New junction evidence | |||||||||||
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TCTCGACGATCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGG > NC_002947/1669113‑1669404 | tctcGACGATCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGc > 1:306005/1‑148 (MQ=255) tctcGACGATCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGc > 5:26749/1‑148 (MQ=255) tcGACGATCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAg > 3:332919/1‑149 (MQ=255) gacgaTCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGt > 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tcatcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATc < 7:92046/149‑1 (MQ=255) tcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGTGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAc > 6:75065/1‑149 (MQ=255) tcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAc < 4:302874/149‑1 (MQ=255) aaCCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAcc < 5:300555/148‑1 (MQ=255) cAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGAGGTTATGGTTGTAAAGCCCTTCGCAGGCAGCCTGGAAGATCGCGACGCTGGGTTTCCCTATTCGGTGGAATTTGTGCTGGCAATAGAccaag > 1:277335/1‑145 (MQ=255) aGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGaa < 7:302470/149‑1 (MQ=255) gACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAg > 3:249407/1‑148 (MQ=255) gAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGCTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAgg > 6:244240/1‑149 (MQ=255) aacTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGcgaacagttgttcgtcctggttgatgaccttcagacctaccaactggtaccagtagtactcgtcagcagccaggttgggcaaaaggctccgcgg < 5:54704‑M2/133‑95 (MQ=255) aacTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGcgaacagttgttcgtcctggttgatgaccttcagacctaccaactggtaccagtagtactcgtcagcagccaggttgggcaaaaggctccgcgg > 6:54704‑M2/1‑39 (MQ=255) aacTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGt > 4:75925/1‑148 (MQ=255) cTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGcgaacagttgttcgtcctggttgatgaccttcagacctaccaactggtaccagtagtactcgtcggcagccag < 1:338856‑M2/110‑74 (MQ=255) cTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGcgaacagttgttcgtcctggttgatgaccttcagacctaccaactggtaccagtagtactcgtcggcagccag > 2:338856‑M2/1‑37 (MQ=255) tGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATg < 3:48649/149‑1 (MQ=255) ttCGcaccggtctccaacaggtgatcgaccttgccgaacagttgttcgtcctggttgatgaccttcagacctaccaactggtaccagtagtactcgtcggcagccaggttgggcaaaaggctccgcgggatgcagatttcgtaaccgct > 1:55569‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCgg < 1:137124/148‑1 (MQ=255) | TCTCGACGATCGCGATGAAGCCCGTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGATCGCGAGCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGG > NC_002947/1669113‑1669404 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |