Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,958,935 | A→G | 5.5% | Q780R (CAA→CGA) | cyaA → | adenylate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,958,935 | 0 | A | G | 5.5% | 214.1 / 2.0 | 73 | Q780R (CAA→CGA) | cyaA | adenylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/33); new base G (2/2); total (38/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 |
CGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCC > NC_002947/5958788‑5959082 | cGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGcaa < 3:279021/149‑1 (MQ=255) cTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCt > 6:139613/1‑149 (MQ=255) cTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCt > 7:248542/1‑149 (MQ=255) gATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGc < 1:11832/148‑1 (MQ=255) gCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCt > 5:163987/1‑149 (MQ=255) cAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTg > 6:171815/1‑148 (MQ=255) cAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTg > 1:242792/1‑148 (MQ=255) cAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGc < 8:136886/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCAt < 6:163987/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCAt > 7:267910/1‑144 (MQ=255) cTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCAt < 8:267910/144‑1 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGGGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACg > 7:69068/1‑147 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCGGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCATCAACGCCTGGCGCTGCATGACg > 4:58118/1‑147 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACg > 5:299963/1‑147 (MQ=255) cAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAgc < 5:155718/149‑1 (MQ=255) ggATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAgcg > 3:261232/1‑148 (MQ=255) cACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATct > 7:249520/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATctgc > 2:172639/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATctgc > 2:264749/1‑149 (MQ=255) cgcCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGc < 5:171815/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCAc < 4:4477/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCAc > 7:233532/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGcaac < 7:115440/106‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGcaac > 8:115440/1‑106 (MQ=255) gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTg < 6:299963/147‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGc < 8:233532/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAAc < 5:139613/148‑1 (MQ=255) ccggccAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCt < 3:314378/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCggtg < 1:264749/149‑1 (MQ=255) aGCCTGTTTTCTGGTGTTGTAGCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATAGAACGCATTGTGGCAACAACGTGTTCGGCTGCATGTCGAAGCGAATCTGCTGTTGCCACTGCAACGGTTTGTGCGCTGggtgg < 2:301515/149‑1 (MQ=255) ccTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCCGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGgtggtg < 8:248542/149‑1 (MQ=255) tATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATg < 1:172639/148‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt < 6:361219/129‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt > 5:361219/1‑129 (MQ=255) gtgtTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGa > 8:143949/1‑149 (MQ=255) cTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCAc > 1:243455/1‑149 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACATCGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCaa < 1:255677/111‑1 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCaa > 2:255677/1‑111 (MQ=255) aCCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATc < 3:98488/93‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATc > 4:98488/1‑93 (MQ=255) aCCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGAGCCGCGATGCACg > 2:343647/1‑148 (MQ=255) ccGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCAc < 2:243455/146‑1 (MQ=255) ccTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt > 5:38772/1‑114 (MQ=255) ccTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt < 6:38772/114‑1 (MQ=255) gggCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTc > 8:6403/1‑148 (MQ=255) gCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCg < 8:249520/149‑1 (MQ=255) aCGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGccc < 4:261232/149‑1 (MQ=255) cGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCg < 2:238875/149‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGc < 3:150462/119‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGc > 4:150462/1‑119 (MQ=255) aTGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCg > 3:2710/1‑149 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCGACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc > 8:184540/1‑148 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCGACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc > 8:189763/1‑148 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCGACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc < 7:184540/148‑1 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCGACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc < 7:189763/148‑1 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc < 7:337800/146‑1 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc > 8:337800/1‑146 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCt > 7:127737/1‑149 (MQ=255) tgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCt < 8:69068/148‑1 (MQ=255) aTACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACt > 4:350485/1‑149 (MQ=255) aTACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACt > 6:79340/1‑149 (MQ=255) aTACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACt > 8:239726/1‑149 (MQ=255) tACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCACCTCGCTGGATATCCACtt > 2:121386/1‑149 (MQ=255) aaCGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccg < 2:294832/92‑1 (MQ=255) aaCGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccg > 1:294832/1‑92 (MQ=255) aaCGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgc < 7:143949/149‑1 (MQ=255) aaCGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgc > 6:333473/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGc > 1:341261/1‑149 (MQ=255) tgtgGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCt < 7:6403/148‑1 (MQ=255) tgGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGtt > 2:242148/1‑149 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTTCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACTCTTTCTGCGCTCGGTTGTGATGCGCCGCGATGAACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg < 3:300350/139‑1 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCggtg < 3:82292/70‑1 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCggtg > 4:82292/1‑70 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGc < 5:79340/149‑1 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGc < 4:2710/149‑1 (MQ=255) gCAACAACGCCTGCCGCTGCATCACGAACCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGACGCGATGCACGCCTGCACCTCGATAGCATGCGGCACGCATAGCTGGAAATCCACTACCCGCacatcgca > 4:300350/1‑141 (MQ=255) aacaacGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGcc > 6:212019/1‑148 (MQ=255) | CGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCC > NC_002947/5958788‑5959082 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |