Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,298,892 | T→A | 8.0% | intergenic (+47/+44) | PP_3770 → / ← PP_3771 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,298,892 | 0 | T | A | 8.0% | 174.1 / 3.8 | 60 | intergenic (+47/+44) | PP_3770/PP_3771 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/30); new base A (3/2); total (28/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGTTCGTTTCGTTCCTTGGCGAG > NC_002947/4298748‑4299034 | tGGTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTgg > 6:284127/1‑149 (MQ=255) ggTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCGCTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTgg > 2:37438/1‑148 (MQ=255) gTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCGCTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTGCCTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTgg < 1:37438/148‑1 (MQ=255) gTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCg < 1:89/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTttc > 4:147280/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAAATTGGCGGGcg > 3:59881/1‑140 (MQ=255) gAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAAATTGGCGGGcg < 4:59881/141‑2 (MQ=255) gCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGcc > 7:128180/1‑149 (MQ=255) gCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGcc > 2:352974/1‑149 (MQ=255) gATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCggg < 3:69198/149‑1 (MQ=255) gATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAAATTGGCGGGcga < 4:133217/125‑3 (MQ=255) gATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAAATTGGCGGGcga > 3:133217/1‑123 (MQ=255) aTGCCGACCCGCGCCTAAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAAACAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATATGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGC‑TTTTTTTCTTCGCTGATTGCCCGGGCt > 1:24420/1‑149 (MQ=255) cgcgCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGcccccc > 3:167751/1‑148 (MQ=255) cTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGtt > 6:81972/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGTCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGttt > 5:228997/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTgg < 5:51000/149‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCg > 3:148448/1‑149 (MQ=255) aGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCACt < 5:284127/149‑1 (MQ=255) ggCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCt > 5:82163/1‑148 (MQ=255) ggCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTa < 4:167751/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGTCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGTCCGCTACTg < 6:228997/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTg < 7:128503/149‑1 (MQ=255) gCCGAACCGTTGCAACCACGCACTTTGGTTGACTGAACCGAATTTGTTGTCCGCGG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGccc < 6:10152/148‑1 (MQ=255) gCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGcc > 8:27840/1‑147 (MQ=255) ccGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAg < 8:128180/149‑1 (MQ=255) gAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCt > 6:81501/1‑149 (MQ=255) aGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACt < 8:127714/149‑1 (MQ=255) aaCCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAg > 1:24732/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACt < 6:195745/141‑1 (MQ=255) ccAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGACCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACt > 5:195745/1‑141 (MQ=255) cAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCAc < 4:148448/149‑1 (MQ=255) cAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCAc > 5:225382/1‑149 (MQ=255) acgCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGc < 2:28277/118‑1 (MQ=255) aGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCAcc < 1:352974/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgc < 3:263423/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgc < 7:314332/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgc < 3:147280/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgcc < 6:82163/149‑1 (MQ=255) gCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgcctt > 6:288695/1‑149 (MQ=255) ccTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGAccttgccttg < 5:81501/149‑1 (MQ=255) cTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGcc > 3:135019/1‑106 (MQ=255) cTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGcc < 4:135019/106‑1 (MQ=255) cTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACcttgccttgc < 6:225382/149‑1 (MQ=255) aaCCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCATACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGc > 4:20258/1‑149 (MQ=255) cGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCGGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCgg < 3:287223/149‑1 (MQ=255) cGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCgg > 2:66345/1‑149 (MQ=255) cGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCgg < 5:288695/149‑1 (MQ=255) tttGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTa < 2:24732/149‑1 (MQ=255) gttgtGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACg < 5:81972/148‑1 (MQ=255) tgCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGtcat < 3:20258/149‑1 (MQ=255) ttG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCa > 2:138737/1‑108 (MQ=255) ttG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCa < 1:138737/108‑1 (MQ=255) tatCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTGTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGATGCCCCCCTACGTTTGCCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAg > 7:231054/3‑149 (MQ=255) ccTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGttcg > 3:255774/1‑149 (MQ=255) ccTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGttcg > 8:183587/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGTtcgtttcgtt > 3:299966/1‑149 (MQ=255) aaaaaagcccgccAAATTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGttcgtttcgt > 2:255820/7‑147 (MQ=255) cgccAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGTTCGTTTCGTTCCTTGGCGAg < 4:299966/149‑1 (MQ=255) cgccAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGTTCGTTTCGTTCCTTGGCGAg < 4:255774/149‑1 (MQ=255) | TGGTTCGCAACGGCGAAGCCGTGAGCGGCCCGATGCCGACCCGCGCCTCAGCCCAGGCACTGGCCGAACAGTTGCAACCAGGCACTTTGGTTGCCTGAACCGAATTTGTTGTGCGTTG‑CTCCCTACGCCCTTGTCGCCCGCCAATTTGGCGGGCTTTTTTTTCTTCGCGGATTGCCCGGGCTGCCCCCCTACGTTTGGCCGCTACTGCCCAGCTTACTGGTCAGCACCATGACCTTGCCTTGCAGCCGGCCTACGGTCATCACCAGTTCGTTTCGTTCCTTGGCGAG > NC_002947/4298748‑4299034 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |