Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,073,444 | G→A | 13.6% | P271L (CCA→CTA) ‡ | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,073,444 | 0 | G | A | 13.6% | 164.7 / 14.2 | 66 | P271L (CCA→CTA) ‡ | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/30); new base A (5/4); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.21e-01 |
CGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAG > NC_002947/6073298‑6073583 | cGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGc > 2:146565/1‑149 (MQ=255) aTGATCAGGGGCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAAc < 6:279465/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACgg < 1:146565/148‑1 (MQ=255) tCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGGTGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCa > 1:183574/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGGTGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCa > 1:189448/1‑149 (MQ=255) aGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATg < 5:35866/149‑1 (MQ=255) gTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACg > 4:288466/1‑141 (MQ=255) gTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACg < 3:288466/141‑1 (MQ=255) catcatcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGTCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTCAGCCAAACGGCATgtcggc < 7:282269/149‑6 (MQ=255) cGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCTCGCGGGTCGTCTCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGGGCCCAACTTGGTGAACGACGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTc < 8:85272/149‑1 (MQ=255) ccGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGt < 3:234962/148‑1 (MQ=255) cGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATg > 7:168706/1‑130 (MQ=255) cGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATg < 8:168706/130‑1 (MQ=255) ggCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAgg > 2:168354/1‑139 (MQ=255) ggCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAgg < 1:168354/139‑1 (MQ=255) ggAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTcn < 2:189448/149‑2 (MQ=255) ggAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCa < 2:183574/149‑1 (MQ=255) tACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCg > 1:311465/1‑149 (MQ=255) cGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTg < 6:314360/149‑1 (MQ=255) gCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGc > 4:272312/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCAt < 2:311465/149‑1 (MQ=255) tgtTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 6:241331/149‑1 (MQ=255) tgtTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 2:51190/149‑1 (MQ=255) ggCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACgg < 8:159350/130‑1 (MQ=255) ggCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACgg > 7:159350/1‑130 (MQ=255) ggCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGcca > 6:8134/1‑149 (MQ=255) ttCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGt > 1:78746/1‑110 (MQ=255) ttCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGt < 2:78746/110‑1 (MQ=255) cACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGAt > 4:208906/1‑112 (MQ=255) cACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGAt < 3:208906/112‑1 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 2:95043/1‑149 (MQ=255) tcgCTGAGGAACTCCCAGACATTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGAATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCAGTTGCCATACCCGGCCACCAGGCTGTAGCggg > 4:293329/1‑148 (MQ=255) cTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACt < 7:259136/81‑1 (MQ=255) cTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACt > 8:259136/1‑81 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 8:274481/1‑149 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 2:34107/1‑149 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt < 7:274481/149‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 6:246645/1‑149 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGc < 5:246645/148‑1 (MQ=255) gACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 3:142690/1‑141 (MQ=255) gACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 4:142690/141‑1 (MQ=255) gACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGc < 1:95043/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCg < 5:8134/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGATAAAGCCTGGTGCAGGCCgg > 7:228089/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg < 1:161911/133‑1 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTg > 2:161911/1‑133 (MQ=255) aaGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTAACTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCg < 8:117058/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGcc < 1:34107/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTCAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGcc > 1:31235/1‑149 (MQ=255) gTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTg > 7:162601/1‑147 (MQ=255) ccGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCa > 5:70722/1‑111 (MQ=255) ccGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCa < 6:70722/111‑1 (MQ=255) gtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 4:9866/91‑1 (MQ=38) gtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg > 3:9866/4‑94 (MQ=38) gtgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGt > 8:31343/4‑149 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCg > 4:11687/1‑143 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCg < 3:11687/143‑1 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCg < 3:6634/143‑1 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCg > 4:6634/1‑143 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 3:272312/149‑1 (MQ=255) aCATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 4:275099/1‑148 (MQ=255) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt > 6:20444/1‑86 (MQ=38) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt < 5:15272/86‑1 (MQ=38) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt < 5:20444/86‑1 (MQ=38) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGt > 6:15272/1‑86 (MQ=38) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg > 3:262028/1‑149 (MQ=255) | CGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAG > NC_002947/6073298‑6073583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |