New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5164438 = | 68 (1.230) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 4.9% | coding (3442/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
? | NC_002947 | 5164483 = | 50 (0.940) | coding (3397/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAAC > NC_002947/5164337‑5164631 | ccgtgaaatggggcgggtagaagcgctggtcgaagacattctgctggccagcctggacagttgcatccttgaaggcgaacaaccgttgccacgtgaaggtgCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCa > 5:153984‑M1/102‑148 (MQ=255) cACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCATCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAc > 5:301295/1‑149 (MQ=255) cACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAc < 4:49578/149‑1 (MQ=255) cACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAc < 8:124267/149‑1 (MQ=255) cgtgaaatggggcgggtagaagcgctggtcgaagacattctgctggccagcctggacagttgcatccttgaaggcgaacaaccgttgccacgtgaaggtgCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAcc < 5:340375‑M1/49‑1 (MQ=255) cgtgaaatggggcgggtagaagcgctggtcgaagacattctgctggccagcctggacagttgcatccttgaaggcgaacaaccgttgccacgtgaaggtgCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAcc > 6:340375‑M1/101‑149 (MQ=255) ttGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCAc > 1:211881/1‑149 (MQ=255) gCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTg < 2:211881/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTgg > 7:29991/1‑148 (MQ=255) ggTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAAc < 4:298617/149‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACg > 4:187583/1‑149 (MQ=255) tCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACgg > 3:168/1‑149 (MQ=255) tCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgttgt > 7:190659/1‑149 (MQ=255) ttGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc > 7:255167/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCTACGGTTGTTc < 5:25794/147‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 7:100904/147‑1 (MQ=255) ccTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTTCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGACGCACCTTCACGTGGCAACGGTTTTTAGCCt > 7:143983/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTc < 3:187583/147‑1 (MQ=255) aaGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAg < 8:190659/149‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGa > 7:309382/1‑149 (MQ=255) tttCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGc < 4:68367/149‑1 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACt < 8:130550/147‑1 (MQ=255) aCCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc > 2:69020/1‑147 (MQ=255) ccATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAg < 8:29991/149‑1 (MQ=255) cATGCCACTGCTTCATCAGTTCCAGTGTCTGACTTGCCAGGCGCTCGGCATGATCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCTACTGTCCAgg < 8:309382/149‑1 (MQ=255) tGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCt < 3:282806/149‑1 (MQ=255) ggCCACCGCTTCAGCTCTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTGGGCATGCTCGGCCCAGCGGCCGCGCTTGCGTGCTGCCTGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCGTTCAAGGCTGCAACTGTCCAGGCt < 7:74866/148‑1 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc < 4:168/149‑1 (MQ=255) cACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATg > 8:128342/1‑148 (MQ=255) cACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCAACTTCACGTGGCAACGGTTGTTAGACTTCAAGGATGCAACTGTACAGGCTGCCCAGCAGAAtc > 5:366566/1‑147 (MQ=255) aCTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCCCCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTc > 7:140425/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATg < 5:260611/118‑1 (MQ=255) ttCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATg > 6:260611/1‑118 (MQ=255) ttCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCtt > 7:157833/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCtt < 8:255167/147‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGG‑CCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc > 6:143739/1‑102 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGG‑CCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 5:143739/102‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCt > 6:121431/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCt > 3:233198/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGt < 2:162156/79‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGt > 1:162156/1‑79 (MQ=255) ccTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCtt < 7:128342/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCt < 4:233198/147‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTAccc > 3:100495/1‑149 (MQ=255) cgcTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGccc < 8:157833/149‑1 (MQ=255) cTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCa > 3:206489/1‑149 (MQ=255) tCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGAt > 4:165740/1‑92 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcagca > 8:175235/1‑111 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcagca < 7:175235/111‑1 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCa < 4:100495/149‑1 (MQ=255) ggtgcggccttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACg < 5:340375‑M2/100‑1 (MQ=255) ggtgcggccttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACg > 6:340375‑M2/50‑149 (MQ=255) tgcggccttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACgg > 5:153984‑M2/48‑148 (MQ=255) GGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTa < 4:351938‑M1/147‑1 (MQ=255) cAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcagcag < 5:121431/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGccc > 5:361725/1‑149 (MQ=255) cagccagcGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGccc < 6:366566/148‑1 (MQ=255) ccagcGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCttt < 6:16388/88‑2 (MQ=255) ccagcGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCttt > 5:16388/1‑87 (MQ=255) gcgcGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGc > 2:20748/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCcgc > 5:273363/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTc < 7:59237/129‑1 (MQ=255) aaGGCCGCACATTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGAGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGAAGGCCAAgctcgctc > 8:59237/1‑129 (MQ=255) aGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGcc > 5:195612/1‑118 (MQ=255) aGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGcc < 6:195612/118‑1 (MQ=255) ggccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCa < 6:301295‑M2/144‑1 (MQ=255) ccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAgg < 6:153984‑M2/146‑1 (MQ=255) ccgCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAg > 8:180300‑M2/4‑148 (MQ=255) cACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAAc > 8:171714/1‑149 (MQ=255) | CACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCCAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAAC > NC_002947/5164337‑5164631 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |