New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4845761 = | 66 (1.190) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.5% | coding (511/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4845823 = | 51 (0.940) | coding (573/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
CGAAGCGCGCCTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGCATGCCATC > NC_002947/4845616‑4845889 | cGAAGCGCGCCTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGccc > 3:321046/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCGCCTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCg < 7:216856/149‑1 (MQ=255) gcCTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGTCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAAc < 1:85359/149‑1 (MQ=255) cTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCg < 7:209422/149‑1 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGcc < 6:166186/145‑1 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGcc > 5:166186/1‑145 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑a < 6:182756/148‑1 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑Ac > 5:340977/1‑149 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑Ac > 8:274263/1‑149 (MQ=255) cAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑Ac < 7:274263/149‑1 (MQ=255) ggcgcgcagctgtagaacacgatgggaattgtcaggaacagcgccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtgtcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcg < 8:323200‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcgcgcagctgtagaacacgatgggaattgtcaggaacagcgccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtgtcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcg > 7:323200‑M1/124‑124 (MQ=255) aCCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑Acgccgc > 8:296445/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑g > 1:325639/1‑149 (MQ=255) cctcctGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑gg > 5:225887/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑ggg > 3:223102/1‑149 (MQ=255) ggATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGgctgc > 6:82239/1‑149 (MQ=255) gATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGA‑CAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGctgctg > 6:291011/1‑149 (MQ=255) aTGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGctgctg < 2:196188/149‑1 (MQ=255) ttgtcaggaacagcgccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtggcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcGCCTGG‑‑‑AACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTc > 2:46991‑M1/96‑149 (MQ=255) aCAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTgg < 2:325639/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGc > 1:26994/1‑109 (MQ=255) cAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGc > 1:32510/1‑109 (MQ=255) cAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGc < 2:26994/109‑1 (MQ=255) cAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGc < 2:32510/109‑1 (MQ=255) aaGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGtt > 2:111341/1‑149 (MQ=255) gcagcTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTcc < 4:321046/149‑1 (MQ=255) gcTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAAc > 4:238575/1‑100 (MQ=255) gcTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAAc < 3:238575/100‑1 (MQ=255) cTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGc > 7:238683/1‑149 (MQ=255) acagcgccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtgtcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcGCCCGAGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGc < 6:100901‑M1/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCga < 8:238683/148‑1 (MQ=255) agcgccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtgtcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCgat > 8:42991‑M1/85‑149 (MQ=255) gccacccagcgcaggatggcatgcaactcgggtgtcaggtcgatgttgaattccggccaagtggccatggtcgccatcatcGCCCGCGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCgatgat > 5:100901‑M1/82‑149 (MQ=255) cTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGA‑CAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGatgatg < 5:291011/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATgg < 6:340977/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGatgatg < 7:296445/147‑1 (MQ=255) gcCTCCTCCCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTCCCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGAcc < 4:268447/149‑1 (MQ=255) tcctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGAcc > 2:313679/1‑146 (MQ=255) tcctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGAcc < 1:313679/146‑1 (MQ=255) cctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATgg > 8:69289/1‑149 (MQ=255) cctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATgg > 2:158262/1‑149 (MQ=255) cctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCGGCGGTGGTGCCAGGCGAGGAAGGCGCCCAggg > 7:225001/1‑149 (MQ=255) ctcGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATgg < 6:84949/148‑1 (MQ=255) cGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACtt > 5:102241/1‑149 (MQ=255) cGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCg < 4:223102/147‑1 (MQ=255) aGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTc < 6:225887/149‑1 (MQ=255) aGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTc < 5:82239/149‑1 (MQ=255) aTCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCGACTTGGc > 7:42524/1‑139 (MQ=255) aTCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGc < 6:179015/139‑1 (MQ=255) aTCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGc < 8:42524/139‑1 (MQ=255) aTCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGAACAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGc > 5:179015/1‑139 (MQ=255) cGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACa > 2:298873/1‑149 (MQ=255) gCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCTT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCGGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATc < 4:28840/149‑1 (MQ=255) gCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCg > 5:104616/1‑119 (MQ=255) gCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCg < 6:104616/119‑1 (MQ=255) gCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATc > 7:181038/1‑149 (MQ=255) tACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCgatga < 8:186096/112‑1 (MQ=255) tACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCgatga > 7:186096/1‑112 (MQ=255) gccgccCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCggg > 6:109128/1‑87 (MQ=255) gccgccCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCggg < 5:109128/87‑1 (MQ=255) cgccCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGa > 7:190764/1‑149 (MQ=255) ccACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGacac < 8:181038/149‑1 (MQ=255) aCCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCAGAGAAATTGGCCCGTTAAAACCTCAGCGCCATCACCCCGCCTGGGGCTTCCGGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGac < 1:111341/149‑1 (MQ=255) cTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGt < 7:69289/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGtt < 1:140014/147‑1 (MQ=255) ccAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGc < 1:158262/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGCa < 1:298873/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGCa < 6:102241/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGCATGCCATc > 4:284202/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAAt < 8:10849/113‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAAt > 7:10849/1‑113 (MQ=255) cgAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGc < 2:76868/98‑1 (MQ=255) cgAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGc > 1:76868/1‑98 (MQ=255) | CGAAGCGCGCCTGAACCTGTCCAATCACCGCCTGCTGCTGAACTGGGATGACAAGCAGCTACCGCTGTCGCGCCTCCTCGCCGAACTTCGCCAGATCGGCTACGCCGCCCACCCCTACCAGCCTGACCAGGCCGCCGAGCAATTGGCCCGGGAAAACCGCAGCGCCCT‑ACGCCGCCT‑GGGCGT‑‑GGCCGGGCTGCTGTGGTTCCAGGCGATGATGGCGACCATGGCCACTTGGCCGGAATTCAACATCGACCTGACACCCGAGTTGCATGCCATC > NC_002947/4845616‑4845889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |