Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 29,917 | T→A | 8.0% | intergenic (‑370/+73) | PP_0024 ← / ← PP_0025 | membrane‑associated metal‑dependent hydrolase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 29,917 | 0 | T | A | 8.0% | 201.1 / 5.0 | 71 | intergenic (‑370/+73) | PP_0024/PP_0025 | membrane‑associated metal‑dependent hydrolase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base A (3/3); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACCTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCTTTTTCAAAAACATCC > NC_002947/29771‑30059 | aCCTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTc < 8:178796/149‑1 (MQ=255) ccTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTc < 3:182264/148‑1 (MQ=255) cTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGt > 6:49264/1‑149 (MQ=255) cTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTAACAAACAAAACGGTTTCGt > 7:303700/1‑149 (MQ=255) tCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGtt > 4:106596/1‑149 (MQ=255) gggATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGtttt < 5:138900/149‑1 (MQ=255) gATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGt > 3:98857/1‑149 (MQ=255) aCAATGCTGACACAAATCCAATTACTTCTGTTTTGCTTGTCATTGATCACTCTATTATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGAAACCGTTTTGtttg < 2:315933/148‑4 (MQ=255) cAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTa < 3:106596/148‑1 (MQ=255) cAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAg > 3:215752/1‑149 (MQ=255) aaTGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTAGGGGGAAAACAACCCAC‑CAAAAGCAATGCACCGCTCAGCAAGATAAATTTAATTTAACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTat > 1:285978/1‑148 (MQ=255) agaGATATCCAATTACTTCTTTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGTAATACTACCCAC‑CATAATCATTGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAAtt < 7:162257/146‑1 (MQ=255) aCAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAAttt > 6:313739/1‑149 (MQ=255) aGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCTTATTGTCGTAGGATAAtttt > 4:198419/1‑148 (MQ=255) taTCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACTCTATTATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTACGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGaa < 8:303700/147‑1 (MQ=255) tCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACtt > 1:233009/1‑149 (MQ=255) ccAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACttt < 4:98857/149‑1 (MQ=255) cAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTg < 7:203345/126‑1 (MQ=255) cAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTg > 8:203345/1‑126 (MQ=255) aTTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTttcaa < 5:75061/149‑1 (MQ=255) tgctgTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGAAACCGTTTTGttt > 7:191612/1‑120 (MQ=255) tgctgTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGAAACCGTTTTGttt < 8:191612/122‑3 (MQ=255) ctgTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTATATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTttcaattcaa < 5:269445/147‑1 (MQ=255) ctgTTTTGATTGTCATTGATCACGATATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAAc < 8:196420/148‑1 (MQ=255) ttttGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCACAGAAAGGAAATGCTCCGGTCAGGTAGATAAATTTATTTTAACAAAAAAACGGGTTTCTTTTTGGGGTAGGGTAATTTTGAAGTttaatttcacgtt > 1:94543/1‑144 (MQ=255) ttttGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTa > 2:56235/1‑148 (MQ=255) ttttGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTa > 3:22872/1‑148 (MQ=255) gTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGa > 7:209669/1‑123 (MQ=255) gTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGa < 8:209669/123‑1 (MQ=255) tCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTAACCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCttt < 8:142876/148‑1 (MQ=255) aTTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTtctc > 8:9480/1‑149 (MQ=255) gATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGAAACCGTTTTGttt < 1:317644/103‑3 (MQ=255) gATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGAAACCGTTTTGttt > 2:317644/1‑101 (MQ=255) aTCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTcgc > 7:180165/1‑147 (MQ=255) tCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGaa < 5:157496/116‑1 (MQ=255) tCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGaa > 6:157496/1‑116 (MQ=255) aCGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGc < 4:215752/148‑1 (MQ=255) cTATGATCAAAATTA‑GGGTAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGTAGaa < 5:313739/149‑1 (MQ=255) tCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTcgc > 6:335382/1‑135 (MQ=255) ttA‑GTGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGTCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCaa < 1:56235/149‑1 (MQ=255) a‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAAc < 4:22872/148‑1 (MQ=255) gggAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACttt > 1:104682/1‑149 (MQ=255) gggAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACttt > 7:282856/1‑149 (MQ=255) gggAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACttt < 2:285978/149‑1 (MQ=255) ttaaTACTACCCAC‑CAAATGCAATTCTCCGCTAAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGc < 6:78473/126‑1 (MQ=255) gAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTAc < 6:332544/110‑1 (MQ=255) gAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTAc > 5:332544/1‑110 (MQ=255) tacCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGt > 1:192551/1‑148 (MQ=255) acCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTa > 6:182838/1‑149 (MQ=255) aaaaGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGt > 1:326778/1‑148 (MQ=255) aaaaGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTc < 2:104682/149‑1 (MQ=255) aaGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTg < 5:164167/133‑1 (MQ=255) aaGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTg > 6:164167/1‑133 (MQ=255) gCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCAccc < 2:326778/149‑1 (MQ=255) aaTGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCa > 7:172822/1‑148 (MQ=255) aTGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATc < 8:172822/149‑1 (MQ=255) aTGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATc < 2:233009/149‑1 (MQ=255) cGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGa < 5:49264/148‑1 (MQ=255) gCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAgg < 2:192551/149‑1 (MQ=255) aGCTAGATAAATTTAATTTCACAACAAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAgggg < 3:198419/147‑1 (MQ=255) cTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGaa > 4:177181/1‑149 (MQ=255) cTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGaa < 7:9480/149‑1 (MQ=255) aaaTTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCAt > 7:42228/1‑149 (MQ=255) atttaatttCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGa < 8:180165/149‑1 (MQ=255) tttCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCtttt > 5:101092/1‑149 (MQ=255) tCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGCGCGAATACCATGAGCttttt < 3:83579/148‑1 (MQ=255) tCACAAACAAAACCGTATCTAATTCACGAAGCCAAAATAAGAACATTCAAATCAACATAAAAGAATTTCTACCTAGCAGAAAATAATTTTCAACTATAAATAGAAAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCttttt > 4:83579/1‑148 (MQ=255) cacaAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCTTTTTc < 3:177181/148‑1 (MQ=255) acaaacaaAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCTTTTTCa > 1:265999/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATTAGGGGAGAATACAATGAGCTTTTTAAAAAAAATca > 5:124018/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCTTTTTCAAAAACATcc > 2:178005/1‑149 (MQ=255) | ACCTCGGGATTACAATGCTGACAGAAATCCAATTACTGCTGTTTTGATTGTCATTGATCACGCTATGATCAAAATTA‑GGGGAATACTACCCAC‑CAAAAGCAATGCTCCGCTCAGCTAGATAAATTTAATTTCACAAACAAAACGGTTTCGTTTTGTCGTAGGCTAATTTTGAACTTTCAATTCAACTTACAAGTCTTTCTCGCGAGCAGAACATAATTTTCAACTTTTGCTCGTTAATATGTCACCCATCAATGAGGGGCGAATACCATGAGCTTTTTCAAAAACATCC > NC_002947/29771‑30059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |