New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 913067 | 42 (0.760) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.8% | coding (722/948 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase monomer |
? | NC_002947 | = 913096 | 42 (0.800) | coding (751/948 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase monomer |
TGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCT > NC_002947/912923‑913213 | tGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGcccaccc < 5:1986/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAg > 8:194352/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCggg < 2:302451/148‑1 (MQ=255) tgGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGGGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑Gc < 7:194352/148‑1 (MQ=255) aTAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCGTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAg > 8:271179/1‑148 (MQ=255) aaCAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcg < 4:77733‑M2/149‑6 (MQ=255) aaCAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGGCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCGAGCACGGTGGtggcg > 2:241296‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcggg > 4:283678‑M2/1‑142 (MQ=255) aGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgg > 6:266019‑M1/1‑112 (MQ=255) aGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgg < 5:266019‑M1/147‑36 (MQ=255) cTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcag < 5:57952‑M1/149‑44 (MQ=255) ccgcgAAGCGCCTGCTGGTCAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtg < 4:5963/149‑1 (MQ=255) ccgccAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtg < 8:237470/149‑1 (MQ=255) ccgccAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtg < 1:15206/149‑1 (MQ=255) gccAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtggt > 7:315152/1‑149 (MQ=255) gctgGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATgg > 3:157170/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACg < 1:231132/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcggg < 2:241740‑M2/118‑8 (MQ=255) gTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcggg > 1:241740‑M2/1‑111 (MQ=255) gCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCctg > 3:63308/1‑149 (MQ=255) gCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCctg > 3:297567/1‑149 (MQ=255) gTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCctgct > 3:44770/1‑149 (MQ=255) tggtgTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATg < 6:303665/122‑1 (MQ=255) tggtgTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATg > 5:303665/1‑122 (MQ=255) gtgtCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGcc < 7:315382/149‑1 (MQ=255) cGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTgcgc < 7:159056/147‑1 (MQ=255) cAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGAc < 3:77733/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGAc < 4:44770/149‑1 (MQ=255) aGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGAcc > 5:192756/1‑149 (MQ=255) ggCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGa < 3:300276/125‑1 (MQ=255) ggCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGa > 4:300276/1‑125 (MQ=255) ggCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCg < 4:157170/149‑1 (MQ=255) gCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCgg < 8:315152/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGa < 5:325018/142‑1 (MQ=255) gTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGa > 6:325018/1‑142 (MQ=255) gTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCggg > 7:50360/1‑148 (MQ=255) aGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCAc < 2:10056/149‑1 (MQ=255) ttGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGa < 7:310296/75‑1 (MQ=255) ttGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGa > 8:310296/1‑75 (MQ=255) ttGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTg > 7:271695/1‑149 (MQ=255) ttCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGCGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCAt > 6:207299/1‑149 (MQ=255) cAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATc < 8:271695/148‑1 (MQ=255) tCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATcgcc > 1:249557/1‑149 (MQ=255) tCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGTGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATcgccg > 8:54731/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGttc > 7:190657/1‑148 (MQ=255) ccTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTa < 5:242385/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGCCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGttc > 6:338472/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcag < 5:57952‑M2/149‑107 (MQ=255) cTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTAc > 2:197927/1‑149 (MQ=255) gcccgcccACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGt < 4:297567/149‑1 (MQ=255) cccgcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctg > 4:283678‑M1/1‑7 (MQ=255) cccgcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccac < 2:241740‑M1/118‑112 (MQ=255) cccgcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccac > 1:241740‑M1/1‑7 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgct < 5:266019‑M2/147‑113 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgct > 6:266019‑M2/1‑35 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTg > 3:314261/1‑149 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTg > 8:243068/1‑149 (MQ=255) cgcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctgtt < 4:77733‑M1/149‑145 (MQ=255) cgccaccaccgtgctcgcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgccgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctgtt > 2:241296‑M1/1‑5 (MQ=255) cccacccaAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCt < 4:314261/149‑1 (MQ=255) | TGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTT‑GCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCT > NC_002947/912923‑913213 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |