New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4724051 | 53 (0.960) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.7% | coding (65/483 nt) | yigI | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4724089 | 50 (0.960) | coding (27/483 nt) | yigI | hypothetical protein |
CAGTGGGTTGCCGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCGGGGTCGTCCTGGTAGGCGGTG > NC_002947/4723942‑4724235 | cAGTGGGTTGCCGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCt < 7:212436‑M2/149‑2 (MQ=255) tGGGTTGCCGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCtgct > 8:212436‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGGTTGCCGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCtgct > 3:123091‑M2/1‑145 (MQ=255) cGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTAcc < 1:237156/149‑1 (MQ=255) ttGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCATCCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGt < 1:239702/149‑1 (MQ=255) gTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGc < 7:60839/148‑1 (MQ=255) gTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGc < 6:327002/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGcc < 1:296654/149‑1 (MQ=255) aGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGTTCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGccc > 1:254519/1‑149 (MQ=255) ggCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCcct > 3:330674/1‑149 (MQ=255) aacaCGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGa < 2:254519/149‑1 (MQ=255) aacaAGTCATCGCTCTGACGCTCGCATTGTTTGATGATCAGGCCTTCTTAGGGAATG‑AGGGCCATCAACTGTCTATTGTCGACGA‑CCTCATTGGGGTCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCTTGCTTTATGATGCCTTGCCCTCGTTCTGa < 8:3018/149‑1 (MQ=255) acGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTg > 2:144359/1‑134 (MQ=255) acGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTg < 1:144359/134‑1 (MQ=255) gCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGa > 3:86226/1‑148 (MQ=255) cccTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATCTAGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGa > 1:253841/1‑148 (MQ=255) ccTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGaa < 6:315639/114‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGaa > 5:315639/1‑114 (MQ=255) gCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGaa > 7:236430/1‑108 (MQ=255) gCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGaa < 8:236430/108‑1 (MQ=255) gCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGCATgc > 7:135336/1‑149 (MQ=255) cTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATgcc < 4:86226/149‑1 (MQ=255) cATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCtt < 3:95382/121‑1 (MQ=255) cATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCtt > 4:95382/1‑121 (MQ=255) cATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATCGCCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTAACGAGTGCGGAATCATCCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGccc > 7:300629/1‑149 (MQ=255) aTTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCt > 3:278942/1‑149 (MQ=255) gATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGAt < 3:256636/149‑1 (MQ=255) gATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTg > 4:344784/1‑149 (MQ=255) gATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTg > 4:88258/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGa < 8:271766/138‑1 (MQ=255) aGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGa > 7:271766/1‑138 (MQ=255) gCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGCCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGcc > 7:185486/1‑147 (MQ=255) cccGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAg > 3:222801/1‑149 (MQ=255) cccGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAg > 8:130836/1‑149 (MQ=255) cGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGgc < 2:253841/149‑1 (MQ=255) aTAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCAt < 4:330674/149‑1 (MQ=255) aGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATg > 8:125097/1‑148 (MQ=255) gggAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGaa < 3:133176/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCtgctggcgctgattccctatgccgggctgatcggcatcgaatgcgagcgtcagggcgatgacgtgttgttcc < 3:110454‑M2/120‑73 (MQ=255) aGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCtgctggcgctgattccctatgccgggctgatcggcatcgaatgcgagcgtcagggcgatgacgtgttgttcc > 4:110454‑M2/1‑48 (MQ=255) cgcCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCccac < 7:130836/149‑1 (MQ=255) gcCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCtgctggcgctgattccctatgccgggctgatcggcatcgaatgcgagcgtcagggcgatgacgtgttgttccgcctgccggccagcccggacaatatcggcaac < 4:199994‑M2/149‑105 (MQ=255) gcCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCccacc > 2:160296/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCcca > 1:231123/1‑146 (MQ=255) ccAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCcca < 2:231123/146‑1 (MQ=255) cAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCcaccac < 4:278942/149‑1 (MQ=255) gCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGACGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCt < 6:146425/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGc < 8:190104/149‑1 (MQ=255) ggTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTgg > 6:334410/1‑146 (MQ=255) tAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGc < 4:222801/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGACCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCCTGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGc > 6:241545/1‑149 (MQ=255) cA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCggg < 6:70341/149‑1 (MQ=255) a‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCgggg < 7:125097/149‑1 (MQ=255) a‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCgggg < 5:305829/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCGGGGTCGTCCt > 1:53640/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCggg > 7:168402/1‑134 (MQ=255) gTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCggg < 8:168402/134‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCGTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCGGGGTCGTCCTGGTAGGCGGt < 3:88258/148‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCGGGGTCGTCCTGGTAGGCGGTg > 8:334744/1‑149 (MQ=255) | CAGTGGGTTGCCGATATTGTCCGGGCTGGCCGGCAGGCGGAACAACACGTCATCGCCCTGACGCTCGCATTCGATGCCGATCAGCCCGGCATAGGGAATC‑AGCGCCAGCAACGGTCGATAGTCGCCCA‑CCGCATGGGCGGCGTTGAGCTGCTGGCGTACCGCGTGCGGAATCATGCCTTGCCCTCCTTCAGACTGTCGCCGAAACGGATGCCGCCCTTGATGTCCTGGCCCAGGCGCATGAACGTGCCCACCACCTGGCAGATGGGCTGGTCGGGGTCGTCCTGGTAGGCGGTG > NC_002947/4723942‑4724235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |