| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,706 | G→C | 7.8% | L39V (CTC→GTC) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,706 | 0 | G | C | 7.8% | 193.1 / 6.4 | 64 | L39V (CTC→GTC) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/28); new base C (3/2); total (34/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
TTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGC > NC_002947/1558‑1849 | ttGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 3:96477/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGt < 4:96605/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCg < 1:350237/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCACGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCg < 2:82399/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt < 8:291487/149‑1 (MQ=255) gcagcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt > 4:230679/1‑148 (MQ=255) cagcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATca < 4:146240/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccg > 5:302599/1‑145 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcag > 7:66583/1‑147 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcag > 1:264934/1‑147 (MQ=255) aaCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgcag < 6:302599/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGaca < 1:52556/148‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGaca < 2:264934/148‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGaca > 2:52556/1‑148 (MQ=255) aaGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGTCCTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGgcaac < 1:285606/149‑3 (MQ=255) aGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacga > 6:260839/1‑149 (MQ=255) ccTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacgacg < 7:239860/149‑1 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCTAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGa < 5:266404/124‑1 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGa > 6:266404/1‑124 (MQ=255) aTAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggc > 7:255857/1‑149 (MQ=255) tGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc > 7:8219/1‑146 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 2:177905/1‑148 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 3:319526/1‑148 (MQ=255) aaGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGTATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGAt < 6:230541/149‑1 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAg < 8:8219/148‑1 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc < 3:323360/133‑1 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc > 4:323360/1‑133 (MQ=255) cTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtgg < 3:230679/149‑1 (MQ=255) ccccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 6:209534/149‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 7:70680/148‑1 (MQ=255) cGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACTG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggt < 3:275622/142‑1 (MQ=255) cGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACTG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggt > 4:275622/1‑142 (MQ=255) aGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc < 8:66583/148‑1 (MQ=255) gTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCacac > 7:63991/1‑149 (MQ=255) aGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACaccacc < 8:63991/148‑1 (MQ=255) aCCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCtt > 2:153840/1‑148 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc < 8:255857/149‑1 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCt > 1:356438/1‑149 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCt > 7:266811/1‑149 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGAGCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 5:51824/149‑1 (MQ=255) aaTGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGACTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCg < 1:59610/66‑1 (MQ=255) aaTGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCg > 2:59610/1‑65 (MQ=255) tCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgc > 6:276062/1‑149 (MQ=255) gCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg < 8:176280/81‑1 (MQ=255) gCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg > 7:176280/1‑81 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc < 5:260839/147‑1 (MQ=255) cacaCCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 3:24281/148‑1 (MQ=255) cacaCCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg > 7:17092/1‑149 (MQ=255) cacaCCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCATGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTTTg > 6:38661/1‑126 (MQ=255) acacCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 7:44791/1‑149 (MQ=255) acCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCa > 7:189803/1‑149 (MQ=255) cG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 1:98526/1‑149 (MQ=255) cG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 1:94012/1‑149 (MQ=255) gcagcggtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 4:311847/6‑149 (MQ=255) cccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttgttg < 4:319526/148‑1 (MQ=255) ccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 3:202557/1‑148 (MQ=255) gtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgtgt < 1:153840/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTcc < 5:276062/149‑1 (MQ=255) tgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGt > 7:281465/4‑149 (MQ=255) ctgctgATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATATAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 1:225422/1‑149 (MQ=255) tGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGc > 6:316378/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgc > 4:51296/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGAAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgc > 1:233940/1‑149 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa < 6:10654/136‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa > 5:10654/1‑136 (MQ=255) | TTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCG‑CTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGC > NC_002947/1558‑1849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |