| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,912,816 | A→T | 11.8% | L628Q (CTG→CAG) | ccmF ← | holocytochrome c synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,912,816 | 0 | A | T | 11.8% | 172.3 / 10.4 | 66 | L628Q (CTG→CAG) | ccmF | holocytochrome c synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/26); new base T (4/4); total (36/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGAACACTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCAC > NC_002947/4912673‑4912964 | agGAACACTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCg > 5:86039/1‑149 (MQ=255) aaCACTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCACGCAACCCGCCCAGGGCGGTCTGCTGAcc < 1:202042/146‑1 (MQ=255) aaCACTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGGCGGTCTGCTGAcc > 2:202042/1‑145 (MQ=255) cTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 2:21335/1‑148 (MQ=255) tGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 8:118432/1‑147 (MQ=255) tGCAAGGGGCACTACCAAGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCACAGGACATCCCGCACCCGGGTCTTGACCTAGCCGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCCACCCGCCCAGGCCGGTCCGCAGACCGCccagcca > 1:350695/1‑149 (MQ=255) aaGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 2:342019/1‑144 (MQ=255) ggggCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 6:222287/1‑148 (MQ=255) aCTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc < 3:128377/143‑1 (MQ=255) aCTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 4:128377/1‑143 (MQ=255) aCCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACg > 1:126674/1‑149 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACg < 1:180074/148‑1 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGt < 6:86039/149‑1 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGt < 2:222942/149‑1 (MQ=255) cTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTcagca > 4:144780/1‑109 (MQ=255) tGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAcgc > 4:341947/1‑149 (MQ=255) gctCCAGACACGCCTAGGACATCAGGCCCCCGGGGCTTGACCTTTACGCGGTATCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCCCCCAGCCGGGGCAGCTGACCGCCCAGCCAGATCCACCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGc < 2:350695/149‑1 (MQ=255) ctCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAc > 6:220030/1‑139 (MQ=255) ctCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAc < 5:220030/139‑1 (MQ=255) cAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAg > 3:2750/1‑149 (MQ=255) acacGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcg > 1:72016/1‑149 (MQ=255) cacGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcg < 4:2750/148‑1 (MQ=255) acGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcgc > 7:206786/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACCGCCCAGGCGCCAt > 6:9716/1‑149 (MQ=255) aGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATtctc > 3:277235/1‑149 (MQ=255) acctCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGGCAGCAGACCGCCCAGCCCGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAGTATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAg < 8:238831/146‑1 (MQ=255) tCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTgg > 1:41449/1‑149 (MQ=255) cACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCTCCCAGCCAGATc < 3:3187/92‑1 (MQ=255) cACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 4:3187/1‑92 (MQ=255) cGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTc > 6:341017/1‑149 (MQ=255) cGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTc < 5:222287/149‑1 (MQ=255) cACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc < 1:342019/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc > 2:325430/1‑148 (MQ=255) aCCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc > 8:114634/1‑148 (MQ=255) cGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAg < 2:72016/149‑1 (MQ=255) tgaccttgacGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGATCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACg > 8:36006/1‑149 (MQ=255) 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tAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGt < 1:325430/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACCTGTACGTcgcgcttg < 2:126674/148‑5 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGCCGTACa > 2:252734/1‑135 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa < 1:247658/135‑1 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa < 1:252734/135‑1 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa > 2:247658/1‑135 (MQ=255) ccGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGc > 5:250674/1‑149 (MQ=255) cGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGcc < 3:341947/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAgc < 4:17546/121‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAgc > 3:17546/1‑121 (MQ=255) tCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTcgcg > 6:121579/1‑137 (MQ=255) tCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTcgcg < 5:121579/137‑1 (MQ=255) gggCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGt > 2:349646/1‑147 (MQ=255) gggCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGt < 1:349646/147‑1 (MQ=255) ggCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGa > 7:197769/1‑149 (MQ=255) ccA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGccc < 7:114634/149‑1 (MQ=255) cA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCg > 3:84749/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCg > 6:206114/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACCGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtca > 7:251948/1‑149 (MQ=255) ctgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatca > 8:43734/6‑149 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc > 2:97566/5‑147 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc > 2:92948/5‑147 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc < 1:97566/143‑1 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc < 1:92948/143‑1 (MQ=255) cGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGAc < 4:277235/149‑1 (MQ=255) gcagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTg > 4:104128/1‑148 (MQ=255) gcagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGc > 4:99196/1‑149 (MQ=255) cagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCatcatc > 1:346812/1‑139 (MQ=255) cagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCatcatc < 2:346812/139‑1 (MQ=255) agACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCAc > 8:269642/1‑149 (MQ=255) | AGGAACACTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCA‑GCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCAC > NC_002947/4912673‑4912964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |