Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 274,692 | T→C | 5.4% | K419R (AAG→AGG) | PP_0222 ← | DszA family monooxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 274,692 | 0 | T | C | 5.4% | 219.8 / 2.1 | 75 | K419R (AAG→AGG) | PP_0222 | DszA family monooxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/38); new base C (2/2); total (35/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 |
GGAACAGTTTCTCAAGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAACTGCTCGGCCACCTGTTCA > NC_002947/274551‑274835 | ggAACAGTTTCTCAAGCATGGTGCAGGGGTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCg > 1:204153/1‑149 (MQ=255) tttCTCAAGCATGGTGTAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgc > 4:235092/1‑149 (MQ=255) tcAAGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgctgct > 8:186328/1‑149 (MQ=255) tcAAGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgctgct > 4:116499/1‑149 (MQ=255) tcAAGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgctgct > 4:321620/1‑149 (MQ=255) aaGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgctgct < 2:204153/147‑1 (MQ=255) aaGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgctgc < 6:107453/146‑1 (MQ=255) aaGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGctgctg > 7:24314/1‑148 (MQ=255) aGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGaa < 8:17607/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGc < 3:99704/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGc < 8:24314/148‑1 (MQ=255) cAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGa > 1:271293/1‑149 (MQ=255) ggCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCTGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgct > 8:316967/1‑131 (MQ=255) ggCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACgct < 7:316967/131‑1 (MQ=255) ggCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGa > 2:291273/1‑149 (MQ=255) gCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGAc < 8:236591/149‑1 (MQ=255) cAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGAc < 5:273321/145‑1 (MQ=255) cAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGAc > 6:273321/1‑145 (MQ=255) cAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCa < 3:235092/147‑1 (MQ=255) ggggtaggggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGAt > 4:267092/1‑149 (MQ=255) ggggtaggggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGAt < 1:280994/149‑1 (MQ=255) gggtaggggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATg < 3:116499/149‑1 (MQ=255) gtaggggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGaa < 2:271293/149‑1 (MQ=255) aggggtaAAGCGGTAATCCGAGCCAGGATGCTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCATTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACAAGCTCGATGAAGt > 4:153034/1‑149 (MQ=255) gggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGCGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTcc < 3:36036/149‑1 (MQ=255) ggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCt < 5:78394/149‑1 (MQ=255) ggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCCTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCt > 7:176073/1‑149 (MQ=255) ggtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCCTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCt > 7:181225/1‑149 (MQ=255) gtaAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTc > 3:68917/1‑149 (MQ=255) aaGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGaa < 3:267092/149‑1 (MQ=255) gCGGTAAGGCTAGCCAGGATGGGCGGCTGGTATGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACTGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACTCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGa < 4:193903/146‑1 (MQ=255) gCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGAAAGTGCGGGAGGTCGCCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGAGACTTCGGAGAAGGCAGTCATGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCCGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCACGaaa > 3:193903/1‑147 (MQ=255) ggTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGa < 7:116834/110‑1 (MQ=255) ggTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGa > 8:116834/1‑110 (MQ=255) gTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGctct > 1:142063/1‑149 (MQ=255) tAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCtctc > 2:146501/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCCTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCgg < 8:181225/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCCTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCgg < 8:176073/149‑1 (MQ=255) cGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCgggg > 8:286460/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCgggg > 8:291513/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCgggg < 7:186328/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTg > 4:151527/1‑83 (MQ=255) aGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTg < 3:151527/83‑1 (MQ=255) gCCAGGATTGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGa < 1:31263/149‑1 (MQ=255) cctgttgggTGGGGGGGTATGTGGGGGTGGTGGGCTTGTACCGCATTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGa < 1:298250/141‑1 (MQ=255) ccAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCTCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGa < 1:291273/148‑1 (MQ=255) gATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCTGCGTGGATCAGTTTTTCGCGCAGTGTTCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACTCTGCTGAAGTTGCGGGAt < 8:125926/106‑1 (MQ=255) gATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGATGCGGGAt > 7:125926/1‑106 (MQ=255) gTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCgg < 7:286460/148‑1 (MQ=255) gTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCgg < 7:291513/148‑1 (MQ=255) tCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGTAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGt > 5:310705/1‑149 (MQ=255) ggTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGTAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGtt < 6:310705/149‑1 (MQ=255) gTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACACTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGtt > 8:235025/1‑148 (MQ=255) ggggggcGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGGAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGAGGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCGCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGGcc < 1:257292/143‑1 (MQ=255) gtCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGc < 4:68917/149‑1 (MQ=255) gAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTc < 3:321620/147‑1 (MQ=255) aCAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCg > 6:36305/1‑66 (MQ=255) aCAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCg < 5:36305/66‑1 (MQ=255) gTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATc > 1:270802/1‑149 (MQ=255) tttttCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCg < 6:106786/62‑1 (MQ=255) tttttCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCg > 5:106786/1‑62 (MQ=255) tttttCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGAcc < 2:237227/70‑1 (MQ=255) tttttCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGAcc > 1:237227/1‑70 (MQ=255) ttttCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCa > 2:341854/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGAt > 7:270195/1‑149 (MQ=255) aGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTTCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGAGCAAGCCCCCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGGCCTGGACGGTTTCaa < 5:250710/133‑2 (MQ=255) gggTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAAc < 1:341854/149‑1 (MQ=255) gggTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAAc < 2:270802/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAACt > 8:70021/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCaa > 6:319983/1‑142 (MQ=255) cTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCaa < 5:319983/142‑1 (MQ=255) gCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAACTGCTCGGCCACCTGtt > 3:246166/1‑148 (MQ=255) cAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAACTGCTCGGCCACCTGTTCa < 1:146501/149‑1 (MQ=255) aGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGtt < 4:164928/90‑1 (MQ=255) aGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGtt > 3:164928/1‑90 (MQ=255) | GGAACAGTTTCTCAAGCATGGTGCAGGGCTCCAGTCGGGGTAGGGGTAAAGCGGTAAGCCGAGCCAGGATGGTCGGCGGGTAAGTGCGGGTGGTCGGCCTGGAACAGTTTTTCGCGCAGGGTGCCTTCGGTGTAGGCAGTCTTGTAGCGGCCACGCTGCTGAAGTTGCGGGATGACCAGCTCGATGAAGTCCTCGAAGCTCTCCGGGGTGACGGTGCGGGTCAGGTTGAAACCGTCCAGGCCGGTTTCATCGATCCACGCGATCAACTGCTCGGCCACCTGTTCA > NC_002947/274551‑274835 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |