Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,014,998 | A→G | 5.6% | M256T (ATG→ACG) | PP_5266 ← | acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,014,998 | 0 | A | G | 5.6% | 208.2 / 2.3 | 71 | M256T (ATG→ACG) | PP_5266 | acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/34); new base G (2/2); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
TACAAGCCGTGGGTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCGAAGGC > NC_002947/6014854‑6015146 | tccatgtcGTGGGTACTGGTGTCCGCGCCCCCTGCTCGCTCGATCACCGCCTGCCACGGTGCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCTGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGc < 8:253515/142‑1 (MQ=255) tACAAGCCGTGGGTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATgg > 2:248030/1‑148 (MQ=255) gCCGTGGGTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCaa < 1:248030/149‑1 (MQ=255) tGGGTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGcc < 7:94403/149‑1 (MQ=255) ggTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCATCGCTTTCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGACCTGACGTGCCAGCAATGCCTCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGa < 5:239283/149‑1 (MQ=255) gTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGAt > 1:248048/1‑149 (MQ=255) ggTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCa < 3:113169/149‑1 (MQ=255) gtgtCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAg > 4:298279/1‑149 (MQ=255) aGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTgcc > 3:175323/1‑149 (MQ=255) cccTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGt > 2:343142/1‑149 (MQ=255) cTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCa < 2:248048/149‑1 (MQ=255) ctcgctcgATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCACCGTCACg < 6:53987/148‑1 (MQ=255) gctcgATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCAc > 5:236933/1‑148 (MQ=255) gATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAgg < 2:218632/148‑1 (MQ=255) gATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGgc > 1:173020/1‑149 (MQ=255) aTCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGgct > 3:350888/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGctgctg > 3:141486/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGctgctg > 1:307563/1‑149 (MQ=255) gCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCa < 5:186212/132‑1 (MQ=255) gCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCa > 6:186212/1‑132 (MQ=255) cTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGt > 4:347427/1‑149 (MQ=255) ccACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTg > 3:282894/1‑147 (MQ=255) cACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAg < 4:141486/149‑1 (MQ=255) cGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGc < 2:357026/149‑1 (MQ=255) tCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGa > 7:28747/1‑149 (MQ=255) cGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg < 4:282894/149‑1 (MQ=255) cGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg > 1:222001/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg > 2:50654/1‑147 (MQ=255) aGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCGTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg > 8:38943/1‑141 (MQ=255) aGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCGTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg < 7:33378/141‑1 (MQ=255) aGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCGTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg < 7:38943/141‑1 (MQ=255) aGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCGTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATg > 8:33378/1‑141 (MQ=255) gcgcCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTcc < 1:343142/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTcc > 4:54616/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTg > 3:22901/1‑148 (MQ=255) gAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCTCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGGCGATGCAGTGGTCCTGAATg < 2:307563/148‑1 (MQ=255) aGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGc < 2:222001/148‑1 (MQ=255) ccGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAAcc < 3:54616/149‑1 (MQ=255) ccGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAAcc < 4:350888/149‑1 (MQ=255) cGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAAt > 4:185631/1‑141 (MQ=255) cGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAAt < 3:185631/141‑1 (MQ=255) cGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCg > 6:305972/1‑149 (MQ=255) cGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCg > 5:367734/1‑149 (MQ=255) gCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCgg < 2:173020/149‑1 (MQ=255) aCGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCa > 1:247958/1‑149 (MQ=255) cGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCAt < 1:50654/149‑1 (MQ=255) gTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGt > 7:227384/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGgt > 1:276176/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGgt > 7:292077/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGgtg > 5:66434/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGgtgt < 3:347427/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGgtgt < 8:292077/149‑1 (MQ=255) gCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACa < 8:227384/149‑1 (MQ=255) cccTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAg < 2:276176/149‑1 (MQ=255) cTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGcc < 6:236933/149‑1 (MQ=255) gACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGa > 5:88389/1‑149 (MQ=255) aCGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGa < 4:175323/148‑1 (MQ=255) ccAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGc > 3:298627/1‑149 (MQ=255) aGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTc < 6:367734/149‑1 (MQ=255) gCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGaaaa > 7:134302/1‑133 (MQ=255) gCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGaaaa < 8:134302/133‑1 (MQ=255) gCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTc > 2:342175/1‑148 (MQ=255) aaTGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGAc < 4:298627/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACt < 2:247958/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCa > 8:237675/1‑149 (MQ=255) ggCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGt < 4:277929/110‑1 (MQ=255) ggCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGt > 3:277929/1‑110 (MQ=255) gCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAGCCCGCCGCCGTTGCTCGACTTCATCgcg > 8:277996/1‑147 (MQ=255) ccGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGagcagc < 4:22901/149‑1 (MQ=255) cccATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCGaa < 6:66434/149‑1 (MQ=255) ccaaTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCg > 8:108450/4‑147 (MQ=255) ccATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCGAAg < 1:342175/149‑1 (MQ=255) aTGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGAGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCGAAGGc < 8:28747/149‑1 (MQ=255) | TACAAGCCGTGGGTAAGGGTGTCCAGGCCCCCTTCTCGCTCGATCAACGCCTGCCACGGTCCGACATCCAGCGCCTTGAGCACCGCACGGTAACCGGCGTTGTCGCCCTGACGTGCCAGCAATGCCGCGGCAACCGCATCGCCCATGGCACCAATGCCGATCTGCAGGGTGCCGCCGTCACGCACCAGGCTGCTGGCGTGCAGGCCGATGCAGTGGTCCTGAATGCCAACCGGCATGTTTGGTGTGGAAAACAGCCGACGTTGCTCGACTTCATCGAGCAGCAGGTCGAAGGC > NC_002947/6014854‑6015146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |