Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,783,112 | A→G | 10.1% | V1401A (GTC→GCC) ‡ | pvdJ ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,783,112 | 0 | A | G | 10.1% | 179.2 / 10.0 | 69 | V1401A (GTC→GCC) ‡ | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/33); new base G (3/4); total (32/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.11e-01 |
CCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCGTGG > NC_002947/4782975‑4783252 | ccTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCa > 1:142367/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCa > 7:241428/1‑147 (MQ=255) cTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCaaag < 4:80979/149‑3 (MQ=255) cTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCaaag < 8:241428/149‑3 (MQ=255) cTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCaaag < 1:118524/149‑3 (MQ=255) tGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAActg > 1:76230/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAActgct < 1:194087/149‑1 (MQ=255) tCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCaaa > 6:140702/1‑143 (MQ=255) tCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGAGGTCCCGGCCaaa < 5:140702/144‑2 (MQ=255) cTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCgg < 2:266956/136‑1 (MQ=255) cTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCtt < 6:41248/149‑1 (MQ=255) cTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCAGGGACCTCgg > 1:266956/1‑136 (MQ=255) aaGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt < 1:212354/149‑1 (MQ=255) aGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCg < 5:103037/131‑1 (MQ=255) aGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCg > 6:103037/1‑131 (MQ=255) gCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACtgctgc > 4:345982/1‑139 (MQ=255) gCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACtgctgc < 3:345982/139‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCgg > 7:208948/1‑125 (MQ=255) aTCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCgg < 8:208948/125‑1 (MQ=255) aaCTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCt > 2:345981/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTgg > 5:145964/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGAGGTACGTGAAGGGCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTACTGCTTGATGTGTTTGATGCTgg < 7:140861/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGgccg > 2:65979/1‑149 (MQ=255) gAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTgg > 5:37179/1‑147 (MQ=255) gAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTgg > 7:210147/1‑147 (MQ=255) gAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTgg > 8:105518/1‑147 (MQ=255) aaGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAg > 6:187203/1‑149 (MQ=255) aGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGc < 6:29809/149‑1 (MQ=255) tCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgt < 5:341558/149‑1 (MQ=255) tCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgt < 5:262369/149‑1 (MQ=255) cACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt > 6:192213/1‑114 (MQ=255) cACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt < 5:192213/114‑1 (MQ=255) aCCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGgtgt < 6:37179/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGc > 8:305359/1‑134 (MQ=255) ccGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGc < 7:305359/134‑1 (MQ=255) cgGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGtt < 2:76230/149‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCa > 5:77301/1‑149 (MQ=255) ggCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCgg < 5:37213/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCaa > 5:178743/1‑83 (MQ=255) gCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCaa < 6:178743/83‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGaa > 4:194323/1‑146 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCAcc < 1:276291/137‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCAcc > 2:276291/1‑137 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTg > 5:42899/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTg > 3:97154/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTg < 3:194323/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTgg < 1:217424/149‑1 (MQ=255) cGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACtgctgc > 7:79984/1‑74 (MQ=255) cGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACtgctgc < 8:79984/74‑1 (MQ=255) cgcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACgg < 8:210147/149‑1 (MQ=255) gcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt > 2:355164/1‑74 (MQ=255) gcgGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGAt < 1:355164/74‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGc < 1:345981/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCt > 5:214918/1‑147 (MQ=255) gCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCa < 6:77301/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCa < 1:65979/149‑1 (MQ=255) ggTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCCCCGGGAACAGAGTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCGCgggtcg > 4:330408/1‑149 (MQ=255) aCGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCaggtcgagg < 5:187203/148‑1 (MQ=255) agcaCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGgtcgtc < 6:214918/149‑1 (MQ=255) aCGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGaa < 1:338595/149‑1 (MQ=255) gCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGaa > 8:5241/1‑147 (MQ=255) gCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACa < 4:97154/149‑1 (MQ=255) aTACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTcgcg < 6:42899/149‑1 (MQ=255) aCCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGc > 3:86826/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCAACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCg > 4:129491/1‑149 (MQ=255) tttGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCaggtcgag < 4:285736/123‑1 (MQ=255) tGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCGTgg > 6:210715/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCGTgg > 6:215840/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCGTgg < 7:105518/148‑1 (MQ=255) | CCTGCTCGCTGAAGCTGCCATCGAACTGGCCGAGGTAGTTGAAGGTCACCCGCGGCTGCGGCAACGCAGCCAGGCGCTGGGCGAACGCGGCTTCGCCCAGGTAACGCAGCACGCCGTAACCGATACCTTTGGCCGGGACCTCGGCCAACTGCTGCTTGATGTGTTTGATGCTGGCCGCCACGCTTGGCAGCGGTGTCAGTTGCACCGGGAACAGACTGGTGAACCAGCCAACGGTGCGGCTCAGGTCGAGGTCGTCGAACAGGTCCTCGCGGCCGTGG > NC_002947/4782975‑4783252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |