New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3759792 | 49 (0.880) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 7.9% | coding (425/975 nt) | folEB | GTP cyclohydrolase I |
? | NC_002947 | = 3759821 | 47 (0.890) | coding (454/975 nt) | folEB | GTP cyclohydrolase I |
ACAGCCATCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTGCG > NC_002947/3759675‑3759969 | aCAGCCATCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCtg > 3:11771‑M2/1‑147 (MQ=255) cATCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCt > 8:50222/1‑149 (MQ=255) tCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCt > 5:220652/1‑147 (MQ=255) ggATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGGCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGa > 1:28636/1‑146 (MQ=255) ggATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGa < 2:28636/146‑1 (MQ=255) aTTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATc < 8:50009/149‑1 (MQ=255) cGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAg < 5:344391/148‑1 (MQ=255) gAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGt > 2:17544/1‑149 (MQ=255) aGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCgg < 7:50222/149‑1 (MQ=255) gTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGc < 2:219063/149‑1 (MQ=255) aGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTActc < 6:220652/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTActcctc > 2:130657/1‑148 (MQ=255) cgcCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGa < 1:130657/148‑1 (MQ=255) ccTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGa < 4:306025/146‑1 (MQ=255) ccTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGa > 3:306025/1‑146 (MQ=255) gATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGccc > 2:341802/1‑149 (MQ=255) aTTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCg < 1:341802/149‑1 (MQ=255) tttCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGt > 4:55616/1‑149 (MQ=255) aCTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCg < 3:55616/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGctctc < 7:190452/149‑1 (MQ=255) ccgccCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTActc > 6:359032/1‑117 (MQ=255) ccgccCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTActc < 5:359032/117‑1 (MQ=255) tGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGt > 3:19678/1‑149 (MQ=255) cACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGc < 3:261053/133‑1 (MQ=255) cACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGc > 4:261053/1‑133 (MQ=255) cACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGGCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGt < 1:136928/147‑1 (MQ=255) gTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGGAGttgatt > 8:130764/1‑147 (MQ=255) cGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACg > 7:170687/1‑149 (MQ=255) cGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACg > 8:200139/1‑149 (MQ=255) ctctctGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCTCGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCt > 1:203177/1‑149 (MQ=255) gctggAAGTCGTACCCGGTTCTCGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAAc < 4:19678/148‑1 (MQ=255) gctggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAAcc > 3:333507/1‑149 (MQ=255) tggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAg > 2:333141/1‑129 (MQ=255) tggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAg < 1:333141/129‑1 (MQ=255) tggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCtt > 3:100901/1‑149 (MQ=255) tggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCtt > 1:129424/1‑149 (MQ=255) tggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTATCTCCCGGAAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTACGAACCt > 7:327693/1‑148 (MQ=255) gAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCtt < 4:100901/147‑1 (MQ=255) gAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTc > 7:249694/1‑148 (MQ=255) gTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAgg > 6:64206/1‑149 (MQ=255) gTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAg > 2:23971/1‑148 (MQ=255) gTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCtgaaccgggtacgacttccagccagagaggccctcggtcaccagtgcagggcggcgaaccagcaagtcgaaatccaggcgcaccctggcactgcggctttcgcaatcc < 6:265653‑M2/149‑109 (MQ=255) gTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGa < 1:324863/136‑1 (MQ=255) gTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGa > 2:324863/1‑136 (MQ=255) ccGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCtgaaccgggtacgacttccagccagagaggccctcggtcaccagtgcagggcggcgaaccagcaagtcgaaatccaggcgcaccctggcactgcggctttcgcaatcctgat > 5:265653‑M2/1‑37 (MQ=255) cGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCtgaaccgggtacgacttccagccagagaggccctcggtcaccagtgcagggcggcgaaccagcaagtcgaaatccaggcgcaccctggcactgcggctttcgcaatcctgat > 4:206749‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCtgaaccgggtacgacttccagccagagaggccctcggtcaccagtgcagggcggcgaaccagcaagtcgaaatccaggcgcaccctggcactgcggctttcgcaatcctgat < 3:206749‑M2/148‑113 (MQ=255) tGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGaa < 2:129424/149‑1 (MQ=255) cACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAgcg > 6:64882/1‑149 (MQ=255) cACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAgcg > 1:129312/1‑149 (MQ=255) aCGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCa > 4:112891/1‑145 (MQ=255) aCGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCa < 3:112891/145‑1 (MQ=255) aGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTc < 2:129312/149‑1 (MQ=255) ggcggGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCAc < 1:292605/124‑1 (MQ=255) ggcggGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCAc > 2:292605/1‑124 (MQ=255) gggCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTgg < 8:249694/149‑1 (MQ=255) gcTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAg > 6:321090/1‑106 (MQ=255) gcTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgc < 7:200139/149‑1 (MQ=255) cTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgcg > 8:227242/1‑149 (MQ=255) | ACAGCCATCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTGCG > NC_002947/3759675‑3759969 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |