New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5477090 = | 26 (0.470) | 7 (0.190) | 6/174 | NT | 41.7% | intergenic (+3/+109) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 5477189 = | 2 (0.050) | intergenic (+102/+10) | PP_4813/PP_4814 | PAP2 family protein/DedA family protein/ATP‑dependent protease La domain‑containing protein |
TCAGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGC > NC_002947/5476942‑5477176 | ctggccaatcagctggcgtacctgttgccgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtat > 5:21863‑M1/149‑149 (MQ=255) aGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTg > 7:188006/1‑149 (MQ=255) agctggcgtacctgttgccgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGcc < 2:34081‑M1/11‑1 (MQ=255) aTTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGc < 7:163928/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGATGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCtgtg > 8:330146/1‑147 (MQ=255) ggTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGc > 6:279834/1‑149 (MQ=255) gTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGc < 8:188006/148‑1 (MQ=255) gtacctgttgccgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTAt < 3:333771‑M1/18‑1 (MQ=255) aCGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTc < 6:194903/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTcgcg > 6:92665/1‑149 (MQ=255) ccgttcatggaagaggacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTa < 1:140569‑M1/27‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTc < 5:279834/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTaaa < 3:191423/136‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTaaa > 4:191423/1‑136 (MQ=255) tGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCgg > 1:70802/1‑130 (MQ=255) tGCCGCTGCGGGTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCgg < 2:70802/130‑1 (MQ=255) gacaagctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCa < 4:264564‑M1/43‑1 (MQ=255) gctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:73404‑M1/102‑138 (MQ=255) gctggacctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:73404‑M1/37‑1 (MQ=255) ggTGTGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATcgcg < 8:289910/149‑1 (MQ=255) acctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTaaa < 5:203576‑M1/29‑1 (MQ=255) acctgctgaccctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTaaa > 6:203576‑M1/97‑125 (MQ=255) gtgtGATGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGGAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCgcgc < 7:330146/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCg > 7:273344/1‑147 (MQ=255) gCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTa < 5:92665/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTGCCGGCATTCTTGGCTCTTCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAg < 3:225770/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATcg > 8:3995/1‑136 (MQ=255) tGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATcg < 7:3995/136‑1 (MQ=255) ctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtatt < 6:11234‑M1/2‑1 (MQ=255) ctcgattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggtgctgtatt > 5:11234‑M1/86‑87 (MQ=255) gcttcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGa > 6:296708‑M1/83‑147 (MQ=255) gattcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAg > 3:264564‑M1/83‑148 (MQ=255) ttcgccacagcagcggctgggcgagatccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCgg > 1:155405‑M1/81‑149 (MQ=255) ttGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCgg < 8:273344/149‑1 (MQ=255) ccGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGc < 4:325431/91‑1 (MQ=255) ccGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGc > 3:325431/1‑91 (MQ=255) gCGGGGCGCTGCTGGGGTTCTTCGCGATTCATGCGTTGCCGCATGCGTTGGTTAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTAcc < 8:56528/146‑1 (MQ=38) tccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGa > 8:170385‑M1/55‑119 (MQ=255) tccagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGa < 7:170385‑M1/65‑1 (MQ=255) cagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGt < 5:140938‑M1/71‑1 (MQ=255) cagaagctgctggagcggattcagggggagttgttcgcctgatggttctgtaTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGt > 6:140938‑M1/53‑123 (MQ=255) catgcatgCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGttt > 1:355593/1‑118 (MQ=255) catgcatgCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGttt < 2:355593/118‑1 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGc > 2:114758/1‑106 (MQ=255) tCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGc < 1:114758/106‑1 (MQ=255) | TCAGCCTGACATTGGTGCAACGCCAGCAGACCCTGCCAGCCCTGCCGCTGCGGGTGTGGTGGCTGGTGTTGCCGGCATGCGTGGCGCTGCTGGCGTTCTTCGCCATGCATGCGTTGCCGCAGGCGTTGGTCAGGTATCAATATTGATGTTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCACGGGATCGCGCTTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGC > NC_002947/5476942‑5477176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |