New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6031197 = | 50 (0.900) | 5 (0.090) | 4/244 | NT | 9.8% | coding (51/1590 nt) | dppA‑IV | dipeptide transport protein |
? | NC_002947 | 6031232 = | 44 (0.830) | coding (86/1590 nt) | dppA‑IV | dipeptide transport protein |
AAAAAAGGGTGTGGTCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCGCAAGGC > NC_002947/6031053‑6031341 | ccgtccagctggtcgccaggctcggcaccaccttgccttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTg > 6:192427‑M1/145‑149 (MQ=255) gctggtcgccaggctcggcaccaccttgccttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTGCCCAGGc < 5:358092‑M1/12‑1 (MQ=255) aTTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGCCTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACGTTCCTTATTGTTCCCCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCCGGccgctccgct > 6:196414/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccgct < 6:116317/149‑1 (MQ=255) aTTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccgc < 5:332299/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGccgctccgct > 1:348955/1‑147 (MQ=255) tGCCGGCGGGCGCACTAGGTTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGa < 6:366860/148‑1 (MQ=255) tGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTTGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGa < 5:281123/148‑1 (MQ=255) ggcgggcgCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGCGCGtt > 2:216470/1‑149 (MQ=255) gcgggcgCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGttt < 7:282696/149‑1 (MQ=255) gcACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGc > 6:360834/1‑148 (MQ=255) cttgccttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGa > 6:358092‑M1/114‑149 (MQ=255) aCTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg < 3:119666/149‑1 (MQ=255) tAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTAACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGc > 5:57687/1‑122 (MQ=255) tAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTAACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGc < 6:57687/122‑1 (MQ=255) gccttgcgccgcatcgaactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg > 7:24367‑M1/111‑147 (MQ=255) gggTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGc < 5:360834/147‑1 (MQ=255) ttCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAg < 2:348955/147‑1 (MQ=255) cAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTc > 7:330147/1‑149 (MQ=255) cAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTc > 5:83497/1‑149 (MQ=255) aactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg < 6:262881‑M1/37‑1 (MQ=255) aactccaccaggcggttcatcagcacgtcggcggtggcgttggtggtggtgagcgaattgtactggaccacgtcgaagccttcggggctggcctCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAg > 5:262881‑M1/95‑131 (MQ=255) gACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGa < 8:193281/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTc < 6:141188/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTc < 6:135598/149‑1 (MQ=255) gCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTcc < 5:149932/147‑1 (MQ=255) gCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAg > 5:349253/1‑149 (MQ=255) aGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGt > 7:64035/1‑148 (MQ=255) gCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTc > 7:213907/1‑149 (MQ=255) aGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGc > 4:153092/1‑104 (MQ=255) aGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTcaccac > 4:247680/1‑149 (MQ=255) aGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTcaccac > 2:250067/1‑149 (MQ=255) ccAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACg > 8:288252/1‑122 (MQ=255) ccAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACg < 7:288252/122‑1 (MQ=255) ccaccaTGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAGCGCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGc < 1:250067/149‑1 (MQ=255) ccaccaTGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTgg > 2:87870/1‑117 (MQ=255) ccaccaTGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTgg < 1:87870/117‑1 (MQ=255) tGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCAccgcc < 6:83497/149‑1 (MQ=255) gccgcACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCt < 8:155907/149‑1 (MQ=255) ccgcACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCt > 2:192292/1‑148 (MQ=255) aCTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgatga < 3:247680/149‑1 (MQ=255) tttCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAAc > 3:331566/1‑149 (MQ=255) ttCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAAcc > 3:323942/1‑149 (MQ=255) cTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGcc < 8:330147/149‑1 (MQ=255) cTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGcc > 8:75423/1‑149 (MQ=255) ttATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgatg < 6:109684/141‑1 (MQ=255) ttATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCtgatg > 5:109684/1‑141 (MQ=255) ttGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCtgg < 8:64035/148‑1 (MQ=255) gTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCtggtg > 5:4357/1‑148 (MQ=255) caccCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTc > 7:196504/1‑148 (MQ=255) caccCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTc > 3:146696/1‑148 (MQ=255) tGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTACAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCGCCACCCACGCCCCCGCCGCCGTGCTGATGAACCGGCGGGTGGGGGTCgcgggg > 8:177102/1‑144 (MQ=255) gTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCCCCACCAACGCCCCCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCgggtg > 4:250567/1‑136 (MQ=255) gTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCtggtg < 3:250567/136‑1 (MQ=255) ttCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATgcgg < 4:331566/148‑1 (MQ=255) ccgcTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTGCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCgcaa < 5:196414/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCgcaaggc < 8:213907/149‑1 (MQ=255) | AAAAAAGGGTGTGGTCATTTGCCGGCGGGCGCACTAGGGTAAGCCTTTTCCAGACTGCACTGGCAGATGGGCCACTGACAGCCAAGGAGCCACCATGCGTGTCGCCGCACTTTCCTTATTGTTCACCACCCTGTTCGCCGCTGGCGCTGCCCAGGCCGCTCCGCTGAGCGTTTGCAGCGAGGCCAGCCCCGAAG‑GCTTCGACGTGGTCCAGTACAATTCGCTCACCACCACCAACGCCACCGCCGACGTGCTGATGAACCGCCTGGTGGAGTTCGATGCGGCGCAAGGC > NC_002947/6031053‑6031341 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |