Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,753,486 | C→A | 6.4% | intergenic (+47/‑319) | glnA → / → glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,753,486 | 0 | C | A | 6.4% | 197.8 / 3.9 | 62 | intergenic (+47/‑319) | glnA/glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/26); new base A (2/2); total (34/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 |
GACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCT > NC_002947/5753338‑5753632 | gacgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGcctccctc < 1:189141/149‑1 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGcc < 1:34400/148‑1 (MQ=255) cGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtt > 5:180396/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGTAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttt > 1:203141/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGtttt < 5:196422/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttttt < 2:198565/149‑1 (MQ=255) ccTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTg < 7:33074/148‑1 (MQ=255) ccTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGt > 2:152866/1‑149 (MQ=255) cTTCATCGAGGTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGATGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCATAACGGACTCACTCGGGAGGCCGTTTTTGtt > 2:302457/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgcg > 8:180333/1‑149 (MQ=255) gCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCAc < 4:25378/149‑1 (MQ=255) aaGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTg < 6:180396/149‑1 (MQ=255) agCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTg > 6:307092/1‑146 (MQ=255) aagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc < 7:180333/149‑1 (MQ=255) aaTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgc > 4:108260/1‑127 (MQ=255) aaTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgc < 3:108260/127‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGa < 2:323473/149‑1 (MQ=255) aaGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTc < 1:152866/149‑1 (MQ=255) ggTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc < 5:69241/149‑1 (MQ=255) gTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCt < 8:56229/141‑1 (MQ=255) gTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCt > 7:56229/1‑141 (MQ=255) ccGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgcg < 3:4048/119‑1 (MQ=255) ccGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgcg > 4:4048/1‑119 (MQ=255) cTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGGGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCCGTCACGc > 8:151324/1‑149 (MQ=255) cTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGc > 4:47521/1‑149 (MQ=255) ttCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGc > 5:292007/1‑148 (MQ=255) tACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGc > 1:282519/1‑149 (MQ=255) acacCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGct > 2:117148/1‑149 (MQ=255) acCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGctc > 5:104496/1‑148 (MQ=255) aaTACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTg < 6:104496/149‑1 (MQ=255) gcaGCTGTAGTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCAt > 8:304954/3‑148 (MQ=255) tatcggTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATTATCAAAACGGCCTACCTCGGGAGTCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgcc < 6:52724/103‑1 (MQ=255) gAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCATCCCTCGGGAGGCAGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgcc > 5:52724/1‑108 (MQ=255) aGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTaa > 4:222995/1‑149 (MQ=255) tagtacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcac > 4:277513/4‑149 (MQ=255) ctacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcaca < 2:203141/148‑1 (MQ=255) tacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTATTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCacac > 6:172862/1‑148 (MQ=255) aGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATg > 2:229104/1‑149 (MQ=255) ctgctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcaca > 4:311975/1‑142 (MQ=255) ctgctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcaca < 3:311975/142‑1 (MQ=255) ctgctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGcc < 5:307092/149‑1 (MQ=255) ctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcaca < 4:295028/134‑1 (MQ=255) ctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcaca > 3:295028/1‑134 (MQ=255) gatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt > 6:194629/1‑149 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGGGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCCGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt < 7:151324/148‑1 (MQ=255) cTCGCGCCGATGACGAGCTCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCt < 1:302457/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTg > 8:79601/1‑149 (MQ=255) gcgcCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTgg < 5:194629/148‑1 (MQ=255) gcgcCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGt > 4:168133/1‑149 (MQ=255) gATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAgg < 1:229104/149‑1 (MQ=255) aCATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTca > 1:28175/1‑109 (MQ=255) aCATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTca < 2:28175/109‑1 (MQ=255) aCATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTa < 7:79601/148‑1 (MQ=255) aCATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTa > 7:234181/1‑148 (MQ=255) cATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCCCCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTaaa > 1:220528/1‑149 (MQ=255) gATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACAACATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGt > 5:122803/1‑149 (MQ=255) acaaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGtt > 7:123733/4‑149 (MQ=255) aTCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGtt > 7:33415/1‑149 (MQ=255) aTCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGt < 6:122803/148‑1 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCAt > 5:218045/1‑106 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCAt < 6:218045/106‑1 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCacac < 5:282385/103‑1 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCacac > 6:282385/1‑103 (MQ=255) ctccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCAATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACt > 1:286982/1‑149 (MQ=255) tccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAAt < 6:65078/107‑1 (MQ=255) tccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAAt > 5:65078/1‑107 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc > 7:286141/1‑149 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 2:286982/149‑1 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGGTAAACGTTTCACCAAGACTTTc > 7:331910/1‑149 (MQ=255) tcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCt > 6:38974/1‑148 (MQ=255) | GACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCT > NC_002947/5753338‑5753632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |