New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 86750 = | 51 (0.920) | 4 (0.080) | 4/224 | NT | 8.3% | intergenic (‑33/+112) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
? | NC_002947 | 86841 = | 44 (0.910) | intergenic (‑124/+21) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
CGGCAGGGCGAGGATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCC > NC_002947/86604‑86896 | cGGCAGGGCGAGGATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGcc < 3:183309/148‑1 (MQ=255) ggCAGGGCGAGGATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGccc > 1:264490/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGAGGATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCtg > 6:317477/1‑149 (MQ=255) ttcgatgaagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaACCTGTgg < 7:225195‑M1/8‑1 (MQ=255) atgaagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaacc < 1:154793‑M1/2‑1 (MQ=255) atgaagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaacc > 2:154793‑M1/138‑139 (MQ=255) aagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCgg > 8:276595‑M1/135‑148 (MQ=255) gcgcCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAt < 5:317477/148‑1 (MQ=255) cgccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGc < 1:109852/145‑1 (MQ=255) cgccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGc > 2:109852/1‑145 (MQ=255) cgccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:264490/149‑1 (MQ=255) gccgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGcc > 5:312267/1‑149 (MQ=255) cgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcg < 2:188012/149‑1 (MQ=255) gcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc < 6:315330/149‑1 (MQ=255) aGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 4:20798/1‑148 (MQ=255) gCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 6:11373/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGcc > 3:125127/1‑148 (MQ=255) aCCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCa < 3:20798/149‑1 (MQ=255) agcagGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAAcg > 7:130991/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGc > 4:13008/1‑120 (MQ=255) cTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGc < 3:13008/120‑1 (MQ=255) ggCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGc < 6:231875/149‑1 (MQ=255) gCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGcc > 8:15041/1‑149 (MQ=255) cGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt > 6:201873/1‑149 (MQ=255) cGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt < 1:237842/149‑1 (MQ=255) aTTGGCGGGTAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgtgt < 2:283265/149‑1 (MQ=255) gCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACGAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGATTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTcg > 1:102578/1‑149 (MQ=255) cGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTcgcg > 4:288625/1‑149 (MQ=255) ggggAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg < 3:288625/149‑1 (MQ=255) gAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCAGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcg > 8:45159/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgcgc < 1:7612/148‑1 (MQ=255) ccAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgcgc > 2:7612/1‑148 (MQ=255) cAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg < 1:72602/141‑1 (MQ=255) cAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg > 2:72602/1‑141 (MQ=255) tGACGAACGGCAGCAGGAACGAGCGGCGATGCATGTGTCATCCAC‑AATCCTTAAGGCGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATCCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTc < 4:84279/149‑1 (MQ=25) ggAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCca < 7:15041/149‑1 (MQ=255) gAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCca > 7:323677/1‑148 (MQ=255) cgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgcgc > 5:360908‑M1/62‑138 (MQ=255) cgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgcgc < 6:360908‑M1/77‑1 (MQ=255) gggCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAgg < 8:323677/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCTAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAACGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGt > 5:185932/1‑149 (MQ=255) agTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtg > 7:213774/1‑149 (MQ=255) gTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgt < 2:102578/149‑1 (MQ=255) gTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt > 2:36736/1‑147 (MQ=255) gTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 1:36736/147‑1 (MQ=255) gagagGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGc > 5:296199/1‑149 (MQ=255) cGATGCATGGTTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCTTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgtg < 6:312267/149‑1 (MQ=255) tcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgc > 4:342358‑M1/39‑111 (MQ=255) tcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgc < 3:342358‑M1/73‑1 (MQ=255) cATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAt > 2:149509/1‑148 (MQ=255) ggTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAtaaatc > 3:324323/1‑144 (MQ=255) ggTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGATTTGCCGGTGTTCGCCGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAg > 7:152998/1‑149 (MQ=255) cac‑aATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGAGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCt > 8:273896/1‑149 (MQ=255) tCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGATGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 4:123137/127‑1 (MQ=255) tCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGATGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt > 3:123137/1‑127 (MQ=255) cTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACg < 8:213774/148‑1 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCGCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTCGAGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGc > 3:35736/1‑149 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGc > 3:37053/1‑149 (MQ=255) ggggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCAACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTc > 8:43419/1‑148 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCa < 7:21021/144‑1 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGc < 5:201873/148‑1 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGCGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTTAAGGCCTACAgaga > 8:21021/1‑145 (MQ=25) ccAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCAt < 6:296199/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGTCTTTGACGGCCTCCAGGGCATc > 4:193201/1‑149 (MQ=255) gCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATccc > 7:266928/1‑148 (MQ=255) | CGGCAGGGCGAGGATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCA‑GGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCAC‑AATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCC > NC_002947/86604‑86896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |