| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,072,218 | T→A | 6.5% | I103F (ATC→TTC) | pstB‑II ← | phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,072,218 | 0 | T | A | 6.5% | 180.4 / 2.4 | 62 | I103F (ATC→TTC) | pstB‑II | phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/26); new base A (2/2); total (33/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
ATCGAGCACGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCATCTGC > NC_002947/6072072‑6072366 | aTCGAGCACGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGatat < 5:211600/149‑1 (MQ=255)aTCGAGCACGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGatat > 7:111980/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGcc > 1:198453/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGcc < 2:198453/149‑1 (MQ=255) aCGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGcc > 7:155120/1‑149 (MQ=255) gcTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCGGTa > 4:22319/1‑148 (MQ=255) ttgttgATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGAAATTGTTGCCGTACAGGtt > 6:38071/1‑149 (MQ=255) gttgATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGtt < 8:155120/147‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACCCCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATga > 7:129569/1‑148 (MQ=255) gATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGAt < 6:92907/147‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGAt > 5:92907/1‑147 (MQ=255) gATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGAt < 8:129569/147‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATgg > 2:61771/1‑149 (MQ=255) aTGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCGATAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTATGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGAATTTCGGCAACGTGTTC‑GCCGTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATgg > 1:58373/1‑149 (MQ=255) acccTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCAc > 6:288036/2‑149 (MQ=255) cccTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCAc < 7:268279/148‑1 (MQ=255) gATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTc < 2:58373/147‑1 (MQ=255) cgcAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCacac < 5:288036/148‑1 (MQ=255) cgcAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACg < 7:193950/149‑1 (MQ=255) cgcAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGACATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACg > 5:321569/1‑149 (MQ=255) ggCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGGTAACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGc > 1:273452/1‑148 (MQ=255) gCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAAc < 1:196876/149‑1 (MQ=255) aCCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAAc < 1:61771/149‑1 (MQ=255) aCCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGAAATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAAc < 5:38071/149‑1 (MQ=255) tGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCgg > 7:257606/1‑149 (MQ=255) cTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTg > 3:114354/1‑148 (MQ=255) ttGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTg > 1:231596/1‑147 (MQ=255) ggAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGAATTTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGt < 1:286723/141‑1 (MQ=255) ggAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGAAATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGt > 2:286723/1‑141 (MQ=255) cGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgca < 8:111980/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTCGGCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgcag > 1:98705/1‑148 (MQ=255) gTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgcag > 8:187005/1‑147 (MQ=255) gTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgcag > 2:340921/1‑147 (MQ=255) ctatctcTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgcagc < 7:257888/142‑1 (MQ=255) ggCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGt < 7:187005/149‑1 (MQ=255) cTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCg < 2:231596/149‑1 (MQ=255) ttCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCgcagc > 8:257888/1‑141 (MQ=255) aaCACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACtt < 1:162073/146‑1 (MQ=255) aaCACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACtt > 2:162073/1‑146 (MQ=255) ccATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAg > 3:239834/1‑149 (MQ=255) cATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGc < 4:239834/149‑1 (MQ=255) ccACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGACATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGAt < 6:321569/149‑1 (MQ=255) cacaCGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAACGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATg > 3:231549/1‑149 (MQ=255) acacGCCGGTGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGGCGACTTGCCGCAGCCGGATgg > 8:60328/1‑149 (MQ=255) acacGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATgg > 8:134335/1‑149 (MQ=255) acGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGc > 5:61939/1‑149 (MQ=255) acGCCGGCGCAGTTCGGCAACGACTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGc > 7:104570/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGa < 1:340921/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGa < 6:61939/149‑1 (MQ=255) cGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGAt < 4:114354/149‑1 (MQ=255) aGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGc < 7:134335/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCg > 5:120598/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCgg < 8:257606/149‑1 (MQ=255) gCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCAc > 6:175331/1‑149 (MQ=255) tCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCgctg < 5:175331/149‑1 (MQ=255) cccTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCgg > 4:131615/1‑149 (MQ=255) cccTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCgg > 5:154453/1‑149 (MQ=255) gCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGAt < 2:98705/147‑1 (MQ=255) gCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATg < 2:273452/148‑1 (MQ=255) ggTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGtt > 7:95288/1‑148 (MQ=255) tAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAgg < 6:28841/121‑1 (MQ=255) tAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAgg > 5:28841/1‑121 (MQ=255) tAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCAt > 6:47695/1‑149 (MQ=255) tAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCAt < 7:60328/149‑1 (MQ=255) atatTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCATCTg > 8:67966/1‑149 (MQ=255) tatTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCATCTg > 1:347141/1‑148 (MQ=255) tatTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCATCTGc < 6:154453/149‑1 (MQ=255) | ATCGAGCACGCGCTTCTTGTTGATGCCCTGGATGCGCAGGCCGTAGACCACGTTCTCG‑TAGATGGTCTTGGGGAACGGGTTCGGCTTCTGG‑AACACCATGCCCACACGCCGGCGCAGTTCGGCAACGTCTTC‑GCCCTTGCGGTAGATATTGTTGCCGTACAGGTTGATGGCACCTTCCACACGGCAACCGTCAACCAAGTCGTTCATCCGGTTGAAGGTGCGCAGCAGGGTCGACTTGCCGCAGCCGGATGGGCCGATGAAGGCGGTCACGCGCTGCTTCGGGATGTTCATCTGC > NC_002947/6072072‑6072366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |