New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1784165 = | 36 (0.650) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 9.1% | coding (736/783 nt) | map | methionine aminopeptidase |
? | NC_002947 | 1784216 = | 45 (0.850) | coding (685/783 nt) | map | methionine aminopeptidase |
GGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGTCATG > NC_002947/1784019‑1784310 | gggCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGAtct > 3:8602/1‑149 (MQ=255) gggCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGAtc < 1:144129/148‑1 (MQ=255) gcagatcctccactatggccgcgctggcactggcatggagctgaaggaaggcatgaccttcaccatcgagccgatgatcaaccagggcaaggccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagctct < 5:313961‑M1/3‑1 (MQ=255) gcagatcctccactatggccgcgctggcacgggcatggagctgaaggaaggcatgaccttcaccatcgagccgatgatcaaccagggcaaggccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagctct < 2:129291‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGAtctc < 4:12731/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGAACTGGCCACGGTCGACCAGCTCGGGGTCCCCCTGGGGCCTCGCGTCACGGTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGAGGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAg > 2:89859/1‑149 (MQ=255) gCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTcaccac > 6:59167/1‑149 (MQ=255) gAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAgtgt < 1:52590/148‑1 (MQ=255) gAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAgtgt < 5:156394/148‑1 (MQ=255) gTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGc > 3:133323/1‑149 (MQ=255) ggaaggcatgaccttcaccatcgagccgatgatcaaccagggcaaggccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagcTCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGcc < 5:367178‑M1/47‑1 (MQ=255) cACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCga < 7:42505/149‑1 (MQ=255) cACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCga < 4:8602/149‑1 (MQ=255) tGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTgg > 7:140790/1‑111 (MQ=255) tGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTgg < 8:140790/111‑1 (MQ=255) tgaccttcaccatcgagccgatgatcaaccagggcaaggccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagcTCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTg > 6:367178‑M1/94‑149 (MQ=255) gCATCGCGTCACGTGCCTGTCGTGGGGTGGCCTGGCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGc < 4:281770/149‑1 (MQ=255) cATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCg > 2:248087/1‑149 (MQ=255) tCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTg < 1:248087/149‑1 (MQ=255) cACGTTCCTGGCGTGGGGGGGCCTGGCGGGGTGCGGGCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGGGTCGTCCTTGCGCAGGGTGCAGATCTCGTAGCCAGGGGTCGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTg < 1:89859/149‑1 (MQ=255) gTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCaaa > 7:74911/1‑109 (MQ=255) gTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCaaa < 8:74911/109‑1 (MQ=255) gTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGa > 5:41665/1‑149 (MQ=255) gTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGa < 7:157060/149‑1 (MQ=255) tCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGAGCGCGGGATGGTGTGGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATg > 1:217233/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATg < 4:133323/148‑1 (MQ=255) gTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATgg > 8:179180/1‑146 (MQ=255) gTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATgg < 7:179180/146‑1 (MQ=255) gTGGGGTTGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGATGTGCGCGGGATGGTGTTGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGGCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTc < 2:217233/148‑1 (MQ=255) gTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCg > 4:64354/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGGGGTGCGGTAAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCGACTGGGCCGAGAGCTTGCGGAGCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCg > 2:175722/1‑149 (MQ=255) tGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑AGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGcc > 6:216842/1‑148 (MQ=255) tCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAg < 5:59167/149‑1 (MQ=255) gccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagcTCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGc < 3:61294‑M1/53‑1 (MQ=255) gccgacaccaaggtgctgggcgacggctggaccgccatcaccaaggaccgcaagcTCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGc > 4:61294‑M1/56‑108 (MQ=255) ggTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCAcc < 3:64354/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCGGCCGAAGGGCGCGGGCTTGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTg < 8:234038/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTg < 3:125675/148‑1 (MQ=255) aTGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCAAGACG‑AATAAAAAAAAAAAATAATTTCCCACCGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGat > 8:219800/1‑149 (MQ=255) ttGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGAt > 1:129291/1‑149 (MQ=255) ttGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGAt > 3:87918/1‑149 (MQ=255) aGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGaa < 5:216842/149‑1 (MQ=255) gTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGt < 4:87918/149‑1 (MQ=255) tGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGt > 3:196597/1‑148 (MQ=255) tGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGTc < 1:8049/149‑1 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAg > 6:150949/1‑82 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAg < 5:150949/82‑1 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATg > 3:113294/1‑136 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATg > 3:139878/1‑136 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATg < 4:139878/136‑1 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATg < 4:113294/136‑1 (MQ=255) gATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCAAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGTCATg > 6:362024/1‑148 (MQ=255) | GGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGG‑CGGTCACCACCAAAGTGTGTTCCCACTGGGCCGAGAGCTTGCGGTCCTTGGTGATGGCGGTCCAGCCGTCGCCCAGCACCTTGGTGTCGGCCTTGCCCTGGTTGATCATCGGCTCGATGGTGAAGGTCATG > NC_002947/1784019‑1784310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |