCAGCTTCAGCGAATACAGCCGACACCTGCTTCGCGGGCACTCCCGCTCCCCCAGGGCCTGCACAGGTCTCCAACGCTGTGCC‑GTCCCTGTGGTAGCGGGGGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgccgc < 4:209067/148‑1 (MQ=255) cAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGc < 8:241396/115‑1 (MQ=255) cAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGc > 7:241396/1‑115 (MQ=255) aGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGcc < 5:266394/149‑1 (MQ=255) cATCTAAAAAACGCCCAACCTGCTCCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGTCCCCCACCGGTCTCCAACGCTGGCCC‑GTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaa < 5:41748/149‑1 (MQ=25) tGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt > 5:156938/1‑149 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCAGAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa < 4:77114/149‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCt > 1:50573/1‑149 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc > 2:2147/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 1:202496/1‑149 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 8:71703/1‑148 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgc < 7:81384/80‑1 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgc > 8:81384/1‑80 (MQ=255) gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATcc < 6:156938/149‑1 (MQ=255) cacaGGTCTAGAACGCTCAGCC‑GTACCTGTGGGAGACGGCGTGCCCGCCAAAGGCCGAAACCCTTTTAACTGGTTGCCGCCAGCCAAGCAAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTCAGCCTGCCCCAACTGCATCCg > 2:288506/1‑149 (MQ=255) acaGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc > 6:219281/1‑149 (MQ=255) aGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc < 8:39244/67‑1 (MQ=255) gTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGccc > 8:200534/1‑147 (MQ=255) tctcGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg < 5:219281/149‑1 (MQ=255) gAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑Tgg > 4:10595/1‑149 (MQ=255) gAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑Tgg > 6:231148/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCTCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAATCCACTGCGTCTGCCCCAACTGCATcc < 5:61998/137‑1 (MQ=39) aaCGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATcc > 6:61998/1‑137 (MQ=255) gCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCttt > 4:258856/1‑149 (MQ=255) cc‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATAcc > 5:254398/1‑149 (MQ=255) cc‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATAcc > 4:126062/1‑149 (MQ=255) c‑GTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGGAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACAGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATAccc < 6:227520/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCAt > 1:298097/1‑140 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCAt < 2:298097/140‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCg > 2:142258/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCtt > 7:153786/1‑135 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCtt < 8:153786/135‑1 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑t > 3:72861/1‑124 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑t < 4:72861/124‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGCTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCgg < 1:4225/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCgg > 2:4225/1‑148 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCa > 6:276329/1‑149 (MQ=255) gTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATc > 8:178981/1‑148 (MQ=255) | GAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCC‑GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGG‑TGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013739‑6014027 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |