Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,563,133 | C→A | 5.4% | R243L (CGG→CTG) | vgrG‑III ← | type VI secretion system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,563,133 | 0 | C | A | 5.4% | 239.8 / 3.4 | 74 | R243L (CGG→CTG) | vgrG‑III | type VI secretion system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/34); new base A (2/2); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.01e-01 |
AGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGCCTT > NC_002947/4562987‑4563275 | aGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCcg < 4:236653/148‑1 (MQ=255) gCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCa < 4:186768/149‑1 (MQ=255) gCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAgt < 5:171150/147‑1 (MQ=255) cccACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCGGCAAGTGCAgcgcgacta < 4:257870/148‑6 (MQ=39) cccACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACGGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTCGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAgtacg > 1:78298/1‑149 (MQ=255) ccACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCa < 2:357443/143‑1 (MQ=255) ccACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCa > 1:357443/1‑143 (MQ=255) cACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAgtacgta < 2:31954/149‑1 (MQ=255) aCCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAgtacgtac > 8:186352/1‑149 (MQ=255) cATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGc > 1:212247/1‑149 (MQ=255) cATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGc > 7:135511/1‑149 (MQ=255) gcTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCaa > 5:348780/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGGGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAgcgc < 6:321738/148‑1 (MQ=255) gcCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAg < 6:342902/149‑1 (MQ=255) ccGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAgcgc > 8:110821/1‑149 (MQ=255) gTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGcgccg > 5:181292/1‑147 (MQ=255) tAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGCAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAg < 6:146300/149‑1 (MQ=255) tAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAg < 5:150572/149‑1 (MQ=255) aTCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGc < 6:348780/149‑1 (MQ=255) cAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACATACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCAt > 3:332007/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATgc > 7:217196/1‑149 (MQ=255) gcTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCgg < 1:80276/149‑1 (MQ=255) gcTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCgg < 5:366499/149‑1 (MQ=255) gcTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGCTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCGCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCgg < 6:317863/149‑1 (MQ=255) aGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTc < 8:224137/146‑1 (MQ=255) aGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTc > 7:224137/1‑146 (MQ=255) aCTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGccacca < 7:186352/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCACGCATGCGCGGGCCTGGTCGCcaccac < 2:212247/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTc > 1:149895/1‑140 (MQ=255) tGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTc < 2:149895/140‑1 (MQ=255) tGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCActgct > 4:34919/1‑149 (MQ=255) cGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGACGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTgg > 4:72080/1‑149 (MQ=255) tGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCg < 8:135511/149‑1 (MQ=255) aCGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGt < 6:181292/148‑1 (MQ=255) aCGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACATACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTg < 4:332007/149‑1 (MQ=255) ccACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTa < 7:110821/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCAc > 6:221505/1‑149 (MQ=255) gggCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTg < 3:272855/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGt > 3:1249/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGt > 5:200150/1‑149 (MQ=255) gCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTc < 3:34919/149‑1 (MQ=255) gtgCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCTTGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGc > 1:291638/1‑136 (MQ=255) gtgCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGc < 2:291638/136‑1 (MQ=255) cTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa > 1:180283/1‑149 (MQ=255) tCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa > 4:336938/1‑148 (MQ=255) cTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGAcat > 8:215997/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGTAGGCCGGGTCGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGAc < 2:78298/147‑1 (MQ=255) ccGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCAc > 2:80679/1‑129 (MQ=255) gCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGAcatc > 2:68045/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGAcatc < 1:68045/140‑1 (MQ=255) ccGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACAtcatcctcatc > 1:199930/1‑148 (MQ=255) ccGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACAtcatcctcatc > 6:254587/1‑148 (MQ=255) cGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCa < 6:48090/149‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCggg > 1:157546/1‑122 (MQ=255) gTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCggg < 2:157546/122‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCaaa < 3:336938/148‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCACAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAg > 6:146028/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAgc < 2:4832/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAgcgc > 7:99353/1‑149 (MQ=255) gtgtAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTTGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa < 6:185941/121‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa > 5:185941/1‑121 (MQ=255) aGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCtcgtcg > 5:258185/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACatcatc < 1:352027/123‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACatcatc > 2:352027/1‑123 (MQ=255) gTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCtcgtcg < 8:217196/148‑1 (MQ=255) ctgcgcGGCAAGTGCAGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCgtcgtc > 8:310934/3‑149 (MQ=255) ctgcgcGGCAAGTGCAGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCgtcgtc > 3:223261/3‑149 (MQ=255) gcgcTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAgc > 6:358090/1‑136 (MQ=255) gcgcTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAgc < 5:358090/136‑1 (MQ=255) gcgcTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCct > 1:140035/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCct > 4:4548/1‑149 (MQ=255) tGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGACGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGc > 6:152144/1‑149 (MQ=255) gcaagtGCAGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGcc < 4:223261/144‑1 (MQ=255) aCTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGCCtt < 2:180283/149‑1 (MQ=255) aCTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGCCt > 3:120795/1‑148 (MQ=255) cgcgCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa < 3:200314/100‑1 (MQ=255) cgcgCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGa > 4:200314/1‑100 (MQ=255) | AGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGCCACCACTGCTGGCGTGGTACAGCACCTTGTCGGGGCCGACATCATCCTCATCCAGCCAAAGCGCCTCGTCGTCCTCTGCCTT > NC_002947/4562987‑4563275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |