Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,128,704 | G→A | 6.8% | A175V (GCC→GTC) | PP_3632 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,128,704 | 0 | G | A | 6.8% | 174.6 / 2.1 | 59 | A175V (GCC→GTC) | PP_3632 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/31); new base A (2/2); total (26/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 |
CAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTGAGAGGTCAGCACCTGGAC > NC_002947/4128559‑4128849 | cAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTcggcc < 7:31052/148‑1 (MQ=255) aGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTcggcc > 5:351658/1‑147 (MQ=255) aGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTcggcc < 6:351658/147‑1 (MQ=255) cTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATAAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGca > 2:178751/1‑149 (MQ=255) gcgGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGc > 2:330635/1‑148 (MQ=255) ggggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCAGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATc < 2:145165/148‑1 (MQ=255) gggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCgg > 1:137640/1‑149 (MQ=255) tACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTc < 3:62269/149‑1 (MQ=255) tACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTc < 1:330635/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGcgcc > 1:21789/1‑149 (MQ=255) cgcTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAgg > 4:131803/1‑149 (MQ=255) gcTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAggg < 5:256114/149‑1 (MQ=255) cTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAgggg < 6:102370/149‑1 (MQ=255) cTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAgggg < 4:23631/149‑1 (MQ=255) cAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGt < 2:137640/148‑1 (MQ=255) cACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGCCCGt > 4:57399/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt > 3:251850/1‑147 (MQ=255) cTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt > 2:180595/1‑147 (MQ=255) tCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGACCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt > 5:258583/1‑146 (MQ=255) tCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGACCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt < 8:227761/146‑1 (MQ=255) tCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGACCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt > 7:227761/1‑146 (MQ=255) tCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGACCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGt < 6:258583/146‑1 (MQ=255) cccGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCg > 1:103716/1‑149 (MQ=255) gcgACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGacc > 5:73027/1‑149 (MQ=255) gACAGCTGGGTGGTGCTGTCGGTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGaccac < 7:124613/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGTGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCt < 8:254772/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCtgt > 1:64809/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCtgtg < 1:127650/149‑1 (MQ=255) tGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTgg > 8:210555/1‑149 (MQ=255) ggtggtGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGc < 1:180595/148‑1 (MQ=255) tggtgCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAg < 6:73027/149‑1 (MQ=255) tggtgCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAg < 2:21789/149‑1 (MQ=255) gtgCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGc < 7:38914/149‑1 (MQ=255) tCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACaa < 1:269933/148‑1 (MQ=255) gTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCCTTGCcacaggt < 3:131803/148‑4 (MQ=255) ttGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGcc < 2:103716/149‑1 (MQ=255) gagaATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGa > 7:253272/1‑149 (MQ=255) aaTCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGc > 8:249841/1‑143 (MQ=255) aaTCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGc < 7:249841/143‑1 (MQ=255) aaCGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAg > 5:357100/1‑149 (MQ=255) gCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGc > 5:255796/1‑136 (MQ=255) gCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGc < 6:255796/136‑1 (MQ=255) gccagccaGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACg > 1:175796/1‑149 (MQ=255) ccagccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACg > 1:237274/1‑148 (MQ=255) ccagccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACg > 5:156802/1‑148 (MQ=255) ccagccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACg > 7:34120/1‑148 (MQ=255) cagccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGc > 3:294889/1‑148 (MQ=255) ccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAgc < 2:237274/149‑1 (MQ=255) cagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGGCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAgcg < 1:178751/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCAc < 4:251850/149‑1 (MQ=255) cGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGa < 7:210555/149‑1 (MQ=255) cGGAGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAgcgc < 4:163950/145‑1 (MQ=255) cGGAGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAgcgc > 3:163950/1‑145 (MQ=255) gggTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGc < 8:253272/149‑1 (MQ=255) gTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGa < 2:305720/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGc < 2:64809/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCt > 8:220154/1‑148 (MQ=255) gCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTgaga < 8:260592/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGGCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTgaga < 8:246214/149‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTGAGAGGt > 8:75555/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCTATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTGAGAGGTCAGCACCTGGAc < 1:281201/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTGAGAGGTCAGCACCTGGAc < 2:339423/149‑1 (MQ=255) | CAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGC‑GCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGCAAGCGCACGAGCGACGCCTGAGAGGTCAGCACCTGGAC > NC_002947/4128559‑4128849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |