New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1925936 = | 62 (1.120) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 6.4% | coding (930/1065 nt) | PP_1726 | ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1926006 = | 57 (1.080) | coding (860/1065 nt) | PP_1726 | ABC transporter substrate‑binding protein |
GGCTTCCCAGGCTTCGGCATTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGTTCACGG > NC_002947/1925858‑1926146 | cggctataccacggtcatcaacaagtacgccaagcaccccaacgcggccaagctgacccgtgaatacatcttcagcgaCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGt > 2:226259‑M1/79‑149 (MQ=255) cAGGCTTCGGCATTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTg > 4:165884/1‑147 (MQ=255) ggCTTCGGCATTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGa < 3:232203/149‑1 (MQ=255) cATTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCa < 8:112713/149‑1 (MQ=255) aTTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTg < 6:181152/136‑1 (MQ=255) aTTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTg > 5:181152/1‑136 (MQ=255) aTTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCAc > 6:146387/1‑149 (MQ=255) aacaagtacgccaagcaccccaacgcggccaagctgacccgtgaatacatcttcagcgaCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTc < 7:107709‑M1/72‑1 (MQ=255) aacaagtacgccaagcaccccaacgcggccaagctgacccgtgaatacatcttcagcgaCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTc > 8:107709‑M1/60‑131 (MQ=255) cTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACgg < 6:259294/148‑1 (MQ=255) tCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTCTTCACGGGTCAGc > 6:252864/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGa < 5:264026/126‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGt < 7:178254/142‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGt > 8:178254/1‑142 (MQ=255) cAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTGGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGAGCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTg < 5:109456/149‑1 (MQ=255) gCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTggg < 2:322348/149‑1 (MQ=255) aCTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGc > 8:27161/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCtt > 4:5638/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCtt > 7:297081/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGa > 1:135167/1‑107 (MQ=255) gTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGa < 2:135167/107‑1 (MQ=255) gTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTg < 3:325659/148‑1 (MQ=255) gTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTg < 2:293934/148‑1 (MQ=255) ggCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGc > 3:87646/1‑143 (MQ=255) ggCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGc < 4:87646/143‑1 (MQ=255) gcagcaGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACttg > 1:208812/1‑149 (MQ=255) gcagcTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACttgttg < 5:252864/149‑1 (MQ=255) ccTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGt > 2:71116/1‑93 (MQ=255) ccTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGt < 1:71116/93‑1 (MQ=255) ccTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTg < 5:146387/149‑1 (MQ=255) tGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTgg > 2:255285/1‑148 (MQ=255) tGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTg < 3:352613/147‑1 (MQ=255) tGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTg > 4:352613/1‑147 (MQ=255) gacgccgggcagatcaacctggccaagggccatgcgcggccgatccgggccgagcacctgaagctgccggcgTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACttgtt > 8:107709‑M2/73‑131 (MQ=255) gacgccgggcagatcaacctggccaagggccatgcgcggccgatccgggccgagcacctgaagctgccggcgTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACttgtt < 7:107709‑M2/59‑1 (MQ=255) ccgccgGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCg > 1:148207/1‑149 (MQ=255) acgccgggcagatcaacctggccaagggccatgcgcggccgatccgggccgagcacctgaagctgccggcgTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCg > 2:226259‑M2/72‑149 (MQ=255) GCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATc < 4:79703‑M1/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCAcc < 4:232263/149‑1 (MQ=255) cTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGcc > 6:176669/1‑94 (MQ=255) cTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGcc < 5:176669/94‑1 (MQ=255) ttCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCAcc > 2:337085/1‑147 (MQ=255) tCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGTAATCACCGAg > 5:148202/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAg < 6:206564/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAg < 3:79703/148‑1 (MQ=255) cGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAg < 2:148207/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGTTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAgg < 5:197190/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAgg < 3:5638/149‑1 (MQ=255) ggATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATc < 3:165884/149‑1 (MQ=255) ggATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATc < 7:27161/149‑1 (MQ=255) ggATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATc < 1:337085/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAg > 2:8437/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAg < 2:208812/149‑1 (MQ=255) cgcggccgatccgggccgagcacctgaagctgccggcgTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCAc < 1:226259‑M2/110‑1 (MQ=255) gcATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCaa > 1:282842/1‑148 (MQ=255) gcATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCaa > 4:305847/1‑148 (MQ=255) aTGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAAc > 8:318969/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTAc < 4:305752/80‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTAc > 3:305752/1‑80 (MQ=255) cTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTgg < 2:282842/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCg > 2:215376/1‑110 (MQ=255) ggCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCg < 1:215376/110‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTggg < 7:318969/147‑1 (MQ=255) cAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGt < 2:216243/71‑1 (MQ=255) cAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGt > 1:216243/1‑71 (MQ=255) tCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGtt > 4:162138/1‑147 (MQ=255) tCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGtt < 3:162138/147‑1 (MQ=255) cccGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGTTc < 3:305847/144‑1 (MQ=255) cccGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTGGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGTTCACgg > 1:92528/1‑148 (MQ=255) | GGCTTCCCAGGCTTCGGCATTCTTGATCGGCTGGGCGGCAGCGTACTGGTCGTTGGGCAGCAGCTTGGCCTGCACATCCGCCGGCAGCTTCAGGTGCTCGGCCCGGATCGGCCGCGCATGGCCCTTGGCCAGGTTGATCTGCCCGGCGTCGCTGAAGATGTATTCACGGGTCAGCTTGGCCGCGTTGGGGTGCTTGGCGTACTTGTTGATGACCGTGGTATAGCCGGAAATCACCGAGCCGTCCGAGGGGATCAGCACTTCAAAACGCTTGGGGTCGATCTGTTCACGG > NC_002947/1925858‑1926146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |