| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,799,946 | G→T | 5.1% | R94M (AGG→ATG) ‡ | PP_3360 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,799,946 | 0 | G | T | 5.1% | 254.4 / 3.0 | 79 | R94M (AGG→ATG) ‡ | PP_3360 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/33); new base T (2/2); total (44/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
GCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTG > NC_002947/3799799‑3800093 | gcCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAgg < 1:17075/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTcagca < 7:49931/148‑1 (MQ=255) tGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCtgtg > 8:129661/1‑149 (MQ=255) gTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGt > 5:249853/1‑149 (MQ=255) gTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAAAGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGt > 1:42782/1‑149 (MQ=255) gAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGt > 5:165510/1‑149 (MQ=255) gAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGt > 6:21921/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTAGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcgc > 5:308137/1‑149 (MQ=255) ccACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCgg < 3:89171/145‑1 (MQ=255) ccACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCgg > 4:89171/1‑145 (MQ=255) ccACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCtt < 2:165298/149‑1 (MQ=255) aCTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCTGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc < 2:42782/149‑1 (MQ=255) aCTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg < 1:159627/136‑1 (MQ=255) aCTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg > 2:159627/1‑136 (MQ=255) aGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc > 4:2488/1‑149 (MQ=255) aGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACATGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGACTGTGGTTCGTGCTCGCGGCCTTGCAGATTGGc > 5:109951/1‑149 (MQ=255) gATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGcc > 3:275703/1‑149 (MQ=255) aaTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCtgt > 4:158008/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCGGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGt > 4:252839/1‑122 (MQ=255) aTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCGGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGt < 3:252839/122‑1 (MQ=255) ccAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTAGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGcc < 6:308137/149‑1 (MQ=255) tttCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCgcgc > 6:254840/1‑148 (MQ=255) gCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGCCCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggc > 3:52976/1‑149 (MQ=255) gCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCgg < 1:225570/111‑1 (MQ=255) gCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCgg > 2:225570/1‑111 (MQ=255) cACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcc > 2:162116/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctg < 2:39626/149‑1 (MQ=255) gCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggc < 7:129661/149‑1 (MQ=255) gCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggc > 5:360435/1‑149 (MQ=255) gCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggc > 7:162746/1‑149 (MQ=255) cAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggcc < 5:254840/149‑1 (MQ=255) tCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAg < 6:165510/147‑1 (MQ=255) ttgttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTa < 6:360435/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCAGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGc > 1:80086/1‑112 (MQ=255) gCTGGCCTCCTTGCTGGGGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGc < 2:80086/111‑1 (MQ=255) ctcctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAAcc < 8:111642/110‑1 (MQ=255) ctcctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAAcc > 7:111642/1‑110 (MQ=255) tcctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCa > 4:125205/1‑149 (MQ=255) cctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCAc > 7:337689/1‑149 (MQ=255) ctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCAcc > 7:159233/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGtt > 1:192381/1‑68 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGtt < 2:192381/68‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCg > 6:112570/1‑149 (MQ=255) ggCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGcc > 4:153239/1‑121 (MQ=255) ggCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGcc < 3:153239/121‑1 (MQ=255) gCCTGAGGATGGTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCTGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCTGCCTGTGCATGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTAACGACGGc < 6:109951/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGcc > 4:64396/1‑149 (MQ=255) cTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCt > 4:221143/1‑149 (MQ=255) aGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTg < 5:191381/147‑1 (MQ=255) aGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGa < 8:337689/148‑1 (MQ=255) aGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACCTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGaa < 8:162746/149‑1 (MQ=255) gCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAAc < 5:112570/149‑1 (MQ=255) cATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAAc > 4:75022/1‑148 (MQ=255) aTGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGacc > 3:68620/1‑145 (MQ=255) aTGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCa < 3:64396/149‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAggg > 4:181915/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAgg < 3:158008/148‑1 (MQ=255) cGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAggg > 2:71187/1‑147 (MQ=255) gACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGc < 1:162116/147‑1 (MQ=255) gACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCa < 4:68620/148‑1 (MQ=255) gCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCa < 8:200188/57‑1 (MQ=255) gCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCa > 7:200188/1‑57 (MQ=255) cccGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACt > 8:219718/1‑149 (MQ=255) cGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGcc < 5:42281/128‑1 (MQ=255) cGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGcc > 6:42281/1‑128 (MQ=255) cGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTgg > 6:261901/1‑149 (MQ=255) cGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGATACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTgg > 1:204996/1‑149 (MQ=255) acaggctgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGc > 1:173707/8‑148 (MQ=255) gctggctgACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGACCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAAcc > 6:226468/1‑149 (MQ=255) tggctgCCCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCCCTGGCAACCCt > 5:170665/1‑149 (MQ=255) tggctgACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCt > 6:234512/1‑149 (MQ=255) tgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCAc < 6:218698/137‑1 (MQ=255) tgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCAc > 5:218698/2‑138 (MQ=255) tgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCtt < 2:173707/148‑1 (MQ=255) ggctgACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCTGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCtt > 1:255073/1‑149 (MQ=255) ctgACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTc < 8:159233/149‑1 (MQ=255) tgACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCATGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCa < 7:219718/149‑1 (MQ=255) aCCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCa < 5:234512/147‑1 (MQ=255) aCCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGGCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCa < 4:275703/147‑1 (MQ=255) aGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTg < 3:125205/149‑1 (MQ=255) | GCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGC‑GCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTG > NC_002947/3799799‑3800093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |