Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,075,747 | G→C | 6.9% | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 ← | phosphate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,075,747 | 0 | G | C | 6.9% | 214.5 / 3.5 | 69 | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/34); new base C (2/3); total (32/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCAC > NC_002947/6075606‑6075895 | aGCCCCCCCTAGGAGTCACCGATGATCAGCGAAAAGCCGCCAACCAGCTCCGCCGTCGCAGAAAATTCGGTCTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCCGCCTGACAACTTCCTCCGTGTCAC‑Gccc > 8:326981/1‑149 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGGTCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGtt < 3:308513/149‑1 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCATCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGGGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGtt < 3:16405/149‑1 (MQ=255) ccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGAt < 1:98411/149‑1 (MQ=255) ccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGAt > 7:56048/1‑148 (MQ=255) cTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAC‑GGCCgacgtgtt < 2:315150/149‑8 (MQ=255) ccGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGt < 5:44896/133‑1 (MQ=255) ccGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGt > 6:44896/1‑133 (MQ=255) cGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGc > 4:352617/1‑146 (MQ=255) cGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGc < 3:352617/146‑1 (MQ=255) aGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTg > 5:183168/1‑146 (MQ=255) aGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTg < 6:183168/146‑1 (MQ=255) aGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGc < 8:174577/148‑1 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGt > 6:73023/1‑149 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGt < 4:311102/149‑1 (MQ=255) cGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACCACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGGACAGCCAGTGCTGGCGTg < 7:164620/149‑1 (MQ=255) cGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTg > 8:81338/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAATAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGt < 3:212719/149‑1 (MQ=255) ccgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGAt < 7:155043/149‑1 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAC‑GGCCga > 2:62427/1‑113 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAC‑GGCCga < 1:62427/114‑2 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGa < 7:65547/149‑1 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAC‑GGCCga < 4:323746/113‑2 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAC‑GGCCga > 3:323746/1‑112 (MQ=255) ccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGtt > 5:172644/1‑113 (MQ=255) ccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGtt < 6:172644/113‑1 (MQ=255) ccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGa > 6:44193/1‑145 (MQ=255) ccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGa < 5:44193/145‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAttcttc < 8:56048/148‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGGCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAttctt < 6:262179/147‑1 (MQ=255) gCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCAGTGGAAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc < 7:326981/149‑1 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCg < 2:188493/124‑1 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCg > 1:188493/1‑124 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAAAACGTCGGCCGTGGAAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTAGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCgg > 7:275731/1‑149 (MQ=255) gTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGt > 3:191164/1‑149 (MQ=255) tAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGt > 3:160042/1‑148 (MQ=255) tctgtgtCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTATTGTCGCGAAGTCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGTTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAttt < 1:169857/145‑1 (MQ=255) ggTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCg > 1:198206/1‑149 (MQ=255) ggCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGt > 5:203043/1‑148 (MQ=255) cgcTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCg < 5:73023/149‑1 (MQ=255) tCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATg < 6:203043/147‑1 (MQ=255) ttGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTTATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc > 4:135577/1‑149 (MQ=255) gTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCgg > 4:57920/1‑149 (MQ=255) tAACGT‑CCGTGGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTGCTGCTCggt < 8:275731/149‑1 (MQ=255) aaCGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCg < 8:8526/136‑1 (MQ=255) aaCGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCg > 7:8526/1‑136 (MQ=255) aCGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtg > 1:89477/1‑149 (MQ=255) aCGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtgg > 4:310544/1‑149 (MQ=255) aCGG‑CCGGTGAGGCGCTTGTCGCGCACGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGGACAGCCAGGGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAGTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtgg < 6:36001/149‑1 (MQ=255) gg‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtggt > 7:58181/1‑148 (MQ=255) ccGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGAc < 4:160042/149‑1 (MQ=255) ccGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGAc < 8:58181/149‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTc > 8:83282/1‑149 (MQ=255) ggCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCg < 1:140875/149‑1 (MQ=255) gCTCGTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCCA‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCGGGCGTGGGTCGATGCAGATATTCTTCACCGTCTCGGGCATTTGCGGCAGTGCGCTGCGGGTCTGCTCGGTGGTGACctcggcgg > 6:63258/1‑144 (MQ=255) ctctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt < 7:81338/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGt > 3:54180/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGtt > 5:332391/1‑149 (MQ=255) aGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTc < 4:191164/149‑1 (MQ=255) tGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTcc < 6:6818/146‑1 (MQ=255) tGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTcc > 5:6818/1‑146 (MQ=255) acacGTCGGCCTTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgg < 5:63258/149‑1 (MQ=255) acacGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGTTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGc > 2:338680/1‑147 (MQ=255) acacGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGTTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGc < 1:338680/147‑1 (MQ=255) acacGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgg < 3:57920/149‑1 (MQ=255) cacGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCggg > 8:79983/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGc < 8:189072/148‑1 (MQ=255) gTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGac > 7:235740/1‑149 (MQ=255) gTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGT‑GGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGacc > 6:253635/1‑149 (MQ=255) gCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGaccac < 2:89477/149‑1 (MQ=255) | AGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGG‑CCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCAC‑GGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCAC > NC_002947/6075606‑6075895 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |