Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,912,822 | C→G | 7.1% | G626A (GGC→GCC) | ccmF ← | holocytochrome c synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,912,822 | 0 | C | G | 7.1% | 224.8 / 5.9 | 70 | G626A (GGC→GCC) | ccmF | holocytochrome c synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/30); new base G (3/2); total (38/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
CTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCACGGTGT > NC_002947/4912680‑4912969 | cTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 2:21335/1‑148 (MQ=255) tGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 8:118432/1‑147 (MQ=255) tGCAAGGGGCACTACCAAGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCACAGGACATCCCGCACCCGGGTCTTGACCTAGCCGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCCACCCGCCCAGGCCGGTCCGCAGACCGCccagcca > 1:350695/1‑149 (MQ=255) aaGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCccagc > 2:342019/1‑144 (MQ=255) ggggCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 6:222287/1‑148 (MQ=255) aCTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 4:128377/1‑143 (MQ=255) aCTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc < 3:128377/143‑1 (MQ=255) aCCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACg > 1:126674/1‑149 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACg < 1:180074/148‑1 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGt < 6:86039/149‑1 (MQ=255) ccATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGt < 2:222942/149‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAcgc > 4:341947/1‑149 (MQ=255) gctCCAGACACGCCTAGGACATCAGGCCCCCGGGGCTTGACCTTTACGCGGTATCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCCCCCAGCCGGGGCAGCTGACCGCCCAGCCAGATCCACCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGc < 2:350695/149‑1 (MQ=255) ctCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAc > 6:220030/1‑139 (MQ=255) ctCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTAc < 5:220030/139‑1 (MQ=255) cAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAg > 3:2750/1‑149 (MQ=255) acacGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcg > 1:72016/1‑149 (MQ=255) cacGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcg < 4:2750/148‑1 (MQ=255) acGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGgcgc > 7:206786/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACCGCCCAGGCGCCAt > 6:9716/1‑149 (MQ=255) aGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATtctc > 3:277235/1‑149 (MQ=255) acctCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGGCAGCAGACCGCCCAGCCCGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAGTATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAg < 8:238831/146‑1 (MQ=255) tCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTgg > 1:41449/1‑149 (MQ=255) cACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCTCCCAGCCAGATc < 3:3187/92‑1 (MQ=255) cACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATc > 4:3187/1‑92 (MQ=255) cGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTc > 6:341017/1‑149 (MQ=255) cGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTc < 5:222287/149‑1 (MQ=255) cACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc < 1:342019/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc > 8:114634/1‑148 (MQ=255) aCCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGc > 2:325430/1‑148 (MQ=255) cGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAg < 2:72016/149‑1 (MQ=255) tgaccttgacGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGATCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACg > 8:36006/1‑149 (MQ=255) ccttgacGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTAc < 8:206786/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCgg < 1:21335/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCgg < 5:47777/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGATCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCgg < 7:36006/149‑1 (MQ=255) gTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTg < 8:86759/119‑1 (MQ=255) gTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTg > 7:86759/1‑119 (MQ=255) tAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGt < 1:325430/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACCTGTACGTcgcgcttg < 2:126674/148‑5 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGCCGTACa > 2:252734/1‑135 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa < 1:252734/135‑1 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa > 2:247658/1‑135 (MQ=255) gcCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACa < 1:247658/135‑1 (MQ=255) ccGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGc > 5:250674/1‑149 (MQ=255) cGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGcc < 3:341947/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAgc < 4:17546/121‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAgc > 3:17546/1‑121 (MQ=255) tCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTcgcg < 5:121579/137‑1 (MQ=255) tCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTcgcg > 6:121579/1‑137 (MQ=255) gggCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGt < 1:349646/147‑1 (MQ=255) gggCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGt > 2:349646/1‑147 (MQ=255) ggCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGa > 7:197769/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGccc < 7:114634/149‑1 (MQ=255) cAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCg > 3:84749/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCg > 6:206114/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACCGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtca > 7:251948/1‑149 (MQ=255) ctgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatca > 8:43734/6‑149 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc > 2:92948/5‑147 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc < 1:97566/143‑1 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc > 2:97566/5‑147 (MQ=255) tgggcGGTCTGCTGACCGGCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGtcatc < 1:92948/143‑1 (MQ=255) cGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGAc < 4:277235/149‑1 (MQ=255) gcagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTg > 4:104128/1‑148 (MQ=255) gcagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGc > 4:99196/1‑149 (MQ=255) cagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCatcatc < 2:346812/139‑1 (MQ=255) cagACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCatcatc > 1:346812/1‑139 (MQ=255) agACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCAc > 8:269642/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCACGgtgt < 4:84749/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCACGgtgt < 7:118432/149‑1 (MQ=255) | CTGCAAGGGGCACTACCATGATCCAACGCTTCATGCAGCTGCTCCAGACACGCCCAGGACATCACGCACCCGGGTCTTGACCTTGACGCGGTAGCGCCGGTCGAGGGCCGCCAGCAACCCGCCCAGGCCGGTCAGCAGACCGCCCAGCCAGATCCAGCGGACGTAAGGCTTAATATGTACGCGCACAGCCCAGGCGCCATTCTCCAGTGGCTCGCCAAGCGCGACGTACAGGTCGCGGGTAAAGCCGGCGTCGATGCCCGCTTCGGTCATCATCGACTGTTGCACGGTGT > NC_002947/4912680‑4912969 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |