| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,083,051 | G→C | 6.4% | G17A (GGT→GCT) ‡ | PP_3593 → | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,083,051 | 0 | G | C | 6.4% | 233.0 / 4.7 | 74 | G17A (GGT→GCT) ‡ | PP_3593 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/35); new base C (3/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCAC > NC_002947/4082905‑4083192 | cggttGGATGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACATTTGGAAGAGTGCATT‑GAGGTGCGAGATGAACTAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTg < 3:81157/146‑1 (MQ=255) ttGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc > 7:171670/1‑148 (MQ=255) ggAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc < 8:171670/146‑1 (MQ=255) gAAGCAACTGCCGCTCGACATAACGAATTGGTCGGCTACACCGCGTGGGGGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGGAAT‑GAGGGGGGAGTTGACCAAGTCGATGGCCTTGCTGGGGGGGTGCGCCCGGCTGCTGGCGGGTgcggc > 2:27352/1‑147 (MQ=255) aGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAgc < 1:27352/149‑1 (MQ=255) gCAAATGCAGCTATACATAACGAAATAGTCGGCTAAACCTAGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGGAAT‑GAGCTGCGAGATGAACAAGTCCATCGGCTTTGTTGGTGAGAGCGCCCTTCTGCTGGGAGGTGCCGCAAgcg > 6:98252/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCt > 5:248081/1‑148 (MQ=255) ccGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCCGCTGGCGGCACCCGCCAgcagcagg < 8:148908/147‑7 (MQ=255) cGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAAcc < 3:326823/149‑1 (MQ=255) cGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGGGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAAcc < 7:315197/149‑1 (MQ=255) tACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGTTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCg < 5:98252/149‑1 (MQ=255) tACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTg < 7:258953/147‑1 (MQ=255) tAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTc < 7:248322/149‑1 (MQ=255) tAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTc < 3:2791/149‑1 (MQ=255) gAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCg > 4:268630/1‑146 (MQ=255) gAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCg < 3:268630/146‑1 (MQ=255) aTTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCAcc > 2:114616/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATAGAGGTGCTACTTGACCAAGTCCATGCCGTTGGTGGTTGGGTGCGCCATGCTGATGGCGGGTCCCCCCAGCGCTGAAACCATCCGGTTCGCCAcc > 1:273355/1‑149 (MQ=255) tagtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCAcc > 8:207246/3‑147 (MQ=255) gtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAgg < 5:20979/149‑1 (MQ=255) tcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAggg > 4:195730/1‑149 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCg > 7:323351/1‑149 (MQ=255) gTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCtt < 6:248081/148‑1 (MQ=255) gTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTc < 1:114616/149‑1 (MQ=255) tCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTc > 4:83462/1‑148 (MQ=255) cGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCa > 1:126363/1‑148 (MQ=255) gACGTGCTAACAACACTAGCAAGAGTGCTAT‑GAGGTGCGAGAAGACCAAGTCCATGGCCTTGCTGGGGGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCaa < 5:303271/148‑1 (MQ=255) gACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAAc < 4:292870/149‑1 (MQ=255) gCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTc < 6:249059/141‑1 (MQ=255) gCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTc > 5:249059/1‑141 (MQ=255) gCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGt < 7:207246/149‑1 (MQ=255) aaaCAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATg > 3:336861/1‑146 (MQ=255) aaaCAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATg > 5:115126/1‑146 (MQ=255) aacaacAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGa > 6:284485/1‑149 (MQ=255) acaacaATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGAc > 4:175209/1‑149 (MQ=255) aacaaTAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTg > 1:306819/1‑102 (MQ=255) aacaaTAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTg < 2:306819/102‑1 (MQ=255) aacaaTAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGc < 3:83462/149‑1 (MQ=255) tAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTAccc < 4:44066/123‑1 (MQ=255) tAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTAccc > 3:44066/1‑123 (MQ=255) gTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCt < 8:214427/120‑1 (MQ=255) gTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCt > 7:214427/1‑120 (MQ=255) tGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGc > 5:111513/1‑149 (MQ=255) cAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGc < 4:265429/87‑1 (MQ=255) cAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGc > 3:265429/1‑87 (MQ=255) aT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTGGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACgg < 8:323351/149‑1 (MQ=255) aT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACgg > 2:280505/1‑149 (MQ=255) gCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGAt < 6:111513/149‑1 (MQ=255) cGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGAt < 1:356527/148‑1 (MQ=255) cGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATg > 7:72718/1‑149 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTAt < 5:33103/113‑1 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTAt > 6:33103/1‑113 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTc > 4:242205/1‑149 (MQ=255) gAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCt > 6:39862/1‑61 (MQ=255) gAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCt < 5:39862/61‑1 (MQ=255) aCAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCACCGCTGAAACCCAGCCGTTAGCCACCCACGGTGCCTACCCCCCCATCAACAATGTAAACGCCCATAACAAGCTGCACCGCATTGATGTCGACAt > 1:84307/1‑148 (MQ=255) aaGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCAc > 5:224056/1‑149 (MQ=255) aaGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCAc < 3:195730/149‑1 (MQ=255) gTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCAccc < 2:126363/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATg > 7:115047/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGcc < 3:242205/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCGCCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGccc > 1:186510/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCg > 2:317153/1‑131 (MQ=255) cTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCg < 1:317153/131‑1 (MQ=255) ggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTCTGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAAc < 2:273355/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCGGCTGCCGCCACCGCTGAAACACTGCGGATCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATCTAGACGCCGATAACAACCTGCACGGCTTTGATCTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGaaatgc > 2:169313/1‑145 (MQ=255) gcgctgGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATg > 2:251541/3‑149 (MQ=255) ctgctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGaa < 1:280505/147‑1 (MQ=255) ctgctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAAt < 8:115047/148‑1 (MQ=255) cgctgGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTg > 4:49276/2‑102 (MQ=255) cgctgGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTg < 3:49276/101‑1 (MQ=255) ctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTg < 2:238480/90‑1 (MQ=255) ctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTg > 1:238480/1‑90 (MQ=255) ctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCAc < 4:336861/149‑1 (MQ=255) | CGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAAT‑GAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCAC > NC_002947/4082905‑4083192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |