| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,844,924 | A→T | 8.3% | L237Q (CTG→CAG) | PP_3394 ← | 3‑hydroxy‑3‑methylglutaryl‑CoA lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,844,924 | 0 | A | T | 8.3% | 178.0 / 5.4 | 62 | L237Q (CTG→CAG) | PP_3394 | 3‑hydroxy‑3‑methylglutaryl‑CoA lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/30); new base T (3/2); total (30/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
CCGGTAGCGCTTCGCTTAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTGCC > NC_002947/3844778‑3845070 | ccGGTAGCGCTTCGCTTAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCTGAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAgg < 4:318351/149‑1 (MQ=255) cgcttcgcttAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGc > 6:55855/1‑147 (MQ=255) cttcgcttGGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAgg < 4:77123/149‑1 (MQ=255) cttcgcttAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAgg < 6:124906/149‑1 (MQ=255) cttcgcttAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAgg < 5:55855/149‑1 (MQ=255) cgcttAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCTCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCTGGCGGGCCTGGGa < 1:227917/148‑1 (MQ=255) aGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATc > 1:64912/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAg > 6:274885/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAACAG‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGtt < 1:64594/147‑1 (MQ=255) ccGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTccc < 1:303401/149‑1 (MQ=255) cGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGcc < 4:205920/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCctg‑‑ctg < 5:274885/148‑1 (MQ=255) gCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGACCTG‑‑CTGCAACGc > 6:98770/1‑148 (MQ=255) aaGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGccac > 8:111228/1‑149 (MQ=255) aaGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGccac > 1:166160/1‑149 (MQ=255) ggcGATTCCGGTGGCGTAGCCCATGCTTTGGAGCATGAACACGAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCCGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTT‑‑CTGCACCGccacca < 4:262949/147‑1 (MQ=255) gATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAgg < 2:166160/148‑1 (MQ=255) cGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGcc > 2:49833/1‑137 (MQ=255) cGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGcc < 1:49833/137‑1 (MQ=255) gTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑GCGGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATc < 1:37764/103‑1 (MQ=255) gTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATc > 2:37764/1‑102 (MQ=255) gTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAag < 1:33497/148‑1 (MQ=255) aGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAaggc > 2:286196/1‑148 (MQ=255) gCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAaggc > 4:227257/1‑147 (MQ=255) ccATGCTTTGCAGCATGAACACGGGGTACTCGGTCAGGTTATAACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCACCCACCCCGGCCCGCCAGGGAGGCAGGCAGGGCCACAAGGCGGAG‑‑CAGCACCGCCCCCAGGGTGGTGGCCAaggccggg > 7:54792/1‑149 (MQ=255) ccATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAaggccagg > 1:233139/1‑149 (MQ=255) cATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAaggccaggc > 4:267307/1‑149 (MQ=255) cATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCACGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCACTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTCTTGGCCAaggccaggc > 6:183784/1‑149 (MQ=255) tGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCgg < 1:156935/147‑1 (MQ=255) agcaTGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTc < 2:233139/149‑1 (MQ=255) agcaTGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTc < 2:64912/149‑1 (MQ=255) caTGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGgt > 6:289591/1‑144 (MQ=255) caTGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGgt < 5:289591/144‑1 (MQ=255) tGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATg > 2:353648/1‑148 (MQ=255) acCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACAAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTg > 1:129450/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTc < 3:105842/139‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTc > 4:105842/1‑139 (MQ=255) cAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTgcg > 5:306738/1‑149 (MQ=255) cTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCt > 7:91598/1‑149 (MQ=255) cTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCt < 3:227257/149‑1 (MQ=255) tCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCtt > 5:337052/1‑149 (MQ=255) cGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GTCAGCCTCCCAGGCCCGCCATGGAGGCATCCATTTCCCCAATGCCCTGCTCTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGAc < 1:286196/149‑1 (MQ=255) ggTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGt > 8:61134/1‑149 (MQ=255) cAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCa < 7:111228/149‑1 (MQ=255) aGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCaa < 1:353648/149‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAAtc < 7:61134/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGGGCGAAG‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTGCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCGACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCTAtctc < 5:183784/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAAtctc < 3:267307/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAAtctc < 8:91598/149‑1 (MQ=255) cAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCCCCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCg > 7:90308/1‑148 (MQ=255) aGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTa > 6:279682/1‑149 (MQ=255) aGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTa > 6:243885/1‑149 (MQ=255) tggatgCCTCCCTGGCGGGCCTGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGc > 6:346032/6‑110 (MQ=38) tggatgCCTCCCTGGCGGGCCTGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGc < 5:346032/105‑1 (MQ=38) ggCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGc < 6:306738/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCGGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCAc < 8:54792/149‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCGGGCCTGGGAGGCTGCCCGTTCGCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCAtt > 6:168232/1‑149 (MQ=255) tCCCTGGCGGGCCTGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTg > 3:186156/1‑149 (MQ=255) tCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTc < 6:201142/114‑1 (MQ=255) tCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAAAGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGAGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTg > 5:259131/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTGc > 8:38973/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTGcc < 5:240283/149‑1 (MQ=255) | CCGGTAGCGCTTCGCTTAGTACCTGCCGGGTTTCGATTAGCGCAGGCAAGTCGATGCCGGTGTCGTAGCCCATGCTTTGCAGCATGAACACCAGGTCCTCGGTCACGGTATTACCAGACGCGCCAGGGGCGAAC‑G‑GGCAGCCTCCCAGGCCCGCCAGGGAGGCATCCAGTTCCCCAATGCCCTG‑‑CTGCACCGCCACCAGGCTGTTGGCCAAGGCCAGGCCCCGGGTGTCATGGAAGTGCGCGGCCTTGAGACGGTCGCCTGCAATCTCCCGTACGGCCTGAAGCACCATTGCC > NC_002947/3844778‑3845070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |