New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3577225 = | 42 (0.760) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.7% | coding (611/792 nt) | PP_3157 | inositol monophosphatase family protein |
? | NC_002947 | 3577279 = | 44 (0.830) | coding (665/792 nt) | PP_3157 | inositol monophosphatase family protein |
CGCCACACTGATGTGCACCACGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCAT > NC_002947/3577079‑3577370 | caggagcgaagaacccggatcacatggcgtggcgcaacatctccagcacctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgat < 7:162651‑M1/1‑1 (MQ=255) gccACACTGATGTGCACCACGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATCCCTTATGGCGGTGATTGCTATGACTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTAAt > 4:313419/1‑149 (MQ=255) aggagcgaagaacccggatcacatggcgtggcgcaacatctccagcacctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgatga < 6:321155‑M1/3‑1 (MQ=255) ggagcgaagaacccggatcacatggcgtggcgcaacatctccagcacctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgatgat > 3:107762‑M1/146‑149 (MQ=255) gagcgaagtacccgtatcacatggcgtggcgcaacatctccagcagctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggcgaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttctaTGAtc > 8:320170‑M1/145‑149 (MQ=255) gcgaagaacccggatcacatggcgtggcgcaacatctccagcacctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgaTGAtcg > 7:81801‑M1/143‑148 (MQ=255) gcgaagaacccggatcacatggcgtggcgcaacatctccagcacctgcgcatgcagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgaTGAtcg < 8:81801‑M1/6‑1 (MQ=255) cacTGATGTGCACCACGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGAtcgtc < 1:313564/149‑1 (MQ=255) gATGTGCACCACGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAg > 2:281162/1‑149 (MQ=255) caccacGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGc < 8:26701/148‑1 (MQ=255) acGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCa < 7:215296/149‑1 (MQ=255) cGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGTCTTCAGCCGTATGACGTa > 4:211159/1‑148 (MQ=255) acacCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGAtcgt > 8:2470/1‑118 (MQ=255) acacCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGAtcgt < 7:2470/118‑1 (MQ=255) acacCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAg > 5:56127/1‑149 (MQ=255) cacCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGACCCTTCAGCCGTATGACGTACAgg > 6:93138/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGcc > 7:104251/1‑148 (MQ=255) gcAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGcc > 3:137047/1‑148 (MQ=255) cATTCGAAGCGGTCGCCGGCTATGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGTTTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGTCT‑TTGTCGACGTGATGGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCTCTGATGCCGATCATCGaa < 3:313419/149‑1 (MQ=255) cagcacagggtcaccacaggccaccacacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgaTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAg > 5:159630‑M1/90‑149 (MQ=255) gAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGc > 6:177802/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTg < 7:31510/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGa < 1:281162/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGAt > 8:15143/1‑148 (MQ=255) cAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATCCTGGCCTCGCGCTATGGACGACCTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGAt > 1:285974/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACg < 7:15143/149‑1 (MQ=255) ggTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTgg < 8:104251/149‑1 (MQ=255) acacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgaTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCg > 4:166349‑M1/65‑121 (MQ=255) acacacccgccatcctgcgccgaactgccatcccacgccgtgatcacgccacccgccccttcgaTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCg < 3:166349‑M1/57‑1 (MQ=255) tGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGAGGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATgg < 1:143107/148‑1 (MQ=255) tGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATgg > 3:111354/1‑148 (MQ=255) cGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAg > 2:217107/1‑149 (MQ=255) ttATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGtt < 1:217107/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGgc < 4:137047/148‑1 (MQ=255) aTTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGAt < 4:111354/149‑1 (MQ=255) cTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGAGGGCg > 8:162651/1‑149 (MQ=255) tGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGTCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCgg < 3:211159/147‑1 (MQ=255) cTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTgtgg < 5:4300/149‑1 (MQ=255) cATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTgtggtg < 5:177802/148‑1 (MQ=255) cATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGtggtgg > 6:322139/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATgg > 8:274798/1‑108 (MQ=255) cTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATgg < 7:274798/108‑1 (MQ=255) cTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGgtgtg > 3:13348/1‑134 (MQ=255) cTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGgtgtg < 4:13348/134‑1 (MQ=255) cTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTgtggt > 3:300661/1‑148 (MQ=255) t‑ttGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCtgt > 2:198415/1‑149 (MQ=255) t‑ttGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCtgt > 8:155037/1‑149 (MQ=255) tGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGtgc > 5:363434/1‑149 (MQ=255) tCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGtgctg > 5:321155/1‑149 (MQ=255) tCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGtgctg < 5:322139/149‑1 (MQ=255) tCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGtgct < 6:363434/148‑1 (MQ=255) tCGAAGTGATGGTGGAAGCGATCCTTGTGCCGTATGACGTTGTCGTGGTGTTGCCGATCATCGAAGGGGCGGGGGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGGTGTTCGGCGGAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGtgctg < 2:285974/149‑1 (MQ=255) aCGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCAt > 6:76947/1‑149 (MQ=255) | CGCCACACTGATGTGCACCACGCCGGACATGTTCGACACCGCCGAGCGCAAGGCGGCATTCGAAGCGGTCGCCGGCAAGGCGCGGTTGATGCGTTATGGCGGTGATTGCTATGCCTACTGCATGCTGGCCTCGGGCT‑TTGTCGACGTGATCGTCGAAGCGAGCCTTCAGCCGTATGACGTACAGGCGCTGATGCCGATCATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCAT > NC_002947/3577079‑3577370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |