| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,265,952 | C→G | 5.6% | V169V (GTG→GTC) | PP_3738 ← | transcriptional regulator VanR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,265,952 | 0 | C | G | 5.6% | 229.5 / 3.9 | 71 | V169V (GTG→GTC) | PP_3738 | transcriptional regulator VanR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/28); new base G (2/2); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
TAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTCACAA > NC_002947/4265809‑4266100 | tAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGc > 5:280046/1‑149 (MQ=255) aGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGc > 5:222490/1‑148 (MQ=255) gTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGt < 3:199175/149‑1 (MQ=255) gCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGAc < 6:222490/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGAcc < 6:309755/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCg > 8:261590/1‑148 (MQ=255) tCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATgg > 2:319000/1‑149 (MQ=255) gcgcATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGc < 6:279892/148‑1 (MQ=255) gcATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAgg < 6:280046/149‑1 (MQ=255) aTCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCa < 2:338898/118‑1 (MQ=255) aTCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCa > 1:338898/1‑118 (MQ=255) aTCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATc > 5:118785/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTg > 2:169205/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCa < 7:214288/132‑1 (MQ=255) cgcgGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCa > 8:214288/1‑132 (MQ=255) gcgGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCCGTATTCGCGAGCCAGATCTTGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCa < 1:114407/149‑1 (MQ=255) gCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAggg > 1:16471/1‑148 (MQ=255) ggCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAg < 4:169601/139‑1 (MQ=255) ggCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAg > 3:169601/1‑139 (MQ=255) gTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑gg > 3:301064/1‑149 (MQ=255) gTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGAAAATGGCGGACCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGAAGGGAAAAGTTACGCCCCAGGGCACCGGCAAA‑gg > 7:226292/1‑149 (MQ=255) gACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCg > 7:102282/1‑149 (MQ=255) gACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCg > 7:2840/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAgg > 2:160602/1‑114 (MQ=255) aCCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAgg < 1:160602/114‑1 (MQ=255) cAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGt > 7:232243/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGt > 3:295066/1‑149 (MQ=255) gggCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTtg > 4:150598/1‑149 (MQ=255) gggCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTtg > 7:270738/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTtgt < 1:319000/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTtgt < 2:16471/149‑1 (MQ=255) gCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTtgtg < 7:261590/149‑1 (MQ=255) gTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGtggc > 2:304752/1‑149 (MQ=255) tCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGtggct > 6:259758/1‑149 (MQ=255) gAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCTCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCAGGGTTGtggctgg > 7:303378/1‑149 (MQ=255) aaCACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCAAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGtggctggc > 3:169236/1‑149 (MQ=255) acacGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCg < 3:150598/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCTGCATTTGGGGGATTTTGATGCGCCTGTTTTGTGGAGTGAGATCATGTGGGTCCAGCGGCAGTGGTGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATGGTTGCGGGCGAGGGCTACGGCAAT‑GGGAGGTTTGTGTCTGGCGTGgat < 8:102282/149‑1 (MQ=255) gCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCgat > 1:174601/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCgat < 8:2840/149‑1 (MQ=255) gCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCgat < 8:270738/149‑1 (MQ=255) ctgtATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCt > 6:99914/1‑149 (MQ=255) ctgcATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCAcc < 2:174601/148‑1 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtga < 8:232243/148‑1 (MQ=255) cATATGGGCAAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtgat < 4:169236/149‑1 (MQ=255) tatGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGtggctggc > 2:206078/1‑130 (MQ=255) tatGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGtggctggc < 1:206078/130‑1 (MQ=255) gCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCgatgat < 4:1429/134‑1 (MQ=255) gCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCgatgat > 3:1429/1‑134 (MQ=255) gAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCa > 5:315571/1‑149 (MQ=255) aGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATg > 2:277855/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGtt > 3:226731/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAg > 1:238865/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAg > 1:233765/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGt > 1:15735/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGt < 2:15735/149‑1 (MQ=255) ggTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGAGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGa < 1:169205/149‑1 (MQ=255) gTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAATAAGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGa < 1:277855/149‑1 (MQ=255) tATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGa > 7:99851/1‑147 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGAcc < 4:301064/148‑1 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt < 6:315571/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt > 5:137765/1‑149 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt > 5:143309/1‑149 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt > 7:253739/1‑149 (MQ=255) aTCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAgtcgt > 5:217644/1‑149 (MQ=255) aTCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAgtcgt < 1:304752/149‑1 (MQ=255) cactGGCGGTGGACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGAc < 7:301977/134‑1 (MQ=255) cactGGCGGTGGACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGAc > 8:301977/4‑137 (MQ=255) cactGGCGGTGGACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCaa < 5:236077/140‑1 (MQ=255) cactGGCGGTGGACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCaa > 6:236077/4‑143 (MQ=255) ggCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCg > 7:193625/1‑149 (MQ=255) cACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTCACaa < 8:99851/149‑1 (MQ=255) | TAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCAGGGCAACGGCAAT‑GGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTCACAA > NC_002947/4265809‑4266100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |